作物杂志, 2019, 35(3): 66-72 doi: 10.16035/j.issn.1001-7283.2019.03.011

遗传育种·种质资源·生物技术

工业大麻雄性相关RAPD和SCAR标记的筛选与鉴定

姜颖1,2, 冯乃杰2, 王晓楠1, 韩喜财1, 韩承伟1, 赵越1, 曹焜1, 孙宇峰1, 李振伟1

1 黑龙江省科学院大庆分院,163319,黑龙江大庆

2 黑龙江八一农垦大学农学院,163319,黑龙江大庆

Screening and Identification of Male-Specific RAPD and SCAR Markers in Cannabis sativa L. (Industrial Hemp)

Jiang Ying1,2, Feng Naijie2, Wang Xiaonan1, Han Xicai1, Han Chengwei1, Zhao Yue1, Cao Kun1, Sun Yufeng1, Li Zhenwei1

1 Daqing Branch of Heilongjiang Academy of Sciences, Daqing 163319, Heilongjiang, China

2 College of Agronomy, Heilongjiang Bayi Agricultural University, Daqing 163319, Heilongjiang, China

通讯作者: 孙宇峰为通信作者,研究员,研究方向为大麻育种;李振伟为共同通信作者,高级农艺师,研究方向为麻类遗传育种

收稿日期: 2018-11-7   修回日期: 2019-02-25   网络出版日期: 2019-06-15

基金资助: 黑龙江省科学院院长基金.  YZ2018DQ02
黑龙江省青年科学基金.  QC2016037

Received: 2018-11-7   Revised: 2019-02-25   Online: 2019-06-15

作者简介 About authors

姜颖,助理研究员,研究方向为大麻遗传育种; 。

摘要

利用42条RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)随机扩增引物分析工业大麻品种“火麻一号”组成的雄性或雌性DNA池(DNA pools),结果显示,引物OPV-08扩增得到一条大小为869bp与工业大麻雄性相关的特异条带。根据测序结果,合成了两条SCAR(Sequence Characterized Amplified Region)标记引物,该SCAR标记不仅可以对工业大麻雌雄异株材料花期已知性别的雌雄植株进行准确鉴定,还可以对幼苗期未知性别的大麻雌雄植株进行鉴定;也可对雌雄同株材料可能出现的雄化进行早期鉴定。这不仅为工业大麻早期性别鉴定提供基础,且为减少雌雄同株材料的雄化提供支撑。

关键词: 工业大麻 ; 性别鉴定 ; 雄性 ; RAPD ; SCAR

Abstract

The male DNA pools or female DNA pools of "Huoma No.1" were analyzed respectively by 42 RAPD random amplified primers. The results showed that a male-specific DNA fragment with a length of 869bp was amplified by OPV-08. Two SCAR primers were constructed according to the sequencing results. The primers of SCAR marker could identify the different genders of hemp not only in the known sex plants at flowering stage but also in the unknown sex seedlings at seedling stage. That could also be used for early identification of the appearance of male plant in monoecious industrial hemp. This provides a basis for early sex identification of industrial hemp, also provides support for reducing the appearance of male plant in monoecious industrial hemp.

Keywords: Cannabis sativa L. (industrial hemp) ; Sex identification ; Male ; RAPD (random amplified polymorphic DNA) ; SCAR (sequence characterized amplified region)

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本文引用格式

姜颖, 冯乃杰, 王晓楠, 韩喜财, 韩承伟, 赵越, 曹焜, 孙宇峰, 李振伟. 工业大麻雄性相关RAPD和SCAR标记的筛选与鉴定[J]. 作物杂志, 2019, 35(3): 66-72 doi:10.16035/j.issn.1001-7283.2019.03.011

Jiang Ying, Feng Naijie, Wang Xiaonan, Han Xicai, Han Chengwei, Zhao Yue, Cao Kun, Sun Yufeng, Li Zhenwei. Screening and Identification of Male-Specific RAPD and SCAR Markers in Cannabis sativa L. (Industrial Hemp)[J]. Crops, 2019, 35(3): 66-72 doi:10.16035/j.issn.1001-7283.2019.03.011

大麻(Cannabis Sativa L.)是大麻科(Cannabinaceae)大麻属(Cannabis)一年生草本植物,采用欧盟的划分标准即:四氢大麻酚(THC)<0.3%为无毒大麻即工业大麻,世界各国都只允许种植工业大麻。工业大麻是我国传统经济作物,在我国已有5000多年的栽培利用历史[1,2]。工业大麻是一种多用途、多功能作物,为大量传统和创新的工农业等提供原料[3,4]。按照品种群体中植株的性别类型分类,工业大麻分为雌雄异株和雌雄同株,其中雌雄异株工业大麻的生物量大、产量高、抗逆性强,雌雄同株工业大麻成熟期一致,便于机械化收获。

对于雌雄异株工业大麻来说,大麻的雌雄植株的功能有所不同,一般来说,大麻雄性植株的纤维质量高于雌性植株,雄性植株可为纺织厂或造纸厂提供更好的纤维材料,就成熟期而言,雄性植株较雌性植株先成熟,不便于机械化收割[5,6,7]。另一方面,雌性植株可以收获种子,在医药、人类食品、动物饲料和身体护理产品等方面得到应用[7];且有研究认为雌性植株中THC和大麻二酚(CBD)含量相对较高[8],具有更高的药用价值。大麻雌雄株在幼苗时期较难分辨,只有当植株生殖器官(即花器官)原基开始发育时才能正确识别,所以最好的解决办法之一就是可以早期鉴定出雌雄株,以便于充分利用其经济价值[9]。工业大麻良种繁育时,为了收获种子,减少雄株率,可以通过早期性别鉴定选择雌雄株比例。杂交育种选择雌雄异株材料作为亲本时,也可通过早期性别鉴定选择需要的材料。

雌雄同株工业大麻新品种选育是现阶段研究的热点[10],但是大麻的性别分化受遗传物质和环境因子的双重调控,导致雌雄同株工业大麻的性别不稳定[11],早期性别鉴定可以及早发现雄化植株,提高雌雄同株率。

因此,亟待对工业大麻性别分化及分子遗传机理进行深入研究,为工业大麻早期性别鉴定及其性别表达和调控的分子机制研究奠定理论基础。利用RAPD(随机扩增多态性DNA)分子标记技术研究工业大麻性别连锁特异标记,为工业大麻早期性别鉴定提供基础,且为减少雌雄同株工业大麻材料的雄化提供技术支撑。

1 材料与方法

1.1 试验材料

试验选用雌雄异株工业大麻品种“火麻一号”(以下用HM1表示)进行RAPD和SCAR标记的筛选;鉴定方面选用的资源材料有:雌雄异株材料,花期取样的6个材料HM1、SH2(黑龙江省地方品种绥化-2)、WD2(皖大麻2号)、LJ(黑龙江省地方品种龙江)、BQ(黑龙江省地方品种拜泉)、LB(山西省地方品种绿宝)的雌株和雄株;苗期随机取样的2个材料QM1(庆大麻1号)、JM1(吉林省地方品种柳河大麻);1个雌雄同株材料USO-14;所有材料均由黑龙江省科学院大庆分院亚麻综合利用研究所提供。

1.2 工业大麻性别的RAPD分子标记

2017年将HM1的种子播种于黑龙江省春雷农场温室中,常规田间种植管理;2018年于HM1花期分别取雌株和雄株的幼嫩叶片,在黑龙江省科学院大庆分院麻类作物实验室,利用优化的SDS法[12]提取基因组DNA。然后,取10株雄性植株大麻的单个DNA样品进行等量混合组成雄性DNA池;取10株雌性植株大麻的单个DNA样品进行等量混合组成雌性DNA池,-20℃保存备用。

以HM1的雌株和雄株DNA池为模板,反应体系总体积为20.0µL,其中ddH2O为8.0µL,2×Taq Master Mix(ProbeGene公司)为10.0µL,DNA为1.0µL,引物(10µmol/L)为1.0µL。反应条件为94℃预变性5min;94℃变性1min;36℃复性1min;72℃延伸2min;共进行35个循环;再72℃延伸5min;反应结束后保存于4℃。所选引物[13]表1所示。

表1   RAPD随机引物及核苷酸序列(5′-3′)

Table 1  The random primers used in amplification and their sequences (5′-3′)

引物Primer序列Sequence引物Primer序列Sequence引物Primer序列Sequence
OPH-18GAATCGGCCAOPP-08ACATCGCCCAOPZ-06GTGCCGTTCA
OPI-07CAGCGACAAGOPP-11AACGCGTCGGOPZ-13GACTAAGCCC
OPO-10TCAGAGCGCCOPP-12AAGGGCGAGTOPU-05TTGGCGGCCT
OPO-12CAGTGCTGTGOPP-15GGAAGCCAACOPU-12TCACCAGCCA
OPO-15TGGCGTCCTTOPP-16CCAAGCTGCCOPU-15ACGGGCCAGT
OPY-05GGCTGCGACAOPP-17TGACCCGCCTOPU-16CTGCGCTGGA
OPY-11AGACGATGGGOPS-11AGTCGGGTGGOPR-08CCCGTTGCCT
OPY-15AGTCGCCCTTOPS-17TGGGGACCACOPR-12ACAGGTGCGT
OPY-16GGGCCAATGTOPS-19GAGTCAGCAGOPR-13GGACGACAAG
OPT-07GGCAGGCTGTOPX-12TCGCCAGCCAOPV-06ACGCCCAGGT
OPT-08AACGGCGACAOPX-13ACGGGAGCAAOPV-07GAAGCCAGCC
OPT-13AGGACTGCCAOPX-17GACACGGACCOPV-08GGACGGCGTT
OPQ-05CCGCGTCTTGOPW-09GTGACCGAGTOPV-10GGACCTGCGT
OPQ-12AGTAGGGCACOPW-16CAGCCTACCAOPV-17ACCGGCTTGT

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1.3 工业大麻特异DNA片段胶回收产物测序

利用上海生工生物工程股份有限公司的SanPrep柱式DNA胶回收试剂盒回收特异片段,样品用封口膜密封后送于上海生工生物工程股份有限公司进行DNA测序。

1.4 特异性引物设计及SCAR分子标记

根据DNA测序结果设计特异性引物OPV-08F:5′-GGACGGCGTTCCAAACGA-3′,OPV-08R:5′-GGACGGCGTTGGTTGAAATG-3′。

提取鉴定方面所用材料的基因组DNA,并以DNA为模板进行PCR扩增。反应体系总体积为25.0µL,其中ddH2O为10.5µL,2×Taq Master Mix(ProbeGene公司)为12.5µL,DNA为1.0µL,OPV-08F为0.5µL,OPV-08R为0.5µL。反应条件为94℃预变性3min;94℃变性1min;36℃复性1min;72℃延伸2min;共进行35个循环;再72℃延伸5min;反应结束后保存于4℃。1.0%琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增结果。

2 结果与分析

2.1 DNA的提取

由于大麻含酚类化合物较多(目前已报道的有70多种)[14],在DNA的提取过程中极容易被氧化[15],本试验利用优化的SDS法[12]可获得用于RAPD及SCAR标记筛选与鉴定中所需的DNA样品(图1)。

图1

图1   DNA提取

M,分子量标准1kb plus;1~2,HM1的雌株;3~4,HM1的雄株;5,SH2的雌株;6,SH2的雄株;7,WD2的雌株;8,WD2的雄株;9,LJ的雌株;10,LJ的雄株;11,BQ的雌株;12,BQ的雄株;13,LB的雌株;14,LB的雄株;15~16,苗期QM1的叶片;17~18,苗期JM1的叶片;19,雌雄同株材料USO-14

Fig.1   DNA extraction in industrial hemp

M, DNA marker is 1kb plus DNA ladder; 1-2, The female of HM1; 3-4, The male of HM1; 5, The female of SH2; 6, The male of SH2; 7, The female of WD2; 8, The male of WD2; 9, The female of LJ; 10, The male of LJ; 11, The female of BQ; 12, The male of BQ; 13, The female of LB; 14, The male of LB; 15-16, The leaves of QM1 at seedling stage; 17-18, The leaves of JM1 at seedling stage; 19, Monoecism industrial hemp USO-14


2.2 工业大麻性别的RAPD分子标记

以HM1的雌雄株DNA池为模板,分别用上述42条RAPD引物进行PCR扩增,扩增产物经电泳后进行分析筛选。结果发现,引物OPV-08(5′-GGACGGCGTT-3′)在雄性工业大麻植株中扩增出1条>750bp的特异性条带,条带明显,且稳定性高(图2)。

图2

图2   引物OPV-08对工业大麻HM1雌雄株DNA池的PCR扩增结果

箭头表示在>750bp处有雄性特异片段;分子量标准D2000 DNA ladder

Fig.2   PCR amplification with the DNA pools of female and male plants in industrial hemp HM1 using primer OPV-08

Arrow indicate that there is a male specific fragment at>750bp; DNA marker is D2000 DNA ladder


2.3 工业大麻雄性特异DNA片段胶回收产物及测序结果

2.3.1 工业大麻雄性特异DNA片段胶回收产物 采用SanPrep柱式DNA胶回收试剂盒回收雄性特异片段,并用1.0%的琼脂糖凝胶电泳检测,回收条带清晰(图3),无杂质,可用于DNA测序。

图3

图3   雄性特异DNA片段回收结果

Fig.3   Gel recovery of male specific DNA fragments


2.3.2 雄性特异片段测序结果 将PCR胶回收产物送于上海生工生物工程股份有限公司进行DNA测序,得到相关序列并进行分析,通过DNAMAN进行序列分析显示该雄性特异片段共869bp,属于非编码序列。EditSeq软件分析发现其碱基组成为:A 26.18%、G 24.57%、T 26.76%、C 22.49%(图4)。

图4

图4   雄性特异片段核苷酸序列

Fig.4   The nucleotide sequences of male specific DNA fragments


2.4 工业大麻性别的SCAR分子标记开发与鉴定

2.4.1 OPV-08特异片段的SCAR分子标记引物设计及检测 为了将工业大麻雄性的RAPD分子标记转化为更加稳定的SCAR分子标记,根据随机引物OPV-08扩增得到的雄性特异片段的序列分别设计18和20个碱基的正反向引物,正向引物的序列为5′-GGACGGCGTTCCAAACGA-3′;反向引物的序列为5′-GGACGGCGTTGGTTGAAATG-3′。用这两条正反向引物对HM1不同性别植株的DNA进行PCR扩增,得到了一条雄性SCAR分子标记(图5)。

图5

图5   HM1雄性的SCAR分子标记

分子量标准D2000 DNA ladder

Fig.5   SCAR molecular markers of HM1 male

DNA marker is D2000 DNA ladder


2.4.2 SCAR分子标记检测花期雌雄异株工业大麻性别 为了验证在工业大麻品种HM1中所获得的SCAR分子标记也适用于其他雌雄异株品种的雌雄株,用该标记检测包含HM1在内的6个已知雌雄株的雌雄异株工业大麻(图6),结果表明,此SCAR分子标记同样可以应用到其他雌雄异株材料花期的性别鉴定。

图6

图6   SCAR分子标记对6个雌雄异株工业大麻的雌雄株检测结果

1~6分别为HM1、SH2、WD2、LJ、BQ、LB;分子量标准D2000 DNA ladder

Fig.6   Detection of male and female plants in six dioecious industrial hemp by SCAR molecular markers

1-6 are HM1, SH2, WD2, LJ, BQ, LB, respectively; DNA marker is D2000 DNA ladder


2.4.3 SCAR分子标记检测苗期雌雄异株工业大麻性别 为了验证在工业大麻品种HM1中所获得的SCAR分子标记同样也适用于苗期未知性别的大麻,用该标记检测工业大麻材料QM1和JM1,分别随机选取6株QM1、JM1的幼苗,提取DNA进行验证,结果(图7)表明,QM1材料中2、5为雄株,JM1材料中2、4、5为雄株,并经花期调查验证,所得结果与花期雌雄株分化结果一致,所以,获得的SCAR分子标记同样也适用于工业大麻的早期性别鉴定。

图7

图7   SCAR分子标记对2个雌雄异株工业大麻苗期的性别检测结果

分子量标准D2000 DNA ladder

Fig.7   Sex detection of dioecious industrial hemp at seedling stage by SCAR molecular markers

DNA marker is D2000 DNA ladder


2.4.4 SCAR分子标记在雌雄同株工业大麻上的分析 为了分析该SCAR分子标记在雌雄同株工业大麻上的应用,用该标记检测随机选取的5株雌雄同株材料USO-14叶片的DNA,结果表明,在>750bp处无条带(图8),上述结果表明该SCAR分子标记可以作为雌雄同株材料雄化的早期鉴定,即可在现蕾期之前发现可能分化的雄株材料并提早去除,以提高雌雄同株率。

图8

图8   SCAR分子标记分析雌雄同株工业大麻

分子量标准D2000 DNA ladder

Fig.8   Analysis of SCAR molecular markers in monoecism industrial hemp

DNA marker is D2000 DNA ladder


3 结论与讨论

RAPD是以PCR技术为基础的分子标记,它是以基因组DNA为模板,采用一个随机的通常为10bp的寡聚核苷酸序列作引物[16]。Pauls等[17]利用RAPD分子标记识别苜蓿的种群关系;李向勇等[18]利用RAPD分子标记分析鸭拓草的遗传多样性;陈永胜等[19]对蓖麻单雌性状的RAPD反应体系进行优化;笔者也利用RAPD分子标记分析了EMS诱变使工业大麻在基因上发生的变化[20]

但是RAPD对反应条件敏感,重复性和稳定性较差[21],所以常转化成SCAR分子标记,SCAR分子标记则是在原RAPD引物基础上向内延伸10个左右碱基,并用此引物检测基因组DNA,若能扩增出原位点的片段,说明SCAR试验成功[22,23],比RAPD和其他利用随机引物的标记方法可靠性高,重复性好,且在基因定位和作图中的应用效果更好[24,25]。RAPD与SCAR分子标记技术在植物的性别标记方面的研究已有较多报道[26,27,28,29]

工业大麻的性别鉴定是工业、农业和医学应用中的一个重要问题,因为在实践中,雄性和雌性植株分别有着不同的作用[30]。国内外研究人员也将RAPD与SCAR分子标记技术应用于工业大麻的性别研究。Mandolino等[31]利用RAPD技术从大麻中获得一个400bp与雄性表型相关的标记。陈其军等[32]利用S401引物扩增得到长度约为2.5kb的雄性相关片段。Shao等[30]利用15个RAPD随机引物进行扩增,引物OPA-04和OPF-05扩增得到3个雌性相关片段。李仕金等[9]利用200条RAPD随机引物进行扩增,引物S208扩增得到一条大小为429bp与大麻雄性相关的特异条带。本研究以“火麻一号”为试验材料,利用RAPD与SCAR分子标记技术,由OPV-08扩增获得一条大小为869bp与工业大麻雄性相关的特异条带。经雌雄异株材料花期雌、雄单株验证,该条带只在雄性单株中稳定出现;经雌雄异株材料苗期随机取材进行验证,该条带也只在雄性单株中稳定出现;经雌雄同株材料验证,未发现该条带。由上述鉴定的结果可以得出,该条带只在雄株材料中特异表达,在雌株材料和雌雄同株材料中未出现该条带,且扩增结果表现为非特异表达。进一步表明本研究获得的雄性特异标记,不仅可以用来鉴定工业大麻开花后的植株,也可鉴定苗期性别未知的植株,这为工业大麻早期性别鉴定提供了理论基础,为减少雌雄同株材料的雄化提供了技术支撑。

The authors have declared that no competing interests exist.
作者已声明无竞争性利益关系。

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利用随机扩增多态性DNA (randomamplifiedpolymorphicDNA ,RAPD)技术获得与大麻性别连锁的分子标记。将 10株雄性大麻或 10株雌性大麻的单个DNA样品等量混合分别组成雄性或雌性DNA池(DNA pool) ,以提供具有相同遗传背景的雌、雄性DNA样品。每个随机引物分别用三个不同的循环程序进行PCR扩增。在 30个随机引物中 ,用引物S40 1扩增得到一条约 2 .5kb雄性多态性片段。对该片段进行了克隆和序列分析 ,并根据序列分析结果将上述RAPD分子标记转化为重复性和特异性更好的SCAR(sequencecharacterizedamplifiedregions)分子标记

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