水稻功能性插入缺失标记（InDel）的筛选与应用

王钰,马卉,许学,秦瑞英,杨剑波,汪秀峰

Screening and Application of Functional Insertion-Deletion Markers (InDel) in Rice

Yu Wang,Hui Ma,Xue Xu,Ruiying Qin,Jianbo Yang,Xiufeng Wang

表1 供试水稻品种的名称、类型及类群

Table 1 Name, type and group of rice varieties for testing

编号 Number 品种 Variety 类型 Type 类群 Group 编号 Number 品种 Variety 类型 Type 类群 Group 编号 Number 品种 Variety 类型 Type 类群 Group 1 绍糯9714 常规种/亲本 ⅡA 50 恢52 常规种/亲本 ⅠA 99 沪恢6号 常规种/亲本 ⅠA 2 高科1号 常规种/亲本 ⅠA 51 密阳46 常规种/亲本 ⅠB 100 cp120 常规种/亲本 ⅠA 3 泸香658 常规种/亲本 ⅠA 52 9311 常规种/亲本 ⅠA 101 恢527 常规种/亲本 ⅠA 4 德香4103 常规种/亲本 ⅠA 53 RH003 常规种/亲本 ⅠA 102 898 常规种/亲本 ⅠA 5 浙农34 常规种/亲本 ⅠA 54 ZH128 常规种/亲本 ⅠA 103 盐559 常规种/亲本 ⅠA 6 中嘉早17 常规种/亲本 ⅠA 55 红98 常规种/亲本 ⅠA 104 零57 常规种/亲本 ⅠA 7 嘉兴8号 常规种/亲本 ⅠA 56 R6547 常规种/亲本 ⅠA 105 明63 常规种/亲本 ⅠA 8 镇稻15 常规种/亲本 ⅠA 57 R118 常规种/亲本 ⅠA 106 IR50迟穗 常规种/亲本 ⅠA 9 淮稻12 常规种/亲本 ⅠA 58 安香2号 常规种/亲本 ⅠA 107 杨6无芒 常规种/亲本 ⅠA 10 皖稻68 常规种/亲本 ⅠA 59 川香6号 常规种/亲本 ⅠA 108 特青 常规种/亲本 ⅡA 11 黄糯2号 常规种/亲本 ⅠA 60 明恢100 常规种/亲本 ⅠA 109 成恢448 常规种/亲本 ⅠA 12 皖垦糯1号 常规种/亲本 ⅠA 61 明恢77 常规种/亲本 ⅠA 110 镇江084 常规种/亲本 ⅠA 13 中优838 常规种/亲本 ⅠA 62 黥香恢788 常规种/亲本 ⅠA 111 培矮64 常规种/亲本 ⅠA 14 皖稻197 常规种/亲本 ⅠA 63 测64 常规种/亲本 ⅠA 112 Li7954 常规种/亲本 ⅠA 15 嘉育253 常规种/亲本 ⅠA 64 创丰占 常规种/亲本 ⅠA 113 万恢88 常规种/亲本 ⅠA 16 新强8号 常规种/亲本 ⅠA 65 奉化占 常规种/亲本 ⅠA 114 R602 常规种/亲本 ⅠA 17 五山丝苗 常规种/亲本 ⅠA 66 丰美占 常规种/亲本 ⅠA 115 Liu3149 常规种/亲本 ⅠA 18 粳糯4921 常规种/亲本 ⅠA 67 广香籼 常规种/亲本 ⅠA 116 明恢1273 常规种/亲本 ⅠA 19 竹舟5号 常规种/亲本 ⅠA 68 黄华占 常规种/亲本 ⅠA 117 m125 常规种/亲本 ⅠA 20 早籼65 常规种/亲本 ⅠA 69 皖籼316 常规种/亲本 ⅠA 118 R-725 常规种/亲本 ⅠA 21 绿稻24 常规种/亲本 ⅡA 70 早籼14 常规种/亲本 ⅠA 119 南京16 常规种/亲本 ⅠA 22 金奉19 常规种/亲本 ⅡA 71 皖稻89 常规种/亲本 ⅠA 120 中香1号 常规种/亲本 ⅠA 23 皖稻113 常规种/亲本 ⅠA 72 中籼898 常规种/亲本 ⅠA 121 粤航1号 常规种/亲本 ⅠA 24 安选6号 常规种/亲本 ⅠA 73 中籼352 常规种/亲本 ⅠA 122 R1846 常规种/亲本 ⅠA 25 早籼15 常规种/亲本 ⅠA 74 盐稻8号 常规种/亲本 ⅠA 123 N456 常规种/亲本 ⅠA 26 皖稻141 常规种/亲本 ⅠA 75 泰国籼 常规种/亲本 ⅡA 124 R-11 常规种/亲本 ⅠA 27 丰优58 常规种/亲本 ⅠA 76 中香6号 常规种/亲本 ⅠA 125 海南常规稻 常规种/亲本 ⅠA 28 皖稻173 常规种/亲本 ⅠA 77 3263 常规种/亲本 ⅠA 126 肖37878 常规种/亲本 ⅠA 29 W262 常规种/亲本 ⅠA 78 镇籼96 常规种/亲本 ⅠA 127 KL90（童） 常规种/亲本 ⅠA 30 皖稻84 常规种/亲本 ⅠA 79 C4115 常规种/亲本 ⅠA 128 Liu矮 常规种/亲本 ⅠA 31 绿旱1号 常规种/亲本 ⅠA 80 NIJR05 常规种/亲本 ⅡA 129 创优2号 常规种/亲本 ⅠA 32 滁9507 常规种/亲本 ⅠA 81 武运粳14 常规种/亲本 ⅡA 130 IR24（尹） 常规种/亲本 ⅠA 33 川农1号 常规种/亲本 ⅠA 82 凡7 常规种/亲本 ⅡA 131 CO39（尹） 常规种/亲本 ⅠA 34 协优009 常规种/亲本 ⅠA 83 R18 常规种/亲本 ⅡA 132 明86（夏） 常规种/亲本 ⅠA 35 R96-2 常规种/亲本 ⅠA 84 C418 常规种/亲本 ⅠA 133 丰华占 常规种/亲本 ⅠA 36 丰优188 常规种/亲本 ⅠA 85 HP121 常规种/亲本 ⅠA 134 明恢86 常规种/亲本 ⅠA 37 中早33 常规种/亲本 ⅠA 86 皖恢9号 常规种/亲本 ⅠA 135 五色黑米 常规种/亲本 ⅠA 38 安育早1号 常规种/亲本 ⅠA 87 7NP285 常规种/亲本 ⅡA 136 五色红米 常规种/亲本 ⅠA 39 早籼2430 常规种/亲本 ⅡA 88 XH022 常规种/亲本 ⅡA 137 红香米 常规种/亲本 ⅠA 40 中籼2503 常规种/亲本 ⅠA 89 M1148 常规种/亲本 ⅡA 138 红米 常规种/亲本 ⅠA 41 天香58 常规种/亲本 ⅠA 90 粤B 常规种/亲本 ⅡA 139 红米早籼 常规种/亲本 ⅠA 42 天协13 常规种/亲本 ⅠA 91 R18选 常规种/亲本 ⅡA 140 镇籼122 常规种/亲本 ⅠA 43 晚粳22 常规种/亲本 ⅠA 92 52 常规种/亲本 ⅠB 141 4M92 常规种/亲本 ⅠA 44 宁粳3号 常规种/亲本 ⅠA 93 2428 常规种/亲本 ⅠA 142 8019 常规种/亲本 ⅠA 45 早籼788 常规种/亲本 ⅠA 94 贵9B 常规种/亲本 ⅠA 143 四丰43 常规种/亲本 ⅠA 46 川农2号 常规种/亲本 ⅠA 95 SR54 常规种/亲本 ⅡA 144 青元矮 常规种/亲本 ⅠA 47 糯稻N-2 常规种/亲本 ⅠA 96 中9B 常规种/亲本 ⅠA 145 春江06 常规种/亲本 ⅠA 48 早籼18 常规种/亲本 ⅠA 97 NLjR09 常规种/亲本 ⅠA 146 8077s 常规种/亲本 ⅠA 49 838 常规种/亲本 ⅠA 98 II-32B 常规种/亲本 ⅠA 147 HL514 常规种/亲本 ⅡA 编号 Number 品种 Variety 类型 Type 类群 Group 编号 Number 品种 Variety 类型 Type 类群 Group 编号 Number 品种 Variety 类型 Type 类群 Group 148 IR26 常规种/亲本 ⅠA 181 扬两优6号 两系杂交稻 ⅠA 214 天优华占 三系杂交稻 ⅠA 149 南粳15 常规种/亲本 ⅠA 182 丰两优1号 两系杂交稻 ⅠA 215 K优52 三系杂交稻 ⅠA 150 紫稻 常规种/亲本 ⅠA 183 广两优76 两系杂交稻 ⅠA 216 丰优126 三系杂交稻 ⅠA 151 ZH199 常规种/亲本 ⅠA 184 徽两优996 两系杂交稻 ⅠA 217 丰源优272 三系杂交稻 ⅠA 152 GP15 常规种/亲本 ⅠA 185 新两优香4 两系杂交稻 ⅠA 218 荃香优512 三系杂交稻 ⅠA 153 IR8 常规种/亲本 ⅠA 186 淮两优3号 两系杂交稻 ⅠA 219 广籼优4号 三系杂交稻 ⅠA 154 黑米 常规种/亲本 ⅠA 187 两优036 两系杂交稻 ⅡB 220 科优16 三系杂交稻 ⅠA 155 IR64 常规种/亲本 ⅡA 188 两优100 两系杂交稻 ⅠA 221 农华优808 三系杂交稻 ⅠA 156 B5 常规种/亲本 ⅠA 189 两优华6 两系杂交稻 ⅠA 222 冈优1577 三系杂交稻 ⅠA 157 五常香 常规种/亲本 ⅠA 190 广两优100 两系杂交稻 ⅠA 223 新优188 三系杂交稻 ⅠA 158 两优631 两系杂交稻 ⅠA 191 丰两优3号 两系杂交稻 ⅡA 224 金优88 三系杂交稻 ⅠA 159 广两优香66 两系杂交稻 ⅠA 192 新两优98 两系杂交稻 ⅠB 225 中优1671 三系杂交稻 ⅠA 160 Y两优1号 两系杂交稻 ⅠA 193 安两优821 两系杂交稻 ⅠA 226 协优63 三系杂交稻 ⅠA 161 Y两优9918 两系杂交稻 ⅠA 194 常两优2号 两系杂交稻 ⅠB 227 80优121 三系杂交稻 ⅠA 162 深两优865 两系杂交稻 ⅠA 195 丰两优80 两系杂交稻 ⅠA 228 Ⅲ优98 三系杂交稻 ⅠA 163 新华两优9号 两系杂交稻 ⅠA 196 中浙优8号 三系杂交稻 ⅠA 229 协优9019 三系杂交稻 ⅠA 164 华两优1206 两系杂交稻 ⅠA 197 甬优10号 三系杂交稻 ⅡA 230 协优58 三系杂交稻 ⅠA 165 C两优608 两系杂交稻 ⅠA 198 春优84 三系杂交稻 ⅡA 231 丰优293 三系杂交稻 ⅡA 166 两优363 两系杂交稻 ⅠA 199 浙优18 三系杂交稻 ⅡA 232 Ⅱ优107 三系杂交稻 ⅠA 167 丰两优晚三 两系杂交稻 ⅠA 200 钱优0508 三系杂交稻 ⅠA 233 庐优855 三系杂交稻 ⅠA 168 广两优1128 两系杂交稻 ⅠA 201 扬籼优418 三系杂交稻 ⅠA 234 怀优4号 三系杂交稻 ⅠB 169 II优98 两系杂交稻 ⅠA 202 甬优538 三系杂交稻 ⅡA 235 新隆优1 三系杂交稻 ⅠA 170 科两优889 两系杂交稻 ⅠA 203 科优8377 三系杂交稻 ⅠA 236 丰晚籼优1号 三系杂交稻 ⅠA 171 徽两优5号 两系杂交稻 ⅠA 204 川香优2号 三系杂交稻 ⅠA 237 辐优138 三系杂交稻 ⅠA 172 隆两优6号 两系杂交稻 ⅠA 205 甬优1540 三系杂交稻 ⅡA 238 天优81 三系杂交稻 ⅠA 173 丰两优9号 两系杂交稻 ⅠA 206 T优15 三系杂交稻 ⅠA 239 开优8号 三系杂交稻 ⅠA 174 II优1256 两系杂交稻 ⅠA 207 丰优9号 三系杂交稻 ⅠA 240 中2优1286 三系杂交稻 ⅠB 175 深两优862 两系杂交稻 ⅠA 208 浙糯优1号 三系杂交稻 ⅡA 241 新隆粳3号 三系杂交稻 ⅠA 176 两优6326 两系杂交稻 ⅠA 209 宜优673 三系杂交稻 ⅠA 242 Ⅱ优8号 三系杂交稻 ⅠA 177 C两优华占 两系杂交稻 ⅠA 210 天优998 三系杂交稻 ⅠA 243 辐优155 三系杂交稻 ⅠA 178 丰两优香1号 两系杂交稻 ⅠA 211 五优308 三系杂交稻 ⅠA 244 丰优512 三系杂交稻 ⅡA 179 徽两优6号 两系杂交稻 ⅠA 212 嘉禾优555 三系杂交稻 ⅡA 245 辐优136 三系杂交稻 ⅠA 180 两优688 两系杂交稻 ⅠA 213 欣荣优华占 三系杂交稻 ⅠA