基于SSR标记的104份苦荞种质资源遗传多样性及群体结构分析

吴叶宁, 胡昊驰, 王春勇, 谢锐, 张永虎, 温蕊, 金晓蕾

Genetic Diversity and Population Structure Analysis of 104 Tartary Buckwheat Germplasm Resources Based on SSR Markers

Wu Yening, Hu Haochi, Wang Chunyong, Xie Rui, Zhang Yonghu, Wen Rui, Jin Xiaolei

表2 SSR引物扩增多态性信息

Table 2 Polymorphic information of SSR primers

引物 Primer 引物序列（5’→3’） Primer sequence 等位 基因数 Na 有效等位 基因数 Ne Shannon’s 多样性指数 I 观测 杂合度 Ho 期望 杂合度 He 多态性 信息含量 PIC P13 F：AAATTTCGGGCATAGATTCTGA 2 1.413 0.468 0.010 0.292 0.2497 R：TTCGATCCATCTTTTGGGAG P21 F：ACTCTTCCTCAGCGCTTCAC 4 3.081 1.204 0.077 0.675 0.6115 R：TCCTTGCCTAGTCCAGCAGT P43 F：AATTTGTTGGCACACAAGCA 3 1.420 0.506 0.048 0.296 0.2573 R：GTTGGGACAAGAAGGACTCG P52 F：CGATCCCGTAAGATCTCGTC 2 1.010 0.031 0.010 0.010 0.0096 R：CGAGTTTCGAACTCCTGACC P53 F：TCCATGTTTGAGGGGCTAAG 3 2.086 0.870 0.058 0.521 0.4499 R：AAATTCTTGCGCATTGCATA P68 F：AAGGGCAAGATTGCTTACCA 2 1.874 0.659 0.087 0.466 0.3576 R：GTCAGGATCCATTGTGGGAT P69 F：AAGGCAAGGGTATAAAGGGAA 2 1.649 0.582 0.077 0.393 0.3161 R：GAACAGGAACCCGAATACGA P76 F：CATACACATCCGCCAACAAG 2 1.969 0.685 0.048 0.492 0.3711 R：GTTAAGGCAAACTCGGTCCA P99 F：AGTGAAATTTTGGTGGACGC 2 1.874 0.659 0.106 0.466 0.3576 R：TCGTACTTTCCAAACGCTACA 平均值Mean 2.444 1.820 0.629 0.058 0.401 0.3312