基于DUS测试性状的马铃薯品种遗传多样性及性状相关性分析
Genetic Diversity and Trait Correlation Analysis of Potato Varieties Based on DUS Testing Traits
通讯作者:
收稿日期: 2025-02-13 修回日期: 2025-05-6 网络出版日期: 2025-07-18
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Received: 2025-02-13 Revised: 2025-05-6 Online: 2025-07-18
作者简介 About authors
寇淑君,主要从事植物新品种DUS测试和种质资源研究,E-mail:
为优化马铃薯DUS测试审查并为马铃薯新品种选育提供表型选择的指导,依据马铃薯DUS测试指南,采集了226份马铃薯DUS测试品种的44个性状数据,并对其进行多样性、相关性和聚类等综合分析。结果表明,所有性状平均多样性指数为1.1721,变幅为0.0000~1.9668,其中多样性指数>1.0000的性状有32个。部分性状分布集中,莲座状叶顶部绒毛只有9级代码,而90.1%的马铃薯品种其植株顶部叶片无花青甙显色。相关性分析揭示,花青甙显色相关的几组性状间存在极显著正相关,花冠内侧花青甙显色强度与花冠内侧花青甙显色扩展范围存在极显著正相关,相关系数为0.97。聚类分析将226个品种分成5类,植株顶部叶片花青甙显色和块茎表皮颜色可有效用于分组。
关键词:
To optimize the evaluation of potato DUS (distinctness, uniformity, and stability) testing and provide guidance for phenotypic selection in new potato variety breeding, data on 44 traits from 226 potato DUS test varieties were collected, and comprehensive analyses including diversity, correlation, and clustering were conducted. The results showed that average diversity index was 1.1721, ranging from 0.0000 to 1.9668, with 32 traits having a diversity index greater than 1.0000, indicating relatively high variability. However, some traits exhibited highly concentrated distributions. Pubescence on the top of rosette leaves had only nine grade code, and 90.1% of the varieties exhibited no anthocyanin coloration in the top leaves of plants. Correlation analysis revealed that several groups of traits related to anthocyanin coloration had highly significant positive correlations. Intensity of anthocyanin coloration on the inner side of the corolla was extremely significantly positively correlated with extent of anthocyanin coloration distribution on the inner corolla, with a correlation coefficient of 0.97. Cluster analysis divided the 226 varieties into five groups. Anthocyanin coloration of the top leaves and tuber skin color can be effectively used for grouping.
Keywords:
本文引用格式
寇淑君, 王瑶, 付国庆, 纪军建, 霍阿红, 陈令玮, 左振兴.
Kou Shujun, Wang Yao, Fu Guoqing, Ji Junjian, Huo Ahong, Chen Lingwei, Zuo Zhenxing.
马铃薯是世界第四大主粮作物,在保障国家粮食安全、促进农业经济发展方面起着至关重要的作用[1]。我国马铃薯种植面积约占世界种植面积的1/4,是马铃薯第一生产和消费大国,2023年我国马铃薯种植面积为453.3万hm2,总产量9539万t[2]。优良品种是马铃薯产业的基础支撑,为保护育种者权利,推动马铃薯育种创新,促进产业发展,1999年4月马铃薯被列入首批植物新品种保护名录[3],我国也于1999年加入国际植物新品种保护联盟(International Union for the Protection of New Varieties of Plants,UPOV)。植物品种应具备特异性(distinctness)、一致性(uniformity)和稳定性(stability)[4]。DUS测试是品种管理中重要的技术手段,也是品种保护、品种审定和品种登记的法定要求[5]。
植物品种功能是否具备DUS,必须根据相应植物品种DUS测试指南或技术标准进行种植试验或实验室检测[6]。2018年《植物品种特异性、一致性和稳定性测试指南 马铃薯》(GB/T 19557.28- 2018)[7]发布,此后我国马铃薯DUS测试均采用此国家标准,性状是植物品种DUS测试审查的基础,测试指南中性状的选择和评价对DUS测试审查的准确性和高效性至关重要。目前相关文献主要从形态学指标[8-9]、分子标记[10-11]和生化标记[12]等方面分析马铃薯品种遗传多样性,利用DUS测试性状对培育品种进行描述和评价的研究较少。本研究依据马铃薯DUS测试指南中的测试性状,对226份马铃薯品种进行综合分析,旨在筛选出高效的DUS测试指标,为测试机构开展马铃薯DUS测试提供科学有效的评价方法,同时为育种工作者提供多样化的育种策略。
1 材料与方法
1.1 试验材料
试验所用的226份马铃薯品种均由农业农村部植物新品种测试张家口分中心提供(表1,编号末尾字母A代表测试品种,B代表近似品种),于2022-2023年集中种植在张家口市农业科学院坝上试验基地(41°1′ N,114°7′ E)。
表1 参试马铃薯品种
Table 1
| 序号Number | 测试编号Test code | 序号Number | 测试编号Test code | 序号Number | 测试编号Test code | 序号Number | 测试编号Test code |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 20191000536A | 58 | 20201006210A | 115 | 20211001099A | 172 | 20211002878A |
| 2 | 20191000536B | 59 | 20201006210B | 116 | 20211001099B | 173 | 20211002880A |
| 3 | 20191000725B | 60 | 20201006405A | 117 | 20211001106A | 174 | 20211003333A |
| 4 | 20212002746A | 61 | 20201006405B | 118 | 20211001106B | 175 | 20211003334A |
| 5 | 20212002747A | 62 | 20201006564A | 119 | 20211001156A | 176 | 20211003357A |
| 6 | 20212002748A | 63 | 20201006565A | 120 | 20211001156B | 177 | 20211003466A |
| 7 | 20205003298A | 64 | 20201006566A | 121 | 20211002781A | 178 | 20211003469A |
| 8 | 20205250019A | 65 | 20201006567A | 122 | 20211002794A | 179 | 20211004386A |
| 9 | 20205250029A | 66 | 20201006569A | 123 | 20211002794B | 180 | 2021101995A |
| 10 | 20205250030A | 67 | 20201006570A | 124 | 20211002828A | 181 | 2021102722A |
| 11 | 20205250134A | 68 | 20201006574A | 125 | 20211002832A | 182 | 2021102724A |
| 12 | 20205250134B | 69 | 20201006575A | 126 | 20211002837A | 183 | 2021104232A |
| 13 | 20205250141A | 70 | 20201006576A | 127 | 20211002837B | 184 | 2021104238A |
| 14 | 20205250232A | 71 | 20201007296A | 128 | 20211002866A | 185 | 2021104596A |
| 15 | 20205250232B | 72 | 20201007297A | 129 | 20211002869A | 186 | 2021104597A |
| 16 | 20205250246A | 73 | 20201007299A | 130 | 20211002870A | 187 | 2021104599A |
| 17 | 20205250247A | 74 | 20201007302A | 131 | 20211002871A | 188 | 2021104631A |
| 18 | 20191000726A | 75 | 20201007306A | 132 | 20211002876A | 189 | 2021104634A |
| 19 | 20191000726B | 76 | 20201007311A | 133 | 20211002879A | 190 | 20221000740A |
| 20 | 20191001291A | 77 | 20201007312A | 134 | 2021102556A | 191 | 20221000744A |
| 21 | 20191001291B | 78 | 20201007317A | 135 | 2021104057A | 192 | 20221000745A |
| 22 | 20191002286A | 79 | 20201007319A | 136 | 20225250440A | 193 | 20221000746A |
| 23 | 20191005418A | 80 | 20201007444A | 137 | 20215250059A | 194 | 20221000815A |
| 24 | 20191005423A | 81 | 20215250060A | 138 | 20225250433A | 195 | 20221000816A |
| 25 | 20191005423B | 82 | 20215250061A | 139 | 20225250434A | 196 | 20221001117A |
| 26 | 20191005700A | 83 | 20215250231A | 140 | 20225250436A | 197 | 20221001531A |
| 27 | 20191005700B | 84 | 20215250260A | 141 | 20225250437A | 198 | 20221001531B |
| 28 | 20191005701A | 85 | 20215250261A | 142 | 20225250438A | 199 | 20221001549A |
| 29 | 20201000398A | 86 | 20215250267A | 143 | 20225250438B | 200 | 20221001549B |
| 30 | 20201000399A | 87 | 20215250268A | 144 | 20225250442A | 201 | 20221001888A |
| 31 | 20201000399B | 88 | 20215250309A | 145 | 20225250444A | 202 | 20221001888B |
| 32 | 20201000400A | 89 | 20215250309B | 146 | 20225250445A | 203 | 20221001892A |
| 33 | 20201000899A | 90 | 20215250310A | 147 | 20225250446A | 204 | 20221001892B |
| 34 | 20201001073A | 91 | 20215250314A | 148 | 20225250447A | 205 | 20235250027A |
| 35 | 20201001904A | 92 | 20215250354A | 149 | 20225250448A | 206 | 20235250029A |
| 36 | 20201002074A | 93 | 20225250003A | 150 | 20225250449A | 207 | 20235250029B |
| 37 | 20201002074B | 94 | 20225250003B | 151 | 20225250450A | 208 | 20235250030A |
| 38 | 20201002075A | 95 | 20225250005A | 152 | 20225250451A | 209 | 20235250036A |
| 39 | 20201002075B | 96 | 20225250005B | 153 | 20225250460A | 210 | 20235250037A |
| 40 | 20222002546A | 97 | 20225250007A | 154 | 20211000476A | 211 | 20235250038A |
| 41 | 20222002558A | 98 | 20201003098A | 155 | 20211000476B | 212 | 20235250039A |
| 42 | 20222002559A | 99 | 20201007505A | 156 | 20211001441A | 213 | 20235250040A |
| 43 | 20222002651A | 100 | 20201007505B | 157 | 20211001441B | 214 | 20235250041A |
| 44 | 20201002964A | 101 | 20201007577A | 158 | 20211002776A | 215 | 20235250042A |
| 45 | 20201002965A | 102 | 20201007577B | 159 | 20211002784A | 216 | 20235250043A |
| 46 | 20201002965B | 103 | 20211000471A | 160 | 20211002787A | 217 | 20235250044A |
| 47 | 20201003101A | 104 | 20211000471B | 161 | 20211002826A | 218 | 20235250045A |
| 48 | 20201003666A | 105 | 20211000472A | 162 | 20211002827A | 219 | 20235250047A |
| 49 | 20201004176A | 106 | 20211000472B | 163 | 20211002831A | 220 | 20235250048A |
| 50 | 20201004176B | 107 | 20211000475A | 164 | 20211002833A | 221 | 20235250049A |
| 51 | 20201005837A | 108 | 20211000475B | 165 | 20211002834A | 222 | 20235250050A |
| 52 | 20201005838A | 109 | 20211000477A | 166 | 20211002835A | 223 | 20235250051A |
| 53 | 20201005839A | 110 | 20211000726A | 167 | 20211002867A | 224 | 20235250052A |
| 54 | 20201005840A | 111 | 20211000736A | 168 | 20211002868A | 225 | 20235250053A |
| 55 | 20201005841A | 112 | 20211000736B | 169 | 20211002873A | 226 | 20245250001A |
| 56 | 20201006142A | 113 | 20211000737A | 170 | 20211002874A | ||
| 57 | 20201006142B | 114 | 20211000737B | 171 | 20211002875A |
1.2 测试项目与方法
试验采用随机区组设计,共设2次重复,每小区51株,在马铃薯测试田块四周种植保护行,马铃薯的田间管理与当地大田生产管理方式保持一致。44个DUS测试性状(表2)的观测时期和观测方法等按照《植物品种特异性、一致性和稳定性测试指南 马铃薯》(GB/T 19557.28-2018)[7]标准进行,个体观测性状植株取样数量不少于20株,群体测量和群体目测性状需观测整个小区。性状类型包括质量性状(quality trait,QL)、假质量性状(false qualitative trait,PQ)和数量性状(quantitative trait,QN);观测方法分为群体测量(group measurement,MG)、个体测量(single measurement,MS)和群体目测(group visual observation,VG)。观测时期分为幼芽期(在规定光强和光谱范围的弱光条件下,幼芽生长8~10周)、现蕾期(花蕾超出顶叶的植株占小区总株数的75%以上)、开花期(第一花序有1~2朵花开放的植株占小区总株数的75%以上)和收获期。
表2 马铃薯DUS测试性状信息及观测方法
Table 2
| 编号 Code | 性状 Trait | 性状类型 Expression trait | 观测时期 Observation period | 观测方法 Observation method | 记载标准与分级 Record standard and classification |
|---|---|---|---|---|---|
| C1 | 光发芽:大小 | QN | 幼芽期 | VG | 1:极小;2:极小到小;3:小;4:小到中;5:中;6:中到大;7:大;8:大到极大;9:极大 |
| C2 | 光发芽:形状 | PQ | 幼芽期 | VG | 1:球形;2:卵形;3:圆锥形;4:粗圆柱形;5:细圆柱形 |
| C3 | 光发芽:基部花青甙显色强度 | QN | 幼芽期 | VG | 1:无或极弱;2:极弱到弱;3:弱;4:弱到中;5:中;6:中到强;7:强;8:强到极强;9:极强 |
| C4 | 光发芽:基部花青甙显色蓝色素比重 | QN | 幼芽期 | VG | 1:无或低;2:中;3:高 |
| C5 | 光发芽:基部茸毛 | QN | 幼芽期 | VG | 1:无或极少;2:极少到少;3:少;4:少到中;5:中;6:中到多;7:多;8:多到极多;9:极多 |
| C6 | 光发芽:顶部相对于基部大小 | QN | 幼芽期 | VG | 1:极小;2:极小到小;3:小;4:小到中;5:中;6:中到大;7:大;8:大到极大;9:极大 |
| C7 | 光发芽:顶部习性 | QN | 幼芽期 | VG | 1:并拢;2:并拢到半开展;3:半开展;4:半开展到开展;5:开展 |
| C8 | 光发芽:顶部花青甙显色强度 | QN | 幼芽期 | VG | 1:无或极弱;2:极弱到弱;3:弱;4:弱到中;5:中;6:中到强;7:强;8:强到极强;9:极强 |
| C9 | 光发芽:顶部茸毛 | QN | 幼芽期 | VG | 1:无或极少;2:极少到少;3:少;4:少到中;5:中;6:中到多;7:多;8:多到极多;9:极多 |
| C10 | 光发芽:根尖数量 | QN | 幼芽期 | VG | 1:无或极少;2:极少到少;3:少;4:少到中;5:中;6:中到多;7:多;8:多到极多;9:极多 |
| C11 | 光发芽:侧枝长度 | QN | 幼芽期 | VG | 1:极短;2:极短到短;3:短;4:短到中;5:中;6:中到长;7:长;8:长到极长;9:极长 |
| C12 | 植株:类型 | QN | 现蕾期 | VG | 1:茎型;2:中间型;3:叶型 |
| C13 | 植株:生长习性 | QN | 现蕾期 | VG | 1:直立;2:直立到半直立;3:半直立4:半直立到开展;5:开展 |
| C14 | 茎:花青甙显色强度 | QN | 现蕾期 | VG | 1:无或极弱;2:极弱到弱;3:弱;4:弱到中;5:中;6:中到强;7:强;8:强到极强;9:极强 |
| C15 | 茎:翼波状 | PQ | 现蕾期 | VG | 1:直形;2:微波形;3:波形 |
| C16 | 复叶:大小 | QN | 现蕾期 | VG/MS | 1:极小;2:极小到小;3:小;4:小到中;5:中;6:中到大;7:大;8:大到极大;9:极大 |
| C17 | 复叶:小叶排列状态 | QN | 现蕾期 | VG | 1:叠合;2:叠合到相接;3:相接;4:相接到相离;5:相离 |
| C18 | 复叶:小裂叶数量 | QN | 现蕾期 | VG/MS | 1:极少;2:极少到少;3:少;4:少到中;5:中;6:中到多;7:多;8:多到极多;9:极多 |
| C19 | 复叶:绿色程度 | QN | 现蕾期 | VG | 1:极浅;2:极浅到浅;3:浅;4:浅到中;5:中;6:中到深;7:深;8:深到极深;9:极深 |
| C20 | 复叶:主脉上表面花青甙显色强度 | QN | 现蕾期 | VG | 1:无或极弱;2:极弱到弱;3:弱;4:弱到中;5:中;6:中到强;7:强;8:强到极强;9:极强 |
| C21 | 小叶:顶小叶大小 | QN | 现蕾期 | VG | 1:极小;2:极小到小;3:小;4:小到中;5:中;6:中到大;7:大;8:大到极大;9:极大 |
| C22 | 小叶:联会频率 | QN | 现蕾期 | VG | 1:极低;2:极低到低;3:低;4:低到中;5:中;6:中到高;7:高;8:高到极高;9:极高 |
| C23 | 小叶:边缘波状程度 | QN | 现蕾期 | VG | 1:无或极弱;2:极弱到弱;3:弱;4:弱到中;5:中;6:中到强;7:强;8:强到极强;9:极强 |
| C24 | 小叶:光泽度 | QN | 现蕾期 | VG | 1:弱;2:中;3:强 |
| C25 | 叶:莲座状叶顶部绒毛 | QL | 现蕾期 | VG | 1:无;9:有 |
| C26 | 花蕾:花青甙显色强度 | QN | 现蕾期 | VG | 1:无或极弱;2:极弱到弱;3:弱;4:弱到中;5:中;6:中到强;7:强;8:强到极强;9:极强 |
| C27 | 植株:高度 | QN | 开花期 | VG/MG | 1:极矮;2:极矮到矮;3:矮;4:矮到中;5:中;6:中到高;7:高;8:高到极高;9:极高 |
| C28 | 植株:开花频率 | QN | 开花期 | VG | 1:无或极低;2:极低到低;3:低;4:低到中;5:中;6:中到高;7:高;8:高到极高;9:极高 |
| C29 | 植株:顶部叶片花青甙显色 | QL | 开花期 | VG | 1:无;9:有 |
| C30 | 花序:大小 | QN | 开花期 | VG | 1:极小;2:极小到小;3:小;4:小到中;5:中;6:中到大;7:大;8:大到极大;9:极大 |
| C31 | 花序:总梗花青甙显色强度 | QN | 开花期 | VG | 1:无或极弱;2:极弱到弱;3:弱;4:弱到中;5:中;6:中到强;7:强;8:强到极强;9:极强 |
| C32 | 花冠:大小 | QN | 开花期 | VG | 1:极小;2:极小到小;3:小;4:小到中;5:中;6:中到大;7:大;8:大到极大;9:极大 |
| C33 | 花冠:形状 | PQ | 开花期 | VG | 1:星形;2:近五边形;3:近圆形 |
| C34 | 花冠:内侧花青甙显色强度 | QN | 开花期 | VG | 1:无或极弱;2:极弱到弱;3:弱;4:弱到中;5:中;6:中到强;7:强;8:强到极强;9:极强 |
| C35 | 花冠:内侧花青甙显色蓝色素比重 | QN | 开花期 | VG | 1:无或低;2:中;3:高 |
| C36 | 花冠:内侧花青甙显色扩展范围 | QN | 开花期 | VG | 1:无或极小;2:极小到小;3:小;4:小到中;5:中;6:中到大;7:大;8:大到极大;9:极大 |
| C37 | 成熟期 | QN | 成熟期 | MG | 1:极早;2:极早到早;3:早;4:早到中;5:中;6:中到晚;7:晚;8:晚到极晚;9:极晚 |
| C38 | 块茎:形状 | PQ | 收获期 | VG | 1:圆形;2:短卵圆形;3:卵圆形;4:长卵圆形;5:长形;6:极长形 |
| C39 | 块茎:芽眼深度 | QN | 收获期 | VG | 1:极浅;2:极浅到浅;3:浅;4:浅到中;5:中;6:中到深;7:深;8:深到极深;9:极深 |
| C40 | 块茎:表皮光滑度 | QN | 收获期 | VG | 1:光滑;2:光滑到中等;3:中等;4:中等到粗糙;5:粗糙 |
| C41 | 块茎:表皮颜色 | PQ | 收获期 | VG | 1:浅黄色;2:黄色;3:浅红色;4:红色;5:部分红色;6:蓝色;7:部分蓝色;8:红褐色 |
| C42 | 块茎:芽眼基部颜色 | PQ | 收获期 | VG | 1:白色;2:黄色;3:红色;4:蓝色 |
| C43 | 块茎:薯肉颜色 | PQ | 收获期 | VG | 1:白色;2:乳白色;3:浅黄色;4:中等黄色;5:深黄色;6:红色;7:部分红色;8:蓝色;9:部分蓝色 |
| C44 | 块茎:光照后表皮花青甙显色强度 | QN | 收获期 | VG | 1:无或极弱;2:极弱到弱;3:弱;4:弱到中;5:中;6:中到强;7:强;8:强到极强;9:极强 |
1.3 数据处理
利用SPSS Statistics 26.0进行描述性统计分析,利用GraphPad Prism 8绘制频次分布图,利用Origin 2021绘制相关性热图和聚类分析图,利用Popgene 32软件分析不同性状的Shannonʼs多样性指数(H')[13]:H'=-ΣPiln(Pi),式中,Pi为某个性状第i个代码出现的概率。
2 结果与分析
2.1 基于DUS测试性状的遗传多样性分析
如表3所示,利用马铃薯DUS测试指南中的44个测试性状(C1~C44)对226份品种进行多样性分析,平均Shannonʼs多样性指数为1.1721,变幅为0.0000~1.9668。其中,光发芽顶部花青甙显色强度(C8)和光发芽基部花青甙显色强度(C3)多样性指数最高,分别为1.9668和1.9277。其次是块茎薯肉颜色(C43)、花蕾花青甙显色强度(C26)和成熟期(C37),多样性指数分别为1.8137、1.7614和1.7582。这5个性状在DUS测试特异性判定中可以充分加以利用。多样性指数>1.0000的性状有32个,表明226个马铃薯品种的遗传多样性比较丰富。多样性指数<0.5000的性状有4个,其中莲座状叶顶部绒毛(C25)只有1个表达状态,多样性指数为0.0000。在马铃薯品种DUS进行特异性判定时,应着重关注多样性指数较大的性状。
表3 观测性状的多样性指数
Table 3
| 编号 Code | 性状 Trait | 多样性指数 Diversity index | 编号 Code | 性状 Trait | 多样性指数 Diversity index |
|---|---|---|---|---|---|
| C1 | 光发芽:大小 | 1.3023 | C23 | 小叶:边缘波状程度 | 1.3294 |
| C2 | 光发芽:形状 | 1.1532 | C24 | 小叶:光泽度 | 0.2268 |
| C3 | 光发芽:基部花青甙显色强度 | 1.9277 | C25 | 叶:莲座状叶顶部绒毛 | 0.0000 |
| C4 | 光发芽:基部花青甙显色蓝色素比重 | 0.7823 | C26 | 花蕾:花青甙显色强度 | 1.7614 |
| C5 | 光发芽:基部茸毛 | 1.6709 | C27 | 植株:高度 | 1.2840 |
| C6 | 光发芽:顶部相对于基部大小 | 1.3349 | C28 | 植株:开花频率 | 1.5363 |
| C7 | 光发芽:顶部习性 | 1.2485 | C29 | 植株:顶部叶片花青甙显色 | 0.3232 |
| C8 | 光发芽:顶部花青甙显色强度 | 1.9668 | C30 | 花序:大小 | 1.0869 |
| C9 | 光发芽:顶部茸毛 | 1.5239 | C31 | 花序:总梗花青甙显色强度 | 1.4880 |
| C10 | 光发芽:根尖数量 | 1.3581 | C32 | 花冠:大小 | 0.9578 |
| C11 | 光发芽:侧枝长度 | 1.2352 | C33 | 花冠:形状 | 0.2053 |
| C12 | 植株:类型 | 0.5396 | C34 | 花冠:内侧花青甙显色强度 | 1.3408 |
| C13 | 植株:生长习性 | 0.6882 | C35 | 花冠:内侧花青甙显色蓝色素比重 | 0.6354 |
| C14 | 茎:花青甙显色强度 | 1.5836 | C36 | 花冠:内侧花青甙显色扩展范围 | 1.1678 |
| C15 | 茎:翼波状 | 0.8594 | C37 | 成熟期 | 1.7582 |
| C16 | 复叶:大小 | 1.2358 | C38 | 块茎:形状 | 1.3910 |
| C17 | 复叶:小叶排列状态 | 0.9809 | C39 | 块茎:芽眼深度 | 1.2467 |
| C18 | 复叶:小裂叶数量 | 1.3085 | C40 | 块茎:表皮光滑度 | 1.0639 |
| C19 | 复叶:绿色程度 | 1.1243 | C41 | 块茎:表皮颜色 | 1.0454 |
| C20 | 复叶:主脉上表面花青甙显色强度 | 1.4522 | C42 | 块茎:芽眼基部颜色 | 0.8408 |
| C21 | 小叶:顶小叶大小 | 1.0781 | C43 | 块茎:薯肉颜色 | 1.8137 |
| C22 | 小叶:联会频率 | 1.5848 | C44 | 块茎:光照后表皮花青甙显色强度 | 1.1301 |
2.2 马铃薯DUS测试性状分析
测试指南中按照测试性状的表达方式将性状分为质量性状、数量性状和假质量性状,假质量性状是指表达范围至少部分连续,但在1个以上方向(维度)上存在变异的性状[14]。如图1所示,质量性状中,莲座状叶顶部绒毛(C25)只有9级代码,此性状在各品种间无区别,植株顶部叶片花青甙显色(C29)以无色为主,占比90.1%;所有假质量性状中,光发芽形状(C2)以卵形为主,占比52.6%;茎翼波状(C15)以微波形为主,占比50.0%;花冠形状(C33)以近五边形为主,占比95.3%;块茎形状(C38)以卵圆形为主,占比41.3%;块茎表皮颜色(C41)以黄色为主,占比70.3%;块茎芽眼基部颜色(C42)以黄色为主,占比73.7%。块茎薯肉颜色(C43)在9个分级中均有分布,其中乳白色(25.4%)、浅黄色(20.3%)及中等黄色(29.3%)分布较多。质量性状和假质量性状在马铃薯申请品种特异性的判定上具有局限性。
图1
在马铃薯DUS测试指南中,数量性状占比较大(77.27%),相较于质量性状和假质量性状,数量性状在不同品种间表达比较充分,代码的离散程度较大,其中9个性状在指南对应代码上均有表达,数量性状更能用于区分不同的马铃薯品种,在马铃薯品种特异性的判定上要大于质量性状和假质量性状。
2.3 马铃薯DUS测试性状相关性分析
利用皮尔逊(Pearson)的积聚相关系数对28个与马铃薯品种不同组织或部位的颜色、大小相关的性状进行相关性分析,结果如图2所示。光发芽基部花青甙显色强度(C3)与光发芽顶部花青甙显色强度(C8)、茎花青甙显色强度(C14)、复叶主脉上表面花青甙显色强度(C20)、花蕾花青甙显色强度(C26)存在极显著正相关,相关系数分别为0.81、0.69、0.65和0.62;茎花青甙显色强度(C14)与复叶主脉上表面花青甙显色强度(C20)、花序总梗花青甙显色强度(C31)、块茎表皮颜色(C41)存在极显著正相关,相关系数分别为0.87、0.70和0.68;花冠内侧花青甙显色强度(C34)与花冠内侧花青甙显色扩展范围(C36)存在极显著正相关,相关系数为0.97;块茎表皮颜色(C41)与块茎芽眼基部颜色(C42)存在极显著正相关,相关系数为0.89,涉及马铃薯光发芽、茎、复叶主脉、花序总梗的花青甙显色及块茎表皮颜色和芽眼基部颜色等性状之间相关性较高。
图2
图2
28个马铃薯DUS测试性状的相关性分析
Fig.2
Correlation analysis among 28 potato DUS test traits
“*”: P < 0.05; “**”: P < 0.01.
2.4 基于DUS测试性状的马铃薯品种聚类分析
利用非加权平均法对226个马铃薯测试品种进行系统聚类,结果如图3所示。以遗传距离0.45为阈值,聚类结果分为5大类。类群I包含11个品种(占比4.87%),主要特征为光发芽基部花青甙显色中等,光发芽顶部花青甙显色弱到中,植株顶部叶片无花青甙显色,块茎表皮颜色以浅红色和红色为主;类群II包含9个品种(占比3.98%),主要特征为光发芽基部花青甙显色强到极强,植株生长习性半直立,植株顶部叶片无花青甙显色,成熟期早到中,块茎表皮以红色和蓝色为主,块茎薯肉颜色以部分红色和部分蓝色为主;类群III包含23个品种(占比10.20%),主要特征为光发芽基部花青甙显色强到极强,光发芽顶部习性并拢,植株顶部有叶片花青甙显色,块茎表皮颜色以蓝色为主,块茎薯肉颜色以蓝色为主;类群IV包含62个品种(占比27.40%),主要特征为光发芽顶部花青甙显色以无色或浅色为主,茎花青甙显色强度以无色为主,复叶主脉上表面花青甙显色强度以无色为主,花蕾花青甙显色强度以无色为主,植株顶部叶片无花青甙显色,花冠内侧花青甙显色强度以无色为主,块茎表皮颜色以黄色为主;类群V包含121个品种(占比53.50%),主要特征为植株顶部叶片无花青甙显色,块茎表皮颜色以黄色为主。
图3
图3
基于表型性状的226个马铃薯品种聚类分析
Fig.3
Clustering analysis of 226 potato varieties based on phenotypic traits
3 讨论
《植物新品种特异性、一致性和稳定性审查及性状统一描述总则》[14]要求DUS测试性状在品种间能表现出足够的差异,本研究中性状莲座状叶顶部绒毛(C25)只有1个表达状态,花冠形状(C33)、小叶光泽度(C24)、植株顶部叶片花青甙显色(C29)等性状代码分布集中,在品种间区别度较小,在判定品种特异性方面有局限性。马铃薯优质新品种选育需要扩大亲本材料的遗传背景,建议育种者培育高产优质马铃薯品种时,多关注区分度较小的性状,丰富遗传基础,创新育种材料,获得更加优质的马铃薯新品种。
相关性分析结果表明,与花青甙显色强度相关的几组性状(马铃薯光发芽、茎、复叶主脉、花序总梗的花青甙显色)间相关系数较高,这与程静等[15]的研究结果一致,在马铃薯DUS测试和审查时,要针对花青甙显色相关性状进行重点比较,在之后马铃薯测试指南修订时可以考虑对花青甙显色相关性状进行组合和优化。
在DUS测试指南分组性状的选择上,应当充分借鉴形态性状多样性分析,尤其是聚类分析的结果,尽量把品种区分能力强、区分效果好的性状列为分组性状。226个马铃薯品种被分为5个类群,光发芽基部花青甙显色(C3)、植株顶部叶片花青甙显色(C29)和块茎表皮颜色(C41)可以有效区分不同类群,可作为分组性状。测试品种序号11与12,18与19,20与21,93与94是育种人提供的几组对应的申请品种和近似品种,从聚类结果来看,近似品种与对应的申请品种分布在不同的类群中,申请人提供的近似品种可能不准确,在第一生长周期结束后,可以利用品种描述数据进行聚类分析,并根据聚类分析结果,筛选近似品种。DUS测试是品种权授权的技术依据,其中特异性的测试尤为重要。表型性状易受环境因素的影响,尤其是不同测试分中心的表型数据存在环境误差,DNA分子标记技术在DUS测试中的应用越来越广泛,目前,玉米、小麦、水稻、大豆及油菜等作物已借助DNA分子标记技术用于近似品种筛选和真实性鉴定,大大提高了筛选的效率和准确性[16],马铃薯是同源四倍体作物,基因组高度杂合[11],DUS测试机构需建立马铃薯分子鉴定标准,以精确筛选近似品种,鉴定品种特异性。同一个地区尤其是同一育种单位的育成品种,形态差异小,亲缘关系近,通常聚在同个分支,这与段艳凤[17]的研究结果一致。建议育种人在选育马铃薯新品种时,除了关注品种、产量和抗性外,也要以马铃薯DUS测试性状为基础,通过聚类分组,选择各组中的优良材料,加强各类群间的组合配置,丰富马铃薯育种资源,推进育种创新。
4 结论
现有马铃薯测试指南中性状光发芽基部花青甙显色强度(C3)、光发芽顶部花青甙显色强度(C8)、块茎薯肉颜色(C43)、花蕾花甙显色强度(C26)和成熟期(C37)多样性指数较高,可以有效区分品种,但是花青甙显色相关性状间存在极显著相关性,建议之后马铃薯DUS测试指南修订时可以考虑对花青甙显色相关性状进行优化。结合分子技术和DUS测试性状的聚类结果进行近似品种的筛选可以更加准确、高效地判定品种特异性。
参考文献
195份马铃薯种质资源表型性状综合评价
DOI:10.11869/j.issn.1000-8551.2023.09.1710
[本文引用: 2]
为研究马铃薯种质资源表型性状的遗传多样性,以冀西北地区收集的195份马铃薯种质为材料,利用Shannon-weaver多样性指数、变异系数、相关性分析等进行遗传多样性分析和综合评价。结果表明,16个描述型性状共有62个变异类型,遗传多样性指数变幅为0.69~1.73,其中株型、芽眼深浅、块茎整齐度、薯肉色、薯皮色和薯形的遗传多样性程度较高。6个数值型性状中单株结薯数变异系数较大(41.30%),茎粗变异系数较小(15.71%);遗传多样性指数变幅为1.89~2.07,其中株高、茎粗、平均单薯重、块茎产量遗传多样性指数较高。对195份参试种质的综合得分C值采用离差平方和法进行聚类,主要划分为4个类群,各类群表型性状差异明显。根据聚类分析、种质高产稳定性和鲜食马铃薯生物学指标的评价结果,筛选出9份优异种质,可作为冀西北地区鲜食马铃薯杂交育种亲本或中间材料。本研究筛选出的优异性状马铃薯种质,为冀西北地区马铃薯种质资源创新、充分利用提供了理论依据和材料基础。
高山马铃薯种质资源遗传多样性的同工酶分析
DOI:10.3969/j.issn.1004-1524.2018.09.01
[本文引用: 1]
对中国云南德宏和曲靖、湖北恩施、江西怀玉山高山马铃薯种质资源的过氧化物酶(POD)、酯酶(EST)和多酚氧化酶(PPO)同工酶进行了分析研究,以期揭示其遗传多样性。结果表明,云南德宏高山马铃薯、云南曲靖高山马铃薯和湖北恩施高山马铃薯均属于同一类,遗传分化程度较低,而怀玉山高山马铃薯单独成一类;用块茎和叶片做同工酶检测,会造成结果的差异,因而应保证取材的一致性。该实验结果可为进一步开展高山马铃薯品种遗传改良、杂交亲本选配以及高山马铃薯种质资源的利用提供依据。
Population genetic analysis of co-dominant and dominant markers and quantitative characteristics
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