构建黍授分子遗传图谱ssR引物的筛选

摘要/Abstract

摘要： 采用SSR-PCR扩增技术，将实验室利用高通量测序与磁珠富集法结合开发得到的1210对黍援SSR引物进行筛选，筛选出在会宁大黄糜、陇糜8号、太原55号和会宁野糜子4个泰援品种之间表现出条带清晰、多态性明显、重复性较好的引物;并通过提取DNA以及PCR过程中退火温度的简单优化来建立比较适宜的泰援SSR分子标记反应体系。结果表明，在DNA提取过程中将ddH20的量减少到100μL，增加65℃的水浴时间并增加4%β-筑基乙醇和DNA浓度等可以获得较高质量的DNA。利用优化好的反应体系从1210对SSR引物中筛选出116对多态性较好的引物，占总数的9.59%，其中，群体一的2个亲本所特有的引物有36对，群体二的2个亲本中特有的引物有97对，2个群体共有的多态性引物有19对;对引物碱基结构分析发现，选用的1210对引物中有1173个双碱基重复SSR和36个三碱基重复SSR;筛选到的多态性引物中双碱基重复SSR有102个。三碱基重复SSR有14个。筛选出的多态性SSR标记能用于泰援的遗传多样性和群体遗传结构研究。

关键词: 泰援, SSR标记, 引物筛选, 遗传图谱

王银月, 刘敏轩, 陆平, 等. 构建黍授分子遗传图谱ssR引物的筛选[J]. 作物杂志, 2014 (4): 32–38

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