云南边境地区稻种资源的SSR标记遗传多样性及其主要农艺性状关联性分析

汤翠凤, 阿新祥, 董超, 张斐斐, 杨雅云, 杨红梅, 戴陆园, 苏振喜

Analysis of Genetic Diversity by SSR Markers and Correlation of Main Agronomic Traits of Rice Germplasm Resources in Border Areas of Yunnan

Tang Cuifeng, A Xinxiang, Dong Chao, Zhang Feifei, Yang Yayun, Yang Hongmei, Dai Luyuan, Su Zhenxi

表3 SSR标记等位变异与水稻表型性状的相关系数

Table 3 Correlation coefficient between allelic variation of SSR markers and phenotypic traits in rice

标记 Marker 等位 变异 Allelic variation 有效穗数 Effective panicle number per plant 株高 Plant height (cm) 穗长 Panicle length (cm) 穗抽出度 Panicle exsertion (cm) 剑叶长 Flag leaf length (cm) 剑叶宽 Flag leaf width (cm) 穗实粒数 Filled grain number per panicle 穗秕粒数 Unfilled grain number per panicle 穗粒数 Grains per panicle 结实率 Seed setting rate (%) 千粒重 1000-grain weight (g) RM574 A -0.092 0.098 -0.064 0.161** -0.025 -0.015 -0.191** -0.003 -0.145** -0.124* 0.041 B -0.002 -0.100 0.078 -0.122* 0.121* 0.115* 0.210** -0.053 0.129* 0.166** -0.025 C 0.093 0.015 -0.045 -0.014 -0.123* -0.118* -0.090 0.073 -0.027 -0.096 0.005 RM434 A 0.093 -0.115* -0.060 -0.070 -0.080 -0.090 -0.020 -0.010 -0.030 -0.000 -0.060 B -0.076 0.086 0.077 0.019 0.137* -0.002 0.040 -0.035 0.011 0.045 0.042 C -0.176** -0.024 -0.179** 0.178** -0.153** 0.026 -0.291** -0.159** -0.313** -0.010 0.225** D 0.190** 0.022 0.164** -0.163** 0.111* -0.007 0.268** 0.173** 0.303** -0.012 -0.225** RM551 A 0.101 0.019 -0.012 -0.032 -0.078 -0.002 -0.058 -0.011 -0.051 -0.037 -0.048 B -0.095 -0.079 -0.357** 0.329** -0.272** -0.251** -0.362** -0.226** -0.405** -0.029 0.118* C -0.093 0.008 0.045 0.079 0.081 -0.043 0.007 -0.049 -0.021 0.057 0.015 D 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 E 0.029 0.080 0.066 -0.064 0.062 -0.029 0.005 -0.041 -0.020 0.040 0.022 RM214 A -0.063 -0.038 -0.070 0.165** 0.000 0.010 -0.044 -0.099 -0.090 0.059 0.093 B -0.128* -0.117* -0.279** 0.163** -0.240** -0.178** -0.246** -0.190** -0.293** 0.061 0.061 C -0.183** -0.078 -0.148** 0.126* -0.040 -0.005 -0.264** -0.144** -0.284** 0.000 0.272** D -0.045 0.004 -0.171** 0.158** -0.217** -0.110* -0.254** -0.144** -0.275** -0.019 0.073 E 0.031 0.045 -0.021 0.162** -0.096 -0.054 -0.079 -0.048 -0.088 -0.048 -0.031 F 0.031 0.011 0.015 0.081 0.076 -0.020 0.043 -0.054 0.001 0.080 0.061 G 0.185** 0.058 0.328** -0.415** 0.219** 0.186** 0.476** 0.340** 0.555** -0.032 -0.273** H -0.010 0.148** 0.126* 0.057 0.148** 0.041 -0.096 0.000 -0.074 -0.076 0.020 RM7097 A -0.198** -0.145** -0.121* -0.355** 0.052 0.095 -0.236** -0.128* -0.251** 0.047 -0.098 B -0.211** 0.138* -0.069 0.188** 0.018 0.009 -0.188** -0.138* -0.221** 0.011 0.182** C 0.090 0.010 -0.119* -0.181** -0.110* -0.155** -0.134* 0.060 -0.068 -0.146** -0.159** D -0.093 0.014 0.009 0.222** -0.044 -0.078 0.033 -0.059 -0.009 0.036 -0.008 RM202 A -0.189** -0.037 -0.114* 0.126* -0.038 -0.060 -0.117* -0.161** -0.181** 0.120* 0.252** B -0.129* -0.016 -0.064 0.167** 0.013 -0.016 -0.101 -0.147** -0.161** 0.083 0.218** C -0.020 -0.023 -0.261** 0.153** -0.275** -0.185** -0.266** -0.113* -0.267** -0.093 -0.064 D -0.084 0.008 0.049 -0.086 -0.041 0.084 0.025 0.135* 0.098 -0.097 0.047 E 0.078 -0.201** 0.146** -0.179** 0.099 -0.021 0.095 0.039 0.094 0.004 0.054 F 0.064 -0.004 -0.059 0.105 -0.044 0.011 -0.087 -0.105 -0.126* 0.061 -0.017 RM1812 A 0.059 0.067 0.086 -0.133* 0.080 0.060 0.081 0.129* 0.135* -0.078 -0.158** B 0.068 -0.032 0.093 -0.053 0.081 0.066 0.096 0.053 0.104 0.005 0.038 C -0.134* -0.002 -0.024 -0.002 0.051 -0.033 -0.077 0.031 -0.041 -0.055 -0.032 D -0.026 -0.051 -0.321** 0.191** -0.262** -0.187** -0.285** -0.154** -0.306** -0.040 0.008 E -0.126* -0.037 -0.132* 0.190** -0.119* -0.102 -0.216** -0.156** -0.253** 0.028 0.162** F 0.151** -0.063 0.121* -0.073 0.078 -0.010 0.120* 0.057 0.125* 0.027 -0.076 RM3395 A 0.064 0.056 -0.038 -0.012 0.021 -0.026 0.005 0.145** 0.086 -0.098 -0.047 B 0.106 -0.140* -0.057 -0.043 0.024 -0.052 -0.106 0.061 -0.047 -0.142* 0.017 C 0.019 0.118* 0.027 0.088 -0.093 -0.093 0.074 -0.069 0.019 0.077 -0.200** D -0.246** 0.005 -0.002 0.019 0.015 0.039 -0.090 -0.101 -0.126* 0.059 0.211** E 0.062 -0.006 -0.090 0.076 -0.039 -0.002 -0.066 0.068 -0.011 -0.039 -0.018 F 0.015 0.087 0.183** -0.116* 0.056 0.132* 0.106 0.003 0.082 0.049 0.044 G -0.073 -0.128* -0.170** 0.067 0.015 0.022 0.071 -0.092 0.002 0.134* 0.053 RM241 A 0.016 0.093 0.078 0.089 0.057 0.041 -0.075 0.064 -0.021 -0.013 -0.079 B 0.073 -0.286** -0.142* -0.026 -0.268** -0.131* -0.228** -0.041 -0.198** -0.092 -0.087 C -0.028 0.116* 0.055 -0.076 0.154** 0.098 0.217** 0.027 0.180** 0.063 0.038 D -0.094 0.185** 0.060 0.076 0.124* 0.034 0.085 -0.042 0.043 0.056 0.175** RM1086 A -0.255** -0.060 -0.198** 0.260** -0.147** -0.010 -0.416** -0.233** -0.447** -0.022 0.377** B -0.020 -0.127* -0.348** 0.256** -0.275** -0.280** -0.297** -0.020 -0.237** -0.168** -0.090 RM8004 A -0.255** -0.058 -0.198** 0.260** -0.147** -0.013 -0.416** -0.233** -0.447** -0.002 0.377** B -0.021 -0.127* -0.348** 0.256** -0.275** -0.280** -0.297** -0.019 -0.237** -0.168** -0.086 C 0.037 -0.018 -0.159** 0.164** -0.096 -0.064 -0.084 -0.060 -0.099 0.030 0.037 D -0.176** -0.036 -0.246** 0.244** -0.176** -0.133* -0.285** -0.162** -0.310** -0.011 0.224** E 0.186** 0.058 0.214** -0.180** 0.167** 0.093 0.297** 0.152** 0.313** 0.025 -0.178** F -0.076 -0.038 0.102 -0.101 0.031 0.094 -0.025 -0.015 -0.028 0.011 -0.008 RM471 A 0.078 0.048 0.107 -0.004 0.022 -0.013 0.056 0.064 0.080 -0.002 -0.018 B -0.069 0.175** -0.165** 0.130* -0.113 -0.005 -0.060 -0.080 -0.092 0.029 0.004 C 0.022 -0.003 0.011 0.066 0.109 -0.076 -0.049 -0.151* -0.125* 0.063 0.160** D 0.064 0.063 -0.043 -0.071 0.023 0.080 -0.005 0.228** 0.127* -0.164** -0.171** E -0.051 -0.227** 0.096 -0.156** -0.054 0.057 0.081 0.080 0.110 -0.004 -0.085 RM1986 A -0.037 0.042 -0.112 0.159** -0.145* -0.027 -0.122* 0.073 -0.052 -0.107 -0.056 B -0.111 0.061 -0.062 0.012 0.008 0.238** 0.117* -0.017 0.080 0.053 0.139* C -0.111 0.061 -0.062 0.012 0.008 0.238** 0.117* -0.017 0.080 0.053 0.139* D -0.034 -0.174** -0.003 -0.126* -0.072 0.059 0.042 -0.066 -0.006 0.105 0.083 E 0.009 0.084 0.059 0.099 0.101 0.003 0.066 -0.071 0.009 0.105 0.136* F 0.046 -0.101 0.062 0.074 -0.060 -0.189** -0.075 -0.094 -0.113 0.026 -0.123* RM3466 A -0.020 -0.208** -0.346** 0.104 -0.117* -0.110 -0.040 -0.146* -0.110 0.168** 0.049 B -0.226** -0.040 -0.155** 0.268** -0.144* -0.040 -0.380** -0.195** -0.404** -0.030 0.276** C 0.181** 0.039 0.241** 0.289** 0.113 0.034 0.346** 0.236** 0.402** -0.060 -0.272** D 0.048 0.200** 0.138* 0.031 0.132* 0.112 -0.020 -0.060 -0.050 0.020 0.067 RM3525 A 0.079 0.151* 0.130* -0.040 0.236** 0.089 0.124* 0.115 0.161** -0.060 -0.143* B -0.060 0.022 -0.142* -0.030 -0.100 -0.070 -0.050 -0.110 -0.110 0.065 0.071 C -0.121* -0.080 0.004 -0.002 -0.030 -0.010 -0.060 -0.060 -0.080 -0.010 0.073 D -0.080 0.157** -0.040 0.140* -0.126* 0.029 -0.020 0.048 0.015 -0.100 -0.003 E -0.040 0.127* -0.050 0.075 -0.030 0.042 -0.050 0.133* 0.040 -0.050 0.090 RM3643 A 0.180** -0.196** 0.171** -0.208** 0.103 0.092 0.248** 0.090 0.243** 0.043 -0.090 B -0.090 0.202** 0.136* -0.159** 0.073 0.144* 0.211** 0.052 0.192** 0.076 0.017 C -0.040 0.241** 0.135* -0.030 0.237** -0.003 0.159** 0.214** 0.245** -0.080 -0.206** D -0.100 -0.020 0.058 -0.010 0.031 0.005 -0.070 0.006 -0.050 -0.020 0.075 E 0.228** -0.386** -0.060 -0.178** -0.127* -0.050 0.115 0.036 0.110 0.009 -0.155** F -0.050 0.244** 0.077 0.016 0.057 0.081 0.073 0.033 0.074 0.038 0.042 G 0.013 0.241** 0.056 0.087 0.136* -0.060 0.038 0.095 0.084 -0.060 -0.177** H -0.020 -0.010 -0.080 0.095 -0.110 -0.050 -0.268** -0.090 -0.258** -0.110 0.114 I -0.309** 0.052 -0.010 0.126* 0.042 0.103 -0.135* -0.166** -0.199** 0.101 0.331** RM3855 A -0.273** 0.205** 0.067 0.204** 0.096 0.060 0.036 -0.070 -0.020 0.098 0.092 B -0.030 0.004 -0.030 -0.020 -0.040 0.004 0.030 -0.080 -0.020 0.013 0.109 C 0.031 -0.100 -0.163** 0.067 -0.151* -0.204** -0.228** -0.169** -0.273** 0.016 -0.030 D -0.040 -0.030 -0.002 0.075 -0.030 -0.050 -0.020 -0.127* -0.090 0.118* 0.129* E 0.041 -0.040 -0.170** 0.171** -0.144* -0.040 -0.260** -0.128* -0.273** -0.010 0.068 F 0.176** -0.050 0.202** -0.321** 0.154** 0.114 0.237** 0.319** 0.364** -0.146* -0.185** G 0.107 -0.117* -0.149* 0.034 -0.100 -0.129* -0.050 -0.070 -0.080 0.087 -0.110 RM5481 A -0.259** -0.002 -0.123* 0.149* -0.090 0.010 -0.267** -0.175** -0.307** -0.030 0.334** B -0.100 -0.136* -0.310** 0.331** -0.245** -0.251** -0.347** -0.238** -0.401** -0.001 0.137* C 0.044 -0.117* -0.362** 0.166** -0.359** -0.313** -0.245** -0.118* -0.256** -0.026 -0.151* D 0.050 0.230** 0.112 -0.030 0.097 0.056 0.229** 0.150* 0.262** 0.014 -0.187** E 0.166** -0.040 0.315** -0.349** 0.243** 0.214** 0.308** 0.205** 0.353** 0.006 -0.125* RM5611 A 0.078 -0.070 -0.249** 0.253** -0.276** -0.295** -0.305** -0.110 -0.296** -0.070 -0.060 B -0.030 -0.060 -0.010 0.011 0.067 -0.010 0.091 -0.010 0.066 0.057 -0.040 C -0.060 0.058 0.173** -0.266** 0.108 0.193** 0.074 0.146* 0.142* -0.090 0.026 D 0.051 0.009 -0.080 0.192** -0.030 -0.030 0.015 -0.154** -0.080 0.173** 0.081 RM6089 A -0.151* -0.138* -0.409** 0.342** -0.281** -0.269** -0.407** -0.271** -0.469** 0.015 0.140* B -0.134* -0.020 0.020 0.046 0.002 0.011 -0.010 -0.060 -0.040 0.048 0.154** C -0.030 -0.002 0.002 0.036 0.069 0.050 0.012 -0.010 0.005 0.021 0.018 D 0.173** 0.124* 0.352** -0.329** 0.205** 0.204** 0.349** 0.252** 0.414** -0.030 -0.163** RM3394 A 0.093 -0.070 -0.070 0.043 -0.090 -0.100 -0.060 0.022 -0.030 -0.050 -0.185** B 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