苎麻ABC转运蛋白基因家族鉴定及其镉胁迫表达模式分析

顾一舟, 颜世伟, 朱爱国, 陈坤梅, 陈佳, 陈继康, 高钢, 王晓飞, 吴独清, 杨桢, 陈平

Identification of the ABC Transporter Protein Gene Family and Expression Pattern Analysis under Cadmium Stress in Ramie (Boehmeria nivea)

Gu Yizhou, Yan Shiwei, Zhu Aiguo, Chen Kunmei, Chen Jia, Chen Jikang, Gao Gang, Wang Xiaofei, Wu Duqing, Yang Zhen, Chen Ping

表3 苎麻物种内同源基因对的Ka/Ks计算

Table 3 Ka/Ks calculation for homologous gene pairs within B. nivea

序号 Number 基因名称1 Gene name 1 基因名称2 Gene name 2 基因复制类型 Types of gene replication Ka Ks Ka/Ks 选择类型 Selective type 1 BnABC10 BnABC14 全基因组或基因片段复制 0.0029 0.0311 0.0920 纯化选择 2 BnABC13 BnABC141 全基因组或基因片段复制 0.1916 1.0169 0.1885 纯化选择 3 BnABC10 BnABC35 全基因组或基因片段复制 0.2404 2.0903 0.1150 纯化选择 4 BnABC12 BnABC47 全基因组或基因片段复制 0.0101 0.0303 0.3348 纯化选择 5 BnABC7 BnABC72 全基因组或基因片段复制 0.1770 3.4031 0.0520 纯化选择 6 BnABC107 BnABC58 全基因组或基因片段复制 0.1285 1.8864 0.0681 纯化选择 7 BnABC114 BnABC125 全基因组或基因片段复制 0.0160 0.0432 0.3707 纯化选择 8 BnABC115 BnABC124 全基因组或基因片段复制 0.0000 0.0135 0.0000 纯化选择 9 BnABC117 BnABC119 全基因组或基因片段复制 0.2610 0.4263 0.6123 纯化选择 10 BnABC126 BnABC21 全基因组或基因片段复制 0.2313 2.3434 0.0987 纯化选择 11 BnABC130 BnABC132 全基因组或基因片段复制 0.0423 0.0287 1.4705 正向选择 12 BnABC131 BnABC134 全基因组或基因片段复制 0.0014 0.0095 0.1495 纯化选择 13 BnABC137 BnABC52 全基因组或基因片段复制 0.2119 2.0754 0.1021 纯化选择 14 BnABC137 BnABC50 全基因组或基因片段复制 0.2114 2.1753 0.0972 纯化选择 15 BnABC30 BnABC33 全基因组或基因片段复制 0.0051 0.0222 0.2298 纯化选择 16 BnABC31 BnABC34 全基因组或基因片段复制 0.0026 0.0265 0.0971 纯化选择 17 BnABC32 BnABC35 全基因组或基因片段复制 0.0008 0.0132 0.0601 纯化选择 18 BnABC50 BnABC52 全基因组或基因片段复制 0.0028 0.0369 0.0770 纯化选择 19 BnABC44 BnABC45 全基因组或基因片段复制 0.0272 0.0660 0.4118 纯化选择 20 BnABC46 BnABC49 全基因组或基因片段复制 0.0027 0.0320 0.0828 纯化选择 21 BnABC63 BnABC70 全基因组或基因片段复制 0.2962 1.9769 0.1498 纯化选择 22 BnABC57 BnABC94 全基因组或基因片段复制 0.2845 2.7581 0.1032 纯化选择 23 BnABC87 BnABC88 全基因组或基因片段复制 0.0043 0.0325 0.1340 纯化选择 24 BnABC84 BnABC85 全基因组或基因片段复制 0.0039 0.0138 0.2830 纯化选择 25 BnABC93 BnABC95 全基因组或基因片段复制 0.0009 0.0119 0.0777 纯化选择 26 BnABC96 BnABC97 全基因组或基因片段复制 0.0031 0.0185 0.1673 纯化选择