苎麻ABC转运蛋白基因家族鉴定及其镉胁迫表达模式分析

顾一舟, 颜世伟, 朱爱国, 陈坤梅, 陈佳, 陈继康, 高钢, 王晓飞, 吴独清, 杨桢, 陈平

Identification of the ABC Transporter Protein Gene Family and Expression Pattern Analysis under Cadmium Stress in Ramie (Boehmeria nivea)

Gu Yizhou, Yan Shiwei, Zhu Aiguo, Chen Kunmei, Chen Jia, Chen Jikang, Gao Gang, Wang Xiaofei, Wu Duqing, Yang Zhen, Chen Ping

表2 苎麻ABC转运蛋白家族成员理化性质及亚细胞定位预测

Table 2 Physicochemical properties and subcellular localization prediction of ABC transporter family members in B. nivea

基因名称 Gene name 氨基酸数目 Number of amino acids 分子量 Molecular weight (Da) 理论等电点 Theoretical pI 不稳定指数 Instability index 脂肪族指数 Aliphatic index 总平均亲水范围 Grand average of hydropathicity 亚细胞定位 Subcellular localization BnABC1 329 35 786.23 5.85 57.57 102.55 -0.005 叶绿体 BnABC10 1067 119 303.23 9.05 43.89 87.47 -0.183 细胞膜 BnABC100 829 93 102.28 9.23 38.57 88.77 -0.115 细胞膜 BnABC101 1471 165 685.83 7.53 39.45 95.03 0.068 细胞膜 BnABC102 1443 163 270.31 7.88 40.00 96.80 0.052 细胞膜 BnABC103 2121 237 315.39 8.52 36.70 89.50 -0.025 细胞膜 BnABC104 954 105 228.38 8.05 37.90 92.65 0.077 细胞膜 BnABC105 698 78 573.22 9.29 36.90 92.11 -0.027 叶绿体 BnABC106 966 108 062.89 8.49 36.90 95.51 0.088 细胞膜 BnABC107 630 68 252.87 7.71 31.98 109.97 0.142 细胞膜 BnABC108 1279 138 484.91 8.31 33.28 101.16 0.153 细胞膜 BnABC109 229 25 909.59 9.62 42.20 108.17 -0.089 叶绿体 BnABC11 761 83 637.71 9.57 47.15 97.56 0.148 细胞膜 BnABC110 266 29 190.96 6.61 28.42 114.29 -0.006 细胞质 BnABC111 1262 137 845.95 9.08 39.08 96.33 0.056 细胞膜 BnABC112 723 79 490.08 9.48 36.79 107.21 0.296 细胞膜 BnABC113 717 81 714.16 8.87 45.76 92.83 0.011 细胞膜 BnABC114 166 17 960.95 9.94 21.57 89.88 -0.040 叶绿体 BnABC115 299 33 831.50 9.58 33.39 96.82 0.419 细胞膜 BnABC116 718 79 999.54 5.72 36.10 82.47 -0.607 细胞质 BnABC117 677 75 129.64 8.52 42.43 89.07 0.020 细胞膜 BnABC118 748 82 933.77 8.81 41.33 91.32 0.054 细胞膜 BnABC119 118 12 434.19 9.24 35.33 72.54 -0.464 细胞膜 BnABC12 707 76 741.94 6.11 34.37 100.01 0.176 细胞膜 BnABC120 507 57 192.68 8.86 42.30 92.64 0.180 细胞膜 BnABC121 150 15 627.12 4.77 46.07 64.87 -0.413 细胞质 BnABC122 724 80 566.04 8.64 42.66 90.43 0.044 细胞膜 BnABC123 605 68 253.71 8.03 32.14 95.65 -0.224 细胞质 BnABC124 456 50 255.76 9.76 51.31 85.13 0.071 细胞膜 BnABC125 173 18 659.63 9.65 24.18 90.75 0.025 叶绿体 BnABC126 1427 160 469.18 8.02 40.79 100.37 0.124 细胞膜 BnABC127 1399 157 363.60 6.89 40.44 99.35 0.136 细胞膜 BnABC128 1437 162 922.61 7.80 40.48 91.60 0.036 细胞膜 BnABC129 700 76 959.98 9.41 40.54 92.23 0.041 细胞膜 BnABC13 764 83 866.95 9.57 47.00 97.43 0.151 细胞膜 BnABC130 700 78 410.17 9.16 45.41 92.87 0.057 细胞膜 BnABC131 1838 205 293.03 7.08 36.32 93.85 0.040 细胞膜 BnABC132 96 10 344.68 9.21 62.96 76.15 -0.417 细胞质 BnABC133 633 71 347.54 9.08 44.09 99.30 0.221 细胞膜 BnABC134 1931 215 756.59 6.80 34.86 95.94 0.090 细胞膜 BnABC135 2192 243 148.60 5.98 42.72 83.95 -0.238 细胞质 BnABC136 639 70 662.25 9.25 37.76 110.23 0.164 细胞膜 BnABC137 1359 153 858.44 6.01 36.70 96.40 0.120 细胞膜 BnABC138 1361 153 484.27 8.47 38.00 93.09 0.084 细胞膜 BnABC139 790 89 381.72 6.74 35.00 96.03 0.196 细胞膜 BnABC14 1107 123 621.15 9.08 43.53 88.63 -0.182 细胞膜 BnABC140 1325 144 689.71 8.17 35.93 94.44 0.034 细胞膜 BnABC141 1063 118 402.84 9.71 56.10 80.15 -0.283 细胞膜 BnABC142 693 75 861.19 8.29 41.79 97.37 0.047 细胞膜 BnABC143 956 107 912.18 8.17 43.32 104.93 0.076 细胞膜 BnABC15 1985 216 409.71 9.22 46.55 85.36 -0.291 细胞膜 BnABC16 654 73 534.47 8.47 39.94 105.63 0.140 细胞膜 BnABC17 1499 169 483.22 8.69 39.44 88.01 0.000 细胞膜 BnABC18 1456 161 252.28 7.68 40.35 109.08 0.235 细胞膜 BnABC19 1374 149 492.74 9.02 42.61 92.08 -0.031 细胞膜 BnABC2 329 35 802.29 5.85 56.98 102.55 0.005 叶绿体 BnABC20 1410 157 000.54 6.22 43.16 105.17 0.221 细胞膜 BnABC21 1427 161 808.11 8.82 42.61 91.87 0.006 细胞膜 BnABC22 1414 159 175.66 6.68 35.91 92.18 0.043 细胞膜 BnABC23 661 71 375.06 8.86 38.29 99.03 0.096 细胞膜 BnABC24 1647 184 320.56 6.16 36.09 102.40 0.070 液泡 BnABC25 1623 182 766.32 7.78 41.35 104.74 0.043 液泡 BnABC26 1504 168 461.41 8.94 39.25 106.43 0.113 液泡 BnABC27 585 65 618.21 6.50 31.46 77.68 -0.394 叶绿体 BnABC28 1249 134 406.97 8.84 40.52 108.29 0.245 细胞膜 BnABC29 346 37 862.32 6.47 42.50 90.38 -0.158 叶绿体 BnABC3 691 77 745.35 5.87 42.27 97.50 -0.122 细胞膜 BnABC30 598 67 041.82 6.11 35.72 90.90 -0.332 叶绿体 BnABC31 687 76 115.42 9.03 45.07 100.17 0.207 细胞膜 BnABC32 1113 122 855.57 9.03 37.63 87.01 -0.105 细胞膜 BnABC33 597 66 855.55 6.03 35.26 91.39 -0.326 细胞质 BnABC34 695 76 990.44 8.94 44.15 100.00 0.204 细胞膜 BnABC35 1171 129 630.69 9.06 36.60 88.11 -0.091 细胞膜 BnABC36 1325 149 128.21 9.31 47.67 98.91 -0.075 细胞膜 BnABC37 702 78 293.93 9.11 40.28 88.63 0.055 细胞膜 BnABC38 678 75 331.68 9.15 44.01 97.05 0.168 细胞膜 BnABC39 1521 171 581.56 8.99 39.39 93.57 0.024 细胞膜 BnABC4 704 78 327.37 8.98 39.53 95.28 0.110 细胞膜 BnABC40 750 82 406.44 9.47 33.27 95.08 -0.015 细胞膜 BnABC41 1365 153 898.34 7.35 42.98 96.29 -0.038 细胞膜 BnABC42 1454 164 236.73 7.17 43.02 98.25 0.016 细胞膜 BnABC43 331 36 795.42 8.29 46.73 93.99 -0.220 细胞质 BnABC44 680 75 770.76 7.96 35.20 95.32 0.167 细胞膜 BnABC45 707 78 368.68 8.53 33.30 94.47 0.130 细胞膜 BnABC46 663 74 173.97 8.97 39.05 98.07 0.108 细胞膜 BnABC47 715 77 839.38 6.23 34.38 100.66 0.189 细胞膜 BnABC48 1411 155 935.63 6.14 48.48 101.51 0.065 细胞膜 BnABC49 663 74 157.97 8.97 39.70 98.07 0.106 细胞膜 BnABC5 715 77 465.97 9.42 35.64 102.81 0.154 细胞膜 BnABC50 1409 158 669.39 8.86 37.04 94.46 0.095 细胞膜 BnABC51 1440 162 701.85 7.06 33.05 90.81 0.034 细胞膜 BnABC52 1399 157 653.09 8.78 35.94 94.44 0.099 细胞膜 BnABC53 1440 162 826.11 7.06 32.81 90.40 0.033 细胞膜 BnABC54 1443 163 131.34 7.27 33.61 90.46 0.018 细胞膜 BnABC55 1526 169 520.35 7.30 36.66 103.86 0.122 细胞膜 BnABC56 1451 160 926.16 7.26 34.36 102.72 0.100 细胞膜 BnABC57 611 68 341.51 9.09 50.23 104.84 0.195 细胞膜 BnABC58 604 64 942.14 8.18 31.59 109.35 0.241 细胞膜 BnABC59 1253 136 569.98 8.43 36.26 99.73 0.122 细胞膜 BnABC6 618 68 677.07 9.00 47.24 116.13 0.378 细胞膜 BnABC60 1416 161 136.58 8.77 39.93 93.06 -0.027 细胞膜 BnABC61 1214 138 282.66 8.14 39.33 96.43 0.037 细胞膜 BnABC62 275 29 914.70 8.97 36.90 96.80 0.304 细胞膜 BnABC63 401 44 158.42 9.41 32.76 106.48 0.143 细胞膜 BnABC64 138 15 331.65 8.84 32.18 89.06 -0.234 细胞膜 BnABC65 1240 133 857.61 7.05 41.09 97.89 0.089 细胞膜 BnABC66 1294 141 492.68 8.52 45.09 94.91 0.006 细胞膜 BnABC67 472 51 962.45 6.44 41.60 95.21 -0.062 细胞膜 BnABC68 658 73 509.27 9.44 43.50 109.53 0.086 细胞膜 BnABC69 160 18 189.44 5.41 43.29 120.62 0.080 细胞膜 BnABC7 399 44 315.80 5.56 43.81 96.04 -0.049 细胞膜 BnABC70 265 29 216.26 9.04 52.27 98.72 0.325 细胞膜 BnABC71 1318 143 829.35 8.67 43.37 93.56 -0.005 细胞膜 BnABC72 1498 167 470.87 6.63 32.82 108.15 0.256 细胞膜 BnABC73 1140 128 564.11 7.57 39.56 105.86 0.117 细胞膜 BnABC74 1485 166 786.94 7.69 40.34 106.67 0.201 细胞膜 BnABC75 1228 134 490.45 8.61 35.05 103.88 0.114 细胞膜 BnABC76 478 51 808.60 6.03 50.00 85.46 -0.260 叶绿体 BnABC77 709 79 001.04 5.70 37.13 89.79 -0.263 叶绿体 BnABC78 1518 168 062.72 8.07 37.84 105.61 0.204 细胞膜 BnABC79 108 12 443.61 5.00 41.89 112.04 -0.203 细胞质 BnABC8 1473 164 206.31 8.23 36.14 103.61 0.136 细胞膜 BnABC80 284 31 495.17 6.08 47.56 91.62 -0.132 细胞质 BnABC81 1505 168 501.65 8.39 37.23 103.36 0.163 细胞膜 BnABC82 675 74 654.83 7.98 37.69 92.92 0.036 细胞膜 BnABC83 150 16 509.76 4.87 42.84 94.93 -0.099 细胞质 BnABC84 731 79 316.15 8.76 39.43 92.38 -0.029 细胞膜 BnABC85 264 29 407.77 5.34 37.81 93.11 -0.035 细胞膜 BnABC86 605 68 280.74 7.80 36.37 95.34 -0.230 细胞质 BnABC87 304 34 736.06 9.20 37.45 107.11 0.373 高尔基体 BnABC88 716 78 153.08 9.07 36.99 93.80 0.087 细胞膜 BnABC89 461 51 398.71 8.97 39.00 105.75 0.258 细胞膜 BnABC9 1263 139 196.94 8.78 43.68 101.41 0.045 细胞膜 BnABC90 1252 137 490.25 9.36 37.03 97.84 0.042 细胞膜 BnABC91 1426 159 285.37 8.40 35.73 104.87 0.102 细胞膜 BnABC92 1208 131 757.85 9.15 38.42 96.67 0.061 细胞膜 BnABC93 1422 161 910.16 8.18 39.01 93.65 0.067 细胞膜 BnABC94 602 67 293.34 8.97 42.36 103.90 0.228 细胞膜 BnABC95 1422 161 910.20 8.30 38.77 93.52 0.065 细胞膜 BnABC96 1281 137 921.08 8.71 34.63 99.32 0.135 细胞膜 BnABC97 1281 138 054.31 8.65 35.15 100.01 0.146 细胞膜 BnABC98 723 80 728.35 6.40 39.43 86.13 -0.451 细胞质 BnABC99 1248 135 387.58 8.60 33.95 107.35 0.208 细胞膜