基于SSR标记的云南腾冲水稻的遗传多样性分析

李松,张世成,董云武,施德林,史云东

Genetic Diversity Analysis of Rice Varieties in Tengchong, Yunnan Based on SSR Markers

Song Li,Shicheng Zhang,Yunwu Dong,Delin Shi,Yundong Shi

表2 18对水稻SSR核心引物

Table 2 18 SSR core primers of rice

编号Code 引物Primer 染色体Chromosome 引物序列Primer sequence 扩增条带长度Length of amplify band (bp) A02 RM71 2 F：CTAGAGGCGAAAACGAGATG 122~148 R：GGGTGGGCGAGGTAATAATG A03 RM85 3 F：CCAAAGATGAAACCTGGATG 80~104 R：GCACAAGGTGAGCAGTCC A05 RM274 5 F：CCTCGCTTATGGAGAGCTCG 149~162 R：CTTCTCCATCACTCCCATGG A07 RM336 7 F：CTTACAGAGAAACGGCATCG 151~193 R：GCTGGTTTGTTTCAGGTTCG A09 RM219 9 F：CGTCGGATGATGTAAAGCCT 194~222 R：CATATCGGCATTCGCCTG A11 RM209 11 F：ATATGAGTTGCTGTCGTGCG 125~160 R：CAACTTGCATCCTCCCCTCC A12 RM19 12 F：CAAAAACAGAGCAGATGAC 216~253 R：CTCAAGATGGACGCCAAGA B01 RM1195 1 F：ATGGACCACAAACGACCTTC 142~152 R：CGACTCCCTTGTTCTTCTGG B02 RM208 2 F：TCTGCAAGCCTTGTCTGATG 167~182 R：TAAGTCGATCATTGTGTGGACC B03 RM232 3 F：CCGGTATCCTTCGATATTGC 141~161 R：CCGACTTTTCCTCCTGACG B06 RM253 6 F：TCCTTCAAGAGTGCAAAACC 133~142 R：GCATTGTCATGTCGAAGCC B09 RM278 9 F：GTAGTGAGCCTAACAATAATC 128~142 R：TCAACTCAGCATCTCTGTCC B10 RM258 10 F：TGCTGTATGTAGCTCGCACC 128~146 R：TGGCCTTTAAAGCTGTCGC B11 RM224 11 F：ATCGATCGATCTTCACGAGG 120~157 R：TGCTATAAAAGGCATTCGGG B12 RM17 12 F：TGCCCTGTTATTTTCTTCTCTC 159~185 R：GGTGATCCTTTCCCATTTCA - RM18 7 F：TTCCTCTCATGAGCTCCAT 142~183 R：GAGTGCCTGGCGCTGTAC - RM273 4 F：GAAGCCGTCGTGAAGTTACC 152~172 R：GTTCCTACCTGATCGCGAC - RM297 1 F：TCTTTGGAGGCGAGCTGAG 162~189 R：CGAAGGGTACATCTGCTTAG