斑茅割手密复合体与甘蔗杂交后代F1改良效率分析
Analysis of the Improvement Efficiency of F1 Hybrids between Intergeneric Hybrid (Tripidium arundinaceum×Saccharum spontaneum) and Sugarcane
通讯作者:
收稿日期: 2024-09-3 修回日期: 2024-12-2 网络出版日期: 2025-02-06
基金资助: |
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Received: 2024-09-3 Revised: 2024-12-2 Online: 2025-02-06
作者简介 About authors
黄玉新,主要从事甘蔗遗传育种及种质资源创新利用研究,E-mail:
甘蔗近缘属/种植物斑茅和割手密含有丰富的抗逆性、强宿根性和广适应性等育种需求的优异基因。通过远缘杂交将斑茅和割手密血缘渗入甘蔗品种,为拓宽甘蔗遗传基础、提高其抵御重要病虫害能力和产量奠定基础。利用2对EST-SSR引物对甘蔗与斑茅割手密复合体杂交F1群体进行真实性鉴定,并对F1的农艺性状进行变异分析和聚类分析。结果表明,杂种F1表型和农艺性状均发生分离;F1群体株高、茎径、单茎重、有效茎数和锤度5个农艺性状变异范围在13.76%~33.51%;F1群体有效茎数平均值超越双亲,株高和茎径平均值分别大于或等于亲本平均值,单茎重和锤度平均值低于亲本平均值。聚类分析将68份真实的杂种F1分为4个类群,其中类群Ⅲ的221-79、221-103等11份材料在锤度、有效茎数等农艺性状上的综合表现优于其他类群。
关键词:
The exploration of stress-resistant, strong ratooning ability, and wide adaptability in related sugarcane species such as Tripidium arundinaceum and Saccharum spontaneum renders these species valuable genetic resources for sugarcane breeding. The incorporation of genes from T.arundinaceum and S.spontaneum into sugarcane cultivars via outcrossing promises to expand the genetic diversity of sugarcane, enhance resistance to key pests and diseases, and improve yield. This investigation employed two pairs of EST-SSR primers to confirm the authenticity of the F1 progeny resulting from the cross between sugarcane and the intergeneric hybrid (T.arundinaceum×S.spontaneum), and further analyzed the agronomic characteristics of their F1 generation. The F1 hybrids demonstrated segregation in both phenotypic and agronomic traits. The analysis revealed variability in five agronomic traits - plant height, stalk diameter, single stalk weight, millable stalk number, and brix ranged from 13.76% to 33.51% in the F1 population. The average millable stalk number in the F1 population exceeded that of both parents, while mean plant hight was greater than and stalk diameter equal to the parental averages. The mean single stem weight and brix value were lower than that of the parental average. A total of 68 genuine hybrid F1 were divided into four groups through cluster analysis. Among them, 11 materials such as 221-79 and 221-103 in Group Ⅲ showed better comprehensive performance in agronomic traits such as brix and millable stalk number compared with other groups.
Keywords:
本文引用格式
黄玉新, 张革民, 周珊, 段维兴, 杨翠芳, 高轶静, 张保青.
Huang Yuxin, Zhang Gemin, Zhou Shan, Duan Weixing, Yang Cuifang, Gao Yijing, Zhang Baoqing.
现代甘蔗品种主要来源于种间杂交,其原始亲本主要包括甘蔗属内少数几个热带种、印度种、中国种、细茎野生种和大茎野生种等,狭窄的遗传基础造成后代群体变异不足,甘蔗品种遗传改良进展缓慢。远缘杂交是种质创新的主要途径之一,在甘蔗品种改良中扮演着重要角色。
斑茅(Tripidium arundinaceum)隶属于禾本科(Graminaceae)蔗茅属,具有改良现有甘蔗品种抗逆性、宿根性、适应性和生长势等农艺性状的潜力。近几十年,世界各国育种家开展了较多斑茅创新利用研究[9
1 材料与方法
1.1 试验材料
表1 68份真实的杂种F1名称
Table 1
编号 Code | 名称 Name | 编号 Code | 名称 Name | 编号 Code | 名称 Name | 编号 Code | 名称 Name | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 221-2 | 18 | 221-30 | 35 | 221-68 | 52 | 221-94 | |||
2 | 221-5 | 19 | 221-31 | 36 | 221-71 | 53 | 221-95 | |||
3 | 221-9 | 20 | 221-35 | 37 | 221-74 | 54 | 221-96 | |||
4 | 221-10 | 21 | 221-36 | 38 | 221-76 | 55 | 221-98 | |||
5 | 221-12 | 22 | 221-38 | 39 | 221-77 | 56 | 221-99 | |||
6 | 221-13 | 23 | 221-42 | 40 | 221-79 | 57 | 221-100 | |||
7 | 221-15 | 24 | 221-45 | 41 | 221-80 | 58 | 221-103 | |||
8 | 221-16 | 25 | 221-46 | 42 | 221-81 | 59 | 221-104 | |||
9 | 221-18 | 26 | 221-48 | 43 | 221-82 | 60 | 221-106 | |||
10 | 221-19 | 27 | 221-49 | 44 | 221-83 | 61 | 221-107 | |||
11 | 221-22 | 28 | 221-50 | 45 | 221-85 | 62 | 221-108 | |||
12 | 221-23 | 29 | 221-51 | 46 | 221-86 | 63 | 221-110 | |||
13 | 221-25 | 30 | 221-52 | 47 | 221-87 | 64 | 221-113 | |||
14 | 221-26 | 31 | 221-62 | 48 | 221-88 | 65 | 221-114 | |||
15 | 221-27 | 32 | 221-63 | 49 | 221-89 | 66 | 221-115 | |||
16 | 221-28 | 33 | 221-66 | 50 | 221-90 | 67 | 221-119 | |||
17 | 221-29 | 34 | 221-67 | 51 | 221-93 | 68 | 221-120 |
1.2 试验方法
1.2.1 DNA提取及PCR扩增
采用CTAB法提取杂交后代新鲜嫩叶基因组DNA,用QUAWELL Q5000微量紫外分光光度计对提取的DNA质量和纯度进行测定。将样品DNA浓度稀释到40 ng/L,置于-20 ℃冰箱保存备用。使用课题组通过甘蔗转录组数据库设计筛选出的2对EST-SSR正反引物ESTC50-F:5′-TCTGGGGCCATGGAAGTTGA-3′,ESTC50-R:5′-CAAGATGGTGACCCCGCAACTA- 3′;ESTC95-F:5′-TGTGCTCAAACAATGGGTAAT CA-3′,ESTC95-R:5′-GCTTTGCCGCTTCCAGTT TCAC-3′进行PCR扩增。PCR反应体系20 μL,包括10×Buffer(含2 mmol/L MgCl2)2.0 μL,dNTP(10 mmol/L)0.4 μL,上、下游引物(10 μmol/L)各1.0 μL,DNA样品40 ng,Tag DNA聚合酶1 U,ddH2O补足至20 μL。扩增程序:95 ℃预变性5 min;94 ℃ 30 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,进行35个循环;72 ℃延伸5 min,扩增产物在7%聚丙烯酰胺凝胶上电泳分离,用硝酸银染色观察。
1.2.2 杂交后代真实性鉴定
1.3 试验设计
在广西壮族自治区农业科学院甘蔗研究所隆安丁当基地进行F1群体农艺性状分析。试验材料于2022年4月5日种植,采用随机区组设计,小区行长3 m,行距1.2 m,下种量10芽/m,设3次重复,田间管理与大田生产一致。
1.4 数据处理
于2022年11月8-11日,调查株高、茎径、有效茎数(大于1 m的蔗茎)和锤度等农艺性状,单茎重(kg)=0.7854×茎径2×株高/1000,每个材料调查20株。采用Excel 2010对各农艺性状指标的原始数据进行整理分析,采用SPSS 17.0软件计算各农艺性状的平均值、标准差和变异系数,采用DPS 18.05软件中欧氏距离、离差平方和法进行聚类分析。
2 结果与分析
2.1 杂种后代真实性鉴定分析
图1
图1
部分F1后代引物ESTC50鉴定结果
M:600 bp DNA marker;♀:YT93-159;♂:GXAS07-6-1,1~72为F1后代。下同。
Fig.1
Identification of primer ESTC50 in part of F1 progeny
M: 600 bp DNA marker; ♀: YT93-159; ♂: GXAS07-6-1, 1-72 are F1 progeny. The same below.
图2
图2
部分F1后代引物ESTC95鉴定结果
Fig.2
Identification of primer ESTC95 in part of F1 progeny
2.2 亲本及F1形态学差异比较
经观察比较(图3),母本YT93-159叶片宽大,蔗茎青绿色,无气根,花粉育性偏低。父本GXAS07-6-1叶片比较细长,形似割手密,蔗茎曝光前为黄绿色,曝光后为黄色,有气根,花粉育性较好。杂交F1后代叶片变宽,变化幅度大,但均略小于母本,茎色与母本一致,部分后代有气根,花粉育性发生分离,但总体较低。F1群体遗传了野生种易开花的习性,大部分材料在广西南宁地区11月底或12月初孕穗,12月中、下旬抽穗开花,不同材料花期略有差异。
图3
图3
亲本及F1后代形态学差异比较
(a) 叶片,(b) 蔗茎,(c) 花粉染色率。
Fig.3
Comparison of morphological differences between parents and F1 progeny
(a) Leaf, (b) Cane, (c) Pollen staining rate.
2.3 亲本及F1群体农艺性状的变异分析
变异分析(表2)表明,F1群体株高、茎径、单茎重、有效茎数和锤度5个农艺性状均存在不同程度的变异,变异范围在13.76%~33.51%,其中单茎重变异系数最大,其次是有效茎数,茎径的变异系数最小,表明斑割F1群体在产量相关性状离散程度较大,可以在群体内进行优良个体选择。
表2 亲本与F1后代农艺性状比较
Table 2
性状 Trait | 亲本Parent | F1群体F1 population | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
YT93-159 | GXAS07-6-1 | 平均值Mean | 范围Range | 平均值±标准差Mean±SD | 变异系数CV (%) | ||
株高Plant height (cm) | 275.4 | 172.0 | 223.7 | 162.0~282.0 | 230.0±33.0 | 14.36 | |
茎径Stalk diameter (cm) | 2.87 | 0.82 | 1.85 | 1.41~2.38 | 1.84±0.26 | 13.76 | |
单茎重Single stalk weight (kg) | 1.43 | 0.09 | 0.76 | 0.30~1.10 | 0.63±0.21 | 33.51 | |
有效茎数Millable stalk number | 28.0 | 35.0 | 31.5 | 16.3~59.7 | 35.6±11.2 | 33.10 | |
锤度Brix (%) | 20.4 | 10.7 | 15.6 | 8.6~16.6 | 11.6±2.3 | 19.85 |
对亲本与F1群体农艺性状数据进行比较,亲本YT93-159和GXAS07-6-1各性状差异比较明显,特别是茎径、单茎重和锤度。F1群体株高、茎径和单茎重较父本GXAS07-6-1有较大改良,群体株高和有效茎数超过了母本YT93-159,但茎径、单茎重和锤度与母本YT93-159的差距仍较大。
2.4 F1群体聚类分析
图4
表3 4个类群主要农艺性状表现
Table 3
性状 Trait | 类群Group | |||
---|---|---|---|---|
Ⅰ | Ⅱ | Ⅲ | Ⅴ | |
株高Plant height (cm) | 215.0 | 249.0 | 245.0 | 218.0 |
茎径Stalk diameter (cm) | 1.66 | 2.05 | 1.75 | 1.91 |
单茎重Single stalk weight (kg) | 0.47 | 0.83 | 0.59 | 0.63 |
有效茎数Millable stalk number | 39.5 | 33.6 | 44.9 | 26.7 |
锤度Brix (%) | 10.5 | 11.4 | 13.1 | 12.4 |
3 讨论
3.1 甘蔗杂种真实性鉴定
杂交子代早期鉴定能够缩短育种年限,加快育种进程。因此,杂种的真伪性鉴定是甘蔗远缘杂交利用过程中非常重要的工作。现代甘蔗品种主要含有热带种、印度种、割手密等3~5个原种血缘,即使是自交后代,也会分离出野生特性,从表型上难以判断是否为真实的杂种后代。因此,根据甘蔗植株的株高、株型、节间形状、节间颜色、节间长度、叶片大小、叶姿、叶色、芽形、芽位、芽沟、花序性状、花絮颜色以及脱叶性、气根有无、叶背鞘毛群多少等形态特征[24]鉴定的结果并不准确。分子标记可以从DNA分子水平上获得最直接的证据,是杂种鉴定比较高效的手段。田春艳等[25]运用SSR标记对3个割手密F1群体进行鉴定,3个组合的真杂种率分别为67.77%、75.51%和75.66%。陆鑫等[22]选用4对引物对62份滇蔗茅杂交F1代进行SSR分子标记鉴定,结果表明,62份杂交后代全部为真杂种。本研究所选用的2对EST-SSR引物在双亲之间均具有多态性,扩增条带清晰,鉴定效率为56.67%。本研究鉴定效率略低于前人[25],原因可能是引物多态性不够丰富或斑割复合体远缘杂交结实率不够高,侧面反映出斑割复合体的创新利用还需要提高效率,同时也需要开发适用于鉴定斑割复合体后代的特异引物。
3.2 甘蔗创新种质后代农艺性状的遗传变异分析
研究性状遗传变异规律对筛选优良杂交后代具有重要意义。农艺性状的变异系数越大,从该群体选出优良个体的概率就越大[26]。杨翠芳等[27]研究表明,割手密F1群体锤度的变异系数最小(5.52%)。靳铎等[28]研究发现,19份甘蔗与蔗茅BC1、F1材料单茎重变异系数最大(49.91%),叶长变异系数最小(13.69%)。滇蔗茅F1的8个数量性状的变异幅度在11.9%~43.2%,平均变异系数为22.3%,其中有效茎数、单茎重、茎径、株高和糖分的变异系数分别是43.2%、29.0%、12.5%、11.9%和29.8%[29]。俞华先等[30]研究表明,不同亲本组合的云南割手密F2创新种质的变异系数存在较大差异。本研究中,单茎重的变异系数最大,为33.51%,有效茎数的变异系数次之,为33.10%,茎径变异系数最低,为13.76%,与前人[28-
前人[15,31-32]在斑茅的利用中发现F1一般表现为小茎,易开花,花期较早,无或少花粉,蒲心,斑茅杂交后代真实率低,糖分和单茎重普遍偏低,糖分恢复效率低于割手密。也有研究[33]表明,斑茅F1有效茎数较多,锤度略低于亲本的平均值,茎径平均值远小于双亲茎径的平均值。本研究发现,斑茅割手密复合体F1杂种真实率较高,花粉育性发生分离,可获得少数花粉好的材料。F1群体在株高和有效茎数上出现超越亲本的杂交后代,茎径大小介于双亲之间,单茎重和锤度平均值低于亲本的平均值。本研究结果与前人[32-33]研究结果略有不同,表明利用斑茅割手密复合体与甘蔗杂交,可获得兼具斑茅和割手密优点的材料,这有利于加快斑茅的利用效率。
3.3 F1群体聚类分析
3.4 染色体数量与农艺性状相关性分析
4 结论
120份甘蔗与斑茅割手密复合体杂交F1真实杂种有68份,占56.67%。杂种F1表型和农艺性状均发生分离,产量相关性状改良较快,糖分改良较慢。F1群体单茎重及有效茎数较株高、茎径和锤度有较大的变异。类群Ⅲ的221-79、221-103等11份材料在锤度、有效茎数等农艺性状上的综合表现优于其他类群,后续可重点关注和利用。
参考文献
A review of recent molecular genetics evidence for sugarcane evolution and domestication
崖城系列亲本在我国甘蔗育种中的利用效果
中国本土割手密血缘创新亲本材料的利用潜力分析
我国本土割手密育成品种的亲缘关系分析
台湾的野生蔗及其在甘蔗杂交育种上的应用
Genetic confirmation and field performance comparison for yield and quality among advanced generations of Erianthus arundinaceus, E.bengalense and Saccharum spontaneum cyto-nuclear genome introgressed sugarcane intergeneric hybrids
Cytogenetic and agronomic characterization of intergeneric hybrids between Saccharum spp
Biomass potential of novel interspecific and intergeneric hybrids of Saccharum grown in sub-tropical climates
Genome-wide association study unravels quantitative trait loci and genes associated with yield-related traits in sugarcane
Characterization of chromosome inheritance of the intergeneric BC2 and BC3 progeny between Saccharum spp. and Erianthus arundinaceus
甘蔗(Saccharum)与斑茅(Erianthus arundinaceus)远缘杂交利用研究
甘蔗野生种滇蔗茅种质创新利用研究Ⅰ.甘蔗与滇蔗茅远缘杂交F1群体构建与SSR分子标记鉴定
甘蔗野生种割手密杂交F1代SSR鉴定和遗传分析
DOI:10.3969/j.issn.1000-2561.2022.10.007
[本文引用: 2]
割手密具有宿根性好、抗逆性强和适应性广等特性,是甘蔗育种中利用最多,育种成效最显著的野生种。进一步发掘和利用割手密优良抗逆基因资源对现代甘蔗品种改良具有重要意义。为获得更多优良割手密的真实杂交后代,本研究以2个地方种为母本、3个野生割手密为父本进行杂交,获得3个F<sub>1</sub>群体,共359份杂交后代。并从21对SSR标记中筛选出在双亲中具有多态性且扩增条带清晰的6对SSR标记,基于高通量的荧光毛细管电泳检测平台进行杂交后代真实性鉴定、亲本指纹图谱分析、遗传相似性分析和特异性条带的遗传分析。结果表明:共筛选出的6对SSR标记对5个亲本材料的分辨率较高,扩增多态性好,每个亲本都具有其特异的SSR指纹,可有效鉴定其杂交后代血缘的真实性;其中,359份F<sub>1</sub>个体中共鉴定出真杂种262份,3个组合的真杂种率分别为67.77%、75.51%、75.66%,平均值为72.98%。遗传相似性分析表明2个地方种的遗传相似性系数为0.70,3个割手密两两间的遗传相似性系数分别为0.53、0.60和0.70,地方种和割手密间为0.38~0.53,种间遗传相似性系数小于种内。亲本特异性SSR位点的遗传分析结果表明,3个组合的母本特异性条带遗传率分别为68.47%、80.96%、73.39%,平均值为74.27%,而父本特异性条带遗传率分别为58.90%、76.60%、61.45%,平均值为65.65%,杂交后代具有偏母本遗传倾向,因此,在甘蔗杂交育种中应选择综合农艺性状较好的材料作为母本。本研究结果为今后割手密杂交后代的鉴定提供了高效、可靠的SSR标记选择,同时鉴定出的真实割手密后代群体可为开展割手密优异性状的遗传研究提供种质材料,为选育超亲遗传株系提供科学依据。
基于表型和细胞学的甘蔗与蔗茅杂交BC1F1子代的遗传差异
甘蔗野生种滇蔗茅利用研究Ⅲ.滇蔗茅杂种F1群体的表型变异与遗传多样性分析
DOI:10.13430/j.cnki.jpgr.2013.04.028
[本文引用: 1]
选用8个数量性状和18个质量性状对滇蔗茅杂种F1群体的表型变异、多样性及聚类关系进行分析。结果表明:数量性状的遗传变异主要来自于有效茎、单茎重及糖分;质量性状的叶鞘背毛群与内叶耳形状多样性丰富,根点排列、芽位、茎形、节间性状、生长裂缝等5个性状均表现一致;聚类分析表明62份后代材料可分为4大类群和10个亚类群。遗传多样性和聚类分析为杂交后代的筛选及其杂交或回交利用提供了科学依据。
云南八倍体割手密84-268血缘F2群体表型多样性分析
DOI:10.3969/j.issn.1000-2561.2023.01.006
[本文引用: 2]
本研究以100份云南八倍体割手密84-268血缘F<sub>2</sub>群体创新种质为材料,对其株高、茎径、锤度、有效茎数、单茎重、蔗茎产量和糖产量等7个主要农艺性状进行频率分布直方图分析、遗传多样性分析、相关分析、主成分分析和聚类分析。结果表明:该群体的7个农艺性状数据表现出较好的正态分布、变异较丰富,变异系数在9.91%~50.76%之间,其中糖产量的变异系数最大达到50.76%;相关和逐步回归分析表明,蔗茎产量与株高、茎径和有效茎数呈极显著正相关,决定系数为0.9282;糖产量主要由株高、茎径、锤度、单茎重和有效茎数5个因素决定,决定系数为0.9160;主成分分析将7个农艺性状综合为3个主要成分,其累积贡献率达86.985%,其中第一主成分即蔗茎产量糖分因子是最重要的因子,其贡献率达47.615%;在欧氏距离为6.00处将100份创新材料分为3类,结果与主成分得分结果一致,其中第Ⅰ类群的7个性状指标均优异,共筛选出15个优质材料,其主成分综合得分较高,尤其值得关注的是云割F<sub>2</sub>18-226-7、云割F<sub>2</sub>18-226-14、云割F<sub>2</sub>18-226-89、云割F<sub>2</sub>18-226-48、云割F<sub>2</sub>18-226-96、云割F<sub>2</sub>18-226-21、云割F<sub>2</sub>18-226-43和云割F<sub>2</sub>18-226-5等8份材料,可以进一步筛选作为亲本材料或后备核心种质。
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