MAGIC群体的遗传特征及其在作物耐逆研究上的应用

荣克伟, 柳波娟, 卢跃磊, 陈勇, 罗平, 赵康, 郝转芳, 高文伟

Genetic Characteristics of MAGIC Population and Its Application in Crop Stress Tolerance

Rong Kewei, Liu Bojuan, Lu Yuelei, Chen Yong, Luo Ping, Zhao Kang, Hao Zhuanfang, Gao Wenwei

表1 MAGIC群体在植物遗传研究中的应用

Table 1 Application of MAGIC group in plant genetics research

作物 Crop 类型 Type 亲本选择 Parental selection 杂交方式 Hybridization 群体规模 Group size 基因型鉴定 Genotyping 研究性状 Research trait 分析方法 Analytical method 参考文献 Reference 拟南芥 Arabidopsis – 19亲本 随机杂交 1026 F4 1260 SNPs 抽薹期 QTL [26] 水稻Rice 籼稻 4亲本DC1 双列杂交 495 F6 6K SNP芯片 籽粒产量性状、穗相关性状、分蘖相关性状、抽穗期、苗期和株高 GWAS [23,28-31] 4亲本DC2 双列杂交 525 F6 8亲本 Funnel杂交 668 F6 55K SNP芯片, GBS 籼稻 8亲本 Funnel杂交 1328 S7 GBS: 17387 SNP 产量性状、稻米品质、开花期、株高、粒型、抗旱性、耐涝性、耐盐性、抗病性（稻瘟病、白叶枯病、褐斑病） QTL,GWAS [32⇓-34] MAGIC PLUS ― 144 S8 MAGIC PLUS DH系 ― 76 DH 粳稻 8亲本 Funnel杂交 500 S5 籼―粳 GLOBAL MAGIC ― 1402 S7 小麦Wheat 春小麦 4亲本 Funnel杂交 1579 F6 826 DArTs、283SNPs、53SSRs,9K SNP芯片,90K SNP芯片 株高、籽粒重、 胚芽鞘长度 LMC,QTL [13,35-36] 冬小麦 8亲本 Funnel杂交 1091 F7 90K SNP芯片 产量、开花期、 病害和株高 LMC,QTL [37-38] 全麦粉 4亲本 Funnel杂交 332 F6 SSR 产量性状、 抗白粉病 QTL,LMC [39] 欧洲 小麦 60亲本 随机杂交 1000 S4 9K SNP芯片 抽穗期 LDA,GWAS [40] 14个KASPar SNP 大麦 Hordeum – 8亲本 Funnel杂交 5000 DH 9K SNP芯片 开花期 QTL [41] 8亲本 Funnel杂交 642 F5 9K SNP芯片 黄斑病 LMC,QTL [42] 棉花Cotton 陆地棉 11亲本 随机杂交 547 F5 GBS 纤维品质 GWAS,QTL [43] 8亲本 随机杂交 960 MLs SLAF-seq 开花期、株型、 果枝数 GWAS,QTL [44] 11亲本 随机杂交 550 RIL 47K SNP芯片 株高、茎秆质量 GWAS,QTL [45] 高粱 Sorghum – 29亲本 随机杂交 1000 F6 GBS 株高 GWAS,QTL [46] 作物 Crop 类型 Type 亲本选择 Parental selection 杂交方式 Hybridization 群体规模 Group size 基因型鉴定 Genotyping 研究性状 Research trait 分析方法 Analytical method 参考文献 Reference 烟草 Tobacco – 8亲本 双列杂交 600 F4 430K 芯片 株型、烟叶品质 GWAS [47] 玉米 Maize – 8亲本 Funnel杂交 1636 F6 GBS 开花期、株高、 穗位高 LMC,AM,QTL [48] 4亲本 Funnel杂交 1149 S3 118K SNP 芯片 株高、穗高、散 粉期、吐丝期 QTL,GWAS [49] 8亲本 Funnel杂交 401 RIL 56K SNP 芯片 苗重、苗长和 黄萎病 QTL,NAM [50] 8亲本 Funnel杂交 700F6 110K SNP 芯片 镰孢菌穗腐病 LMC,AM,QTL [51] 8亲本 Funnel杂交 406 RIL 100K SNP 芯片,GBS 发芽率、叶绿素 和出苗期 GWAS,QTL [52] 8亲本 Funnel杂交 368 MLs 1000K SNP芯片,GBS 籽粒含油量 GWAS,QTL [53] 16亲本 Funnel杂交 513 RIL 500K SNP芯片 株高、叶形态、 开花期、穗大小 GWAS [54] 4亲本 Funnel杂交 1044 F6 50K SNP芯片 产量、吐丝期、 株高 QTL,AM [55] 油菜 Brassica napus 甘蓝型 8亲本 随机杂交 680 F6 – 始花期、抗病性 SSD [56]