马铃薯种质资源晚疫病抗性评价及分子标记辅助筛选
Evaluation of Germplasms for Resistance to Potato Late Blight and Molecular Markers Assisted Screening
收稿日期: 2020-10-27 修回日期: 2020-12-3 网络出版日期: 2021-06-29
基金资助: |
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Received: 2020-10-27 Revised: 2020-12-3 Online: 2021-06-29
作者简介 About authors
娄树宝,从事马铃薯遗传育种研究,E-mail:
由致病疫霉(Phytophthora infestans)引起的晚疫病是马铃薯生产上最具危害性的病害,种植抗病品种是防治该病害最有效的方法。分子标记辅助选择可以大大缩短育种年限,提高育种效率。对395008.45×克新27号的60份杂交后代进行了晚疫病抗性评价,结果有39份表现抗病,21份表现感病。利用晚疫病抗性基因R8的分子标记对60份杂交后代进行了检测,其中有43份含有R8基因;对36份种质资源进行检测,其中有28份含有R8基因。本研究鉴定的抗性资源可为马铃薯抗病育种提供优质的亲本材料。
关键词:
Potato late blight caused by Photophthora infestans has always been a devastating disease in potato production. Use of resistant varieties is the most fundamental and effective way to control the disease. Molecular marker assisted selection can greatly shorten the breeding period, significantly improve the breeding efficiency. A total of 60 offspring of hybrid combinations of 395008.45×Kexin No.27 were evaluated for resistance to Phytophthora infestans. The results showed that 39 materials were resistantance varieties and 21 materials were susceptible varieties. The molecular marker related to the resistance gene R8 were used to detect 60 offspring and 36 potato germplasm resources, and 43 varieties (lines) and 28 varieties (lines) had resistance gene R8, respectively. The potato resistance germplasm resources tested could provide high-quality parental materials for disease resistance breeding.
Keywords:
本文引用格式
娄树宝, 李凤云, 田国奎, 王海艳, 田振东, 王立春, 刘喜才, 王辉.
Lou Shubao, Li Fengyun, Tian Guokui, Wang Haiyan, Tian Zhendong, Wang Lichun, Liu Xicai, Wang Hui.
马铃薯晚疫病是由致病疫霉(Phytophthora infestans)引起的具有毁灭性的病害之一。目前晚疫病防控以化学药剂为主,但由于成本较高,且长期使用会造成环境污染,也会使病原菌产生抗药性,加快其变异进程,因此,种植抗病品种仍是防控马铃薯晚疫病最经济有效和环境友好的途径。早期品种抗性改良主要通过向栽培种中导入野生种S.demissum的主效抗性基因。然而,目前主栽品种主要由国外有限的数个品种和品系选育而成,导致遗传背景相对狭窄,抗病基因的数目和类型有限,抗性频繁丧失,限制了应用推广[1]。马铃薯中已经克隆了大约30个抗晚疫病R基因及其同源基因,并开发了相应的分子标记,有效地提高了晚疫病抗性育种效率[2,3]。研究表明,将多个R基因聚合在同一个马铃薯材料中可以提高晚疫病田间抗性,也有研究认为,利用具有数量抗性的材料选育品种能够减小对病原菌的选择压力,因此更倾向于使用具有数量抗性的材料进行晚疫病抗病育种[4]。
然而,近些年来的研究[5]表明一些主效R基因的抗性也表现为数量抗性表型,即所谓的主效基因也可以解释数量抗性性状。主效R基因被克服通常是因为其对病原菌的选择压较大,而数量抗性基因只具有局部、微弱的效应,对病原菌的选择压较小[6]。例如,水稻白叶枯抗病基因Xa4就被认为是一个可以对多个白叶枯菌[Xanthomonas oryzae pv. oryzae(Xoo)]小种起到抗病作用的“被克服了的”R基因[7]。在马铃薯中,晚疫病抗性鉴别寄主MaR8、MaR9 和MaR10在田间都表现出广谱抗性和数量抗性的特点[8,9]。对具有晚疫病数量抗性的B3群体、Sarpo Mira、Stirling以及其他品种的多年抗性鉴定结果表明它们能够提供持久的晚疫病抗性。研究[10]证实,具有数量抗性表型的R8基因,田间和接种鉴定均表现出一定程度的病原侵染,发病较慢,因此病原菌受到的选择压没有其他主效基因剧烈,使病原菌的协同进化过程变慢,R8抗性能够较长时期地保存下来,R8基因广泛地存在于不同类型的马铃薯材料中,且具有较好的田间抗性。
本试验采用田间自然发病和室内人工接种鉴定2种方法对马铃薯60份杂交后代和36份种质资源进行晚疫病抗性鉴定,结合病情指数和病斑面积对马铃薯材料的晚疫病抗性进行评价;鉴于含有R8基因的抗性材料在田间表现广谱抗性和持久抗性,应用R8基因分子标记对育种后代和亲本材料进行筛选,快速检测马铃薯材料中是否含有R8基因,实现分子标记辅助选择,加快马铃薯晚疫病抗性育种进程,为今后马铃薯聚合抗病育种提供依据。
1 材料与方法
1.1 试验材料
395008.45、克新27号及其60份杂交后代,以及36份马铃薯种质资源由黑龙江省农业科学院克山分院提供。
1.2 晚疫病田间调查
试验材料种植于黑龙江省农业科学院克山分院试验地,进行田间晚疫病发生情况调查,在所有马铃薯植株叶片完全展开后,每周观察植株发病情况,统计各马铃薯品种(系)的病级,采用病情指数法计算马铃薯品种(系)晚疫病病情指数[11],病情指数为3次调查的平均值。
病情指数=∑(各级病叶数×相对病级数值)/(调查总叶数×9)×100。
病级标准如下:0级,无病斑;1级,病斑面积占整个叶面积5%以下;3级,病斑面积占整个叶面积6%~10%;5级,病斑面积占整个叶面积11%~20%;7级,病斑面积占整个叶面积21%~50%;9级,病斑面积占整个叶面积50%以上。
田间抗病性级别标准为病情指数低于30为高抗(HR),31~50为中抗(MR),51~70为中感(MS),70以上为高感(HS)。
1.3 晚疫病菌人工接种鉴定
采用田间分离的晚疫病菌株KS09-7(生理小种1、2、3、4、5、6、7、8、10、11)和KS11-26(生理小种3、4、6、7、8、11)混合接种。将晚疫病菌经18℃黑暗培养10~15d,用无菌水冲洗,过滤除去菌丝,将收集到的孢子囊置于4℃的冰箱内2~3h,以刺激游动孢子的释放,将浓度调到1×105个/mL待用。植株生长至现蕾阶段,采摘无病斑、大小适中、表面平整的叶片,背面朝上放在铺有无菌湿润滤纸的培养皿中,用配制好的游动孢子悬浮液接种,每个叶片背面接种20μL孢子悬浮液,每份材料接种4片叶,重复3次,置于18℃~20℃保湿培养(每天16h光照,8h黑暗)。接种5d后开始观察叶片背面有无病斑、孢子囊以及霉层,统计病斑面积,游标卡尺记载病斑的长(L)和宽(W)(两者垂直),连续统计3d。根据病斑长和宽计算病斑面积(ellipse area)A=1/4×π×L×W。
图1
图1
离体马铃薯叶片晚疫病抗性鉴定标准
Fig.1
Appraisal criteria for resistance of potato leaves in vitro against late blight
1.4 马铃薯DNA提取以及晚疫病抗性基因检测
采集马铃薯幼嫩叶片,立即放入装有冰袋的密封采集箱中备用。采用CTAB法提取基因组DNA,利用核酸蛋白分析仪检测DNA浓度,用1.2%琼脂糖凝胶电泳检测其纯度。R8基因特异性标记信息由华中农业大学田振东教授提供。
2 结果与分析
2.1 马铃薯杂交后代晚疫病抗性鉴定
以395008.45为母本、克新27号为父本及其60份杂交后代(编号1~62)为供试材料,于2018-2019年连续2年对其进行田间抗性和室内接种抗性鉴定,结果(表1)显示后代材料中39份田间表现抗病,21份材料表现感病;室内接种鉴定结果与田间调查结果基本一致,室内接种抗性要低于田间。通过多年调查,克新27号在田间晚疫病抗性表现为高抗,并且抗性能够稳定遗传给子代,以克新27号为亲本的杂交组合,后代中表现抗病的比例较大,可以作为晚疫病抗性育种的重要亲本材料加以利用。克新27号室内接种鉴定为抗病,子代中有高抗的材料,表现超亲优势。
表1 马铃薯种质资源和杂交后代晚疫病抗性鉴定
Table 1
编号 Number | 品种(系) Cultivar (line) | 田间抗性 Field resistance | 室内接种抗性 Resistance indoor | 抗性是否一致 Unified resistance | R8基因 R8 gene |
---|---|---|---|---|---|
1 | 395008.45 | 中感(MS) | 高感(HS) | 是 | 无 |
2 | 克新27号 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
3 | S1 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
4 | S2 | 高抗(HR) | 高抗(HR) | 是 | 有 |
5 | S3 | 中抗(MR) | 感病(S) | 否 | 有 |
6 | S4 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
7 | S5 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
8 | S6 | 高抗(HR) | 高抗(HR) | 是 | 有 |
9 | S7 | 高感(HS) | 高感(HS) | 是 | 无 |
0 | S8 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
11 | S9 | 高感(HS) | 高感(HS) | 是 | 无 |
12 | S10 | 高抗(HR) | 高抗(HR) | 是 | 有 |
13 | S11 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
14 | S12 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
15 | S13 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
16 | S14 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
17 | S15 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
18 | S16 | 高感(HS) | 高感(HS) | 是 | 无 |
19 | S17 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
20 | S18 | 中感(MS) | 感病(S) | 是 | 无 |
21 | S19 | 高抗(HR) | 高抗(HR) | 是 | 有 |
22 | S20 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
23 | S21 | 高感(HS) | 高感(HS) | 是 | 无 |
24 | S22 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
25 | S23 | 高抗(HR) | 高抗(HR) | 是 | 有 |
26 | S24 | 高抗(HR) | 高抗(HR) | 是 | 有 |
27 | S25 | 中抗(MR) | 感病(S) | 否 | 有 |
28 | S26 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
29 | S27 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
30 | S28 | 中感(MS) | 感病(S) | 是 | 无 |
31 | S29 | 高感(HS) | 高感(HS) | 是 | 有 |
32 | S30 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
33 | S31 | 高抗(HR) | 高抗(HR) | 是 | 有 |
34 | S32 | 高感(HS) | 高感(HS) | 是 | 有 |
35 | S33 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
36 | S34 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
37 | S35 | 高抗(HR) | 高抗(HR) | 是 | 有 |
38 | S36 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
39 | S37 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
40 | S38 | 中感(MS) | 感病(S) | 是 | 无 |
41 | S39 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
42 | S40 | 高感(HS) | 感病(S) | 是 | 有 |
43 | S41 | 中感(MS) | 感病(S) | 是 | 无 |
44 | S42 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
45 | S43 | 中感(MS) | 感病(S) | 是 | 无 |
46 | S44 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
47 | S45 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
48 | S46 | 中感(MS) | 感病(S) | 是 | 无 |
49 | S47 | 高感(HS) | 高感(HS) | 是 | 有 |
50 | S48 | 中感(MS) | 感病(S) | 是 | 无 |
51 | S49 | 中感(MS) | 感病(S) | 是 | 无 |
52 | S50 | 高感(HS) | 高感(HS) | 是 | 无 |
53 | S51 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
编号 Number | 品种(系) Cultivar (line) | 田间抗性 Field resistance | 室内接种抗性 Resistance indoor | 抗性是否一致 Unified resistance | R8基因 R8 gene |
54 | S52 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
55 | S53 | 高感(HS) | 高感(HS) | 是 | 无 |
56 | S54 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
57 | S55 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
58 | S56 | 高感(HS) | 高感(HS) | 是 | 无 |
59 | S57 | 中感(MS) | 感病(S) | 是 | 无 |
60 | S58 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
61 | S59 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
62 | S60 | 中感(MS) | 高感(HS) | 是 | 无 |
63 | Atzima | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
64 | 维道克 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
65 | NS51-5 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
66 | 兹列巴 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
67 | 扎列娃 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
68 | S.etuberosum | 高抗(HR) | 高抗(HR) | 是 | 无 |
69 | S.stenotomum | 高抗(HR) | 高抗(HR) | 是 | 无 |
70 | bhp244 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 无 |
71 | 云薯101 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
72 | 云薯301 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 无 |
73 | 云薯201 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
74 | 云薯501 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 无 |
75 | 云薯102 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
76 | 388676.1 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
77 | 396033.102 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
78 | 395037.107 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
79 | 390663.8 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
80 | 393617.1 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
81 | 395109.29 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
82 | 393077.54 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
83 | 延薯3号 | 中抗(MR) | 感病(S) | 否 | 有 |
84 | 黑金刚 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
85 | 黑美人 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
86 | 转心乌 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
87 | 陇薯6号 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 无 |
88 | 坝90-2-6 | 中抗(MR) | 感病(S) | 否 | 有 |
89 | 会-2 | 中抗(MR) | 感病(S) | 否 | 无 |
90 | 内薯7号 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 无 |
91 | 克新13号 | 中抗(MR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
92 | 克新18号 | 高抗(HR) | 抗病(R) | 是 | 有 |
93 | 克新19号 | 中感(MS) | 高感(HS) | 是 | 有 |
94 | 克新20号 | 高抗(HR) | 中抗(MR) | 是 | 有 |
95 | 克新30号 | 中抗(MR) | 感病(S) | 否 | 有 |
96 | 2015124-1 | 中抗(MR) | 感病(S) | 否 | 有 |
97 | Reina | 中抗(MR) | 感病(S) | 否 | 有 |
98 | 荷兰材料 | 中抗(MR) | 感病(S) | 否 | 有 |
2.2 36份马铃薯种质资源晚疫病抗性鉴定
2016-2018年连续3年对230份育种亲本进行晚疫病抗性跟踪调查,从中选取36份(编号63~98)田间表现抗病的材料进行室内接种鉴定,结果(表1)显示,其中7份材料表现感病,与田间抗性不一致。根据多年观察,克新19号刚开始推广时晚疫病抗性较好,经过多年种植后抗性基本丧失,原因是晚疫病菌生理小种不断变化,新的小种克服抗性基因,所以应不断发掘新的抗性基因,通过多种手段聚合到新品种中,增强其晚疫病持久抗性。
2.3 马铃薯种质资源及杂交后代抗性基因R8检测
应用晚疫病抗性基因R8的特异性引物检测了60份395008.45×克新27号的杂交后代,部分结果如图2,含有R8基因的后代可以扩增出682bp的特异性片段,显示43份含有R8基因,其中39份田间表现为抗病,4份田间表现感病,其余17份不含有R8基因,都表现为感病。说明父本克新27号含有的抗性基因R8能够遗传给子代,并且子代大多数个体含有R8基因。
图2
图2
马铃薯395008.45×克新27号杂种后代抗性基因R8检测
M:DL2000 DNA标记,下同
Fig.2
Detection of resistance gene R8 in potato hybrids of 395008.45×Kexin No.27
M: DL2000 DNA marker, the same below
应用晚疫病抗性基因R8的特异性引物检测了36份多年田间表现抗病的材料(部分结果见图3),检测到其中28份含有R8基因,8份不含,其具有的抗性可能是由其他抗性基因提供的。这些资源是重要的抗病育种亲本,可以利用其对一些抗性较差的品种进行改良,对育种具有重要意义。
图3
图3
马铃薯抗病种质资源中抗性基因R8检测
Fig.3
Detection of resistance gene R8 in potato germplasm resistance resources
3 讨论
抗病基因的发掘和多个抗病基因聚合是提高品种持久抗病性的重要手段,获得优异抗病种质资源是培育抗病品种的基础。本试验中36份抗性资源有28份含有R8基因,在田间均具有较好的抗性,其余8份是否含有其他抗性基因需要进一步检测,部分材料虽然含有R8基因,但田间却表现感病,排除人为因素和标记准确度的影响,原因有待进一步研究。含有R8基因的抗性材料是否含有其他抗性基因还需要利用抗病基因分子标记去检测和评价,这是改良作物抗病性的一种经济有效的方法,在不同作物中被广泛应用[13,14]。本研究中含有R8基因的材料在田间和室内接种鉴定时均表现出一定程度的病原侵染,病斑扩展较慢,也证实R8基因具有数量抗性表型,与蒋锐[10]研究结果一致。
部分材料田间与室内接种鉴定存在差异,原因可能有,材料在田间具有广谱抗性;材料生长环境不同,造成抗性水平上的差异;离体叶片接种鉴定发病普遍严重,可能是离体鉴定发病条件更适合;人为因素有时也会影响鉴定结果。离体叶片接种鉴定在室内,温湿度条件可控,能创造最适合晚疫病发病的条件,鉴定结果比较准确。但结果在不同生理小种之间也会存在差异,本试验使用当地的强毒力生理小种和优势小种,通过多次重复接种,再与田间自然发病相结合,使鉴定结果更准确可靠。
4 结论
对36份马铃薯种质资源和395008.45×克新27号的60份杂交后代进行晚疫病田间抗性调查和室内离体叶片接种鉴定,部分材料鉴定结果有差异;对96份材料进行R8基因检测,结果显示,大部分表现抗病的材料都含有R8基因,部分感病材料中也含有R8基因。
参考文献
The Solanum demissum R8 late blight resistance gene is an Sw-5 homologue that has been deployed worldwide in late blight resistant varieties
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Accelerated cloning of a potato late blight-resistance gene using Ren Seq and SMRT sequencing
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Qualitative and quantitative late blight resistance in the potato cultivar Sarpo Mira is determined by the perception of five distinct RXLR effectors
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Shades of gray: the world of quantitative disease resistance
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A “defeated” rice resistance gene acts as a QTL against a virulent strain of Xanthomonas oryzae pv. oryzae. Molecular and
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Distinguishing major-gene from field resistance to late blight (Phytophthora infestans) of potato (Solanum tuberosum) and selecting for high levels of field resistance
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Phenotypic stability and genome-wide association study of late blight resistance in potato genotypes adapted to the tropical highlands
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