国审4个漯麦品种重要性状功能基因KASP检测与分析

曹燕燕, 李雷雷, 葛昌斌, 黄杰, 周璐琪, 王君, 杨森要, 廖平安

KASP Detection and Analysis of Functional Genes of Important Traits in Four National-Approved Luomai Varieties

Cao Yanyan, Li Leilei, Ge Changbin, Huang Jie, Zhou Luqi, Wang Jun, Yang Senyao, Liao Ping’an

表2 相关基因及标记详细信息

Table 2 Details of related genes and markers

类型 Type 性状 Characteristic 遗传效应 Genetic effect 基因 Gene 标记 Marker 等位变异 Allelic variation 表型 Phenotype 适应性相关性状 Adaptive-related trait 株高 主效 Rht-B1 Rht-B1_SNP Rht-B1a 野生型 Rht-B1b 矮秆型 株高 主效 Rht-D1 Rht-D1_SNP Rht-D1a 野生型 Rht-D1b 矮秆型 株高 主效 Rht8 Rht8 Rht8+ 含矮秆基因 Rht8- 不含矮秆基因 株高、熟期 微效 TaPRR73-A1 PRR73A1-9IND Hap-I 晚熟，矮 Hap-II 早熟，高 株高、熟期 微效 TaPRR73-B1 PRR73B1-4558 Hap-I 早熟，高 Hap-II 晚熟，矮 光周期 主效 Ppd-A1 GS105-1117_InDel Ppd-A1a 光周期迟钝 Ppd-A1b 光周期敏感 光周期 主效 Ppd-B1 TaPpdBJ001 Ppd-B1a 光周期迟钝 Ppd-B1b 光周期敏感 光周期 主效 Ppd-D1 TaPpdDJ001 Ppd-D1a 光周期迟钝 Ppd-D1b 光周期敏感 芒 主效 AWN Absence AWN+ 有芒 Presence AWN- 无芒 产量相关性状 Yield-related trait 千粒重 微效 Sus1-7A Sus1-7A-1185_SNP Hap-I 低千粒重 Hap-II 高千粒重 千粒重 微效 TaGASR7-A1 TaGASR H1C 高千粒重 H1G 低千粒重 千粒重 微效 TaSus2-2A Sus2-2A-20SNP Hap-A 高千粒重 Hap-G 低千粒重 粒重 微效 TaGS5 GS5_SNP TaGS5-Ala 大粒，粒重高 TaGS5-Alb 小粒，粒重低 穗粒数 微效 TEF-7A TEF7A-1-bp_IND Hap-7A-3 粒数较多 Hap-7A-1/2 粒数较少 穗粒数 微效 TaMoc-7A TaMoc-7A_2433 Hap-H 粒数较多 Hap-L 粒数较少 品质相关性状 Quality-related trait 籽粒硬度 主效 Pina-D1 Pina-D1 Pina-D1a 软质 Pina-D1b/Null 硬质 籽粒硬度 主效 Pinb-D1 Pinb-D1 Pinb-D1a 软质 Pinb-D1b 硬质 籽粒硬度 微效 Pinb2-V Pinb2-Bv2 Pinb-B2a 软质 Pinb-B2b 硬质 面筋强度 主效 Glu-D1 Glu-D1_SNP 2+12 弱筋 5+10 强筋 面筋强度 主效 Glu-A1 Glu-A1-13 AxNull 弱筋 Ax1/Ax2* 强筋 籽粒蛋白质含量 微效 Gpc GPC_DUC Gpc-B1- 含量正常 Gpc-B1+ 含量增加 籽粒蛋白质含量 微效 NAM-6A NAM-6A_SNP1 T/A1c/A1d 含量正常 G/A1a/A1b 含量增加 黄色素含量 主效 Psy-D1 Psy1Da-g Psy-D1a 含量低 Psy-D1g 含量高 黄色素含量 微效 Zds-A1 ZDS-A1_SNP Zds-A1a 含量高 Zds-A1b 含量低 黄色素含量 微效 TaPds-B1 PDS-B1_SNP TaPds-B1a 含量高 TaPds-B1b 含量低 过氧化物酶表达量 微效 Pod-A1 Pod-A1 TaPod-A1a 酶含量低 TaPod-A1b 酶含量高 脂肪氧化酶表达量 主效 Lox-B1 Lox-B1 Lox-B1b 酶含量低 Lox-B1a 酶含量高 可溶性糖含量 微效 SST-4D SST-4D-1093 TaSST-D1a 糖含量高 TaSST-D1b 糖含量低 抗逆相关性状 Resistance-related trait 抗旱 主效 TaDreb-B1 TaDreb_SNP TaDreb-B1a 抗旱 TaDreb-B1b 不抗旱 抗旱 主效 1-fehw3 1-FEH-6B Kauz type 不抗旱 Westonia type 抗旱 穗发芽 主效 TaPHS1 PHS1-646 NW97S186 type 感穗发芽 Rio Blanco type 抗穗发芽 穗发芽 微效 Sdr-B1 Sdr-B1 TaSdr-B1b 感穗发芽 TaSdr-B1a 抗穗发芽 木质素含量 微效 COMT-3B COMT3B_882_SNP COMT-3Ba 木质素含量高 COMT-3Bb 木质素含量低 抗白粉病 主效 Pm21 Pm21_SNP Pm21- 感病 Pm21+ 抗病 抗赤霉病 主效 Fhb1 Fhb1_KSU Fhb1- 感病 Fhb1+ 抗病 抗条锈病 微效 Yr78 IWA7257 Yr78- 感病 Yr78+ 抗病 抗叶锈病 微效 Lr46 Lr46_JF2-2A Lr46- 感病 Lr46+ 抗病 抗叶锈病 微效 Lr16 kwm847 Lr16- 感病 Lr16+ 抗病 抗叶锈病 微效 Lr16 kwm849 Lr16- 感病 Lr16+ 抗病 抗叶锈病 微效 Lr48 IWB70147 Lr48- 感病 Lr48+ 抗病