作物杂志,2018, 第6期: 53–57 doi: 10.16035/j.issn.1001-7283.2018.06.009

• 遗传育种·种质资源·生物技术 • 上一篇    下一篇

内蒙古胡麻地方品种资源遗传多样性分析

伊六喜1,斯钦巴特尔1,高凤云1,周宇1,贾霄云1,陈明哲2,张辉1,贾海滨3   

  1. 1 内蒙古自治区农牧业科学院生物技术研究中心,010031,内蒙古呼和浩特
    2 锡林郭勒盟农业科学研究所,026000,内蒙古锡林浩特
    3 乌兰察布市农牧业科学研究院,012000,内蒙古集宁
  • 收稿日期:2018-04-18 修回日期:2018-08-23 出版日期:2018-12-15 发布日期:2018-12-06
  • 作者简介:伊六喜,助理研究员,主要从事胡麻遗传育种研究
  • 基金资助:
    内蒙古农牧业创新基金(2016CXJJN11);内蒙古自治区自然科学基金(2017MS0383);国家自然科学基金(31760400);国家特色油料产业技术体系(CARS-14)

Genetic Diversity of Flax Germplasm Resources in Inner Mongolia

Yi Liuxi1,Siqin Bateer1,Gao Fengyun1,Zhou Yu1,Jia Xiaoyun1,Chen Mingzhe2,Zhang Hui1,Jia Haibin3   

  1. 1 Biotechnology research center of the Inner Mongolia Academy of Agriculture and Husbandry Sciences, Huhhot 010031, Inner Mongolia, China
    2 Xilinguole Meng Institute of Agricultural Sciences, Xilinhaote 026000, Inner Mongolia, China
    3 Wulanchabu Academy of Agriculture and Animal Husbandry, Jining 012000, Inner Mongolia, China
  • Received:2018-04-18 Revised:2018-08-23 Online:2018-12-15 Published:2018-12-06

摘要:

为了揭示内蒙古胡麻地方品种的遗传多样性和亲缘关系,采用SRAP分子标记对23份胡麻地方品种进行了遗传多样性分析。结果表明:胡麻25.0μL SRAP-PCR最佳反应体系为10μmol/L正反向引物0.3μL、2×Taq Master Mix 9.0μL、DNA模板量40ng;18对SRAP引物扩增得到219个条带,平均每对引物扩增的条带为12.17,多态性条带为136,多态性比率为62.10%,观测等位基因数为2.00,平均每个位点有效等位基因数1.59,多态性信息量(PIC)平均为0.61;有效等位基因数(Ne)、香农信息指数(I)和Nei’s遗传相似系数(H)分别为1.5630、0.6715和0.4738;在遗传相似系数0.55处供试胡麻分为两大类,在遗传相似系数0.38处,第一大类群分为3个亚群。结论认为,内蒙古胡麻地方品种的遗传多样性丰富,同一个地区培育的胡麻品种亲缘关系较近。

关键词: 胡麻, 内蒙古地区, 遗传多样性, SRAP

Abstract:

In order to further understand the genetic diversity and genetic relationship of Inner Mongolia flax local varieties, the genetic diversity of 23 flax local varieties was analyzed using SRAP markers. The optimum SRAP PCR system contained 0.3μL of forward and reverse primer (10μmol/L), 9.0μL of 2×Taq Master Mix and 40ng template DNA in 25μL. 219 bands were produced by the 18 pairs of primers with an average of 12.17 bands for each pair of primers. 136 polymorphic bands were obtained and the polymorphic band proportion was 62.10%. The number of observed allele was 2.00, with 1.59 effective alleles for each locus. The average polymorphic information content was 0.61. The effective allele number (Ne), Shannon’s information index (I), and Nei’s genetic similarity coefficient (H) were 1.5630, 0.6715 and 0.438, respectively. When H was 0.55, the population was divided into 2 groups, when H was 0.38, the first population was dividid into 3 sub-groups. It could be concluded that the Inner Mongolia flax local varieties possess abundant genetic diversity and the flax varieties cultivated in the same area are closely related.

Key words: Flax, Inner Mongolia, Genetic diversity, SRAP

表1

23份胡麻(Linum usitatissimum L.)品种(系)名称及编号"

编号Code 品种(系)Cultivar (Line)
1 H919
2 H920
3 H921
4 H922
5 内亚油一号Neiyayouyihao
6 临河17号Linhe No.17
7 集宁1号Jining No.1
8 集宁2号Jining No.2
9 轮选3号Lunxuan No.3
10 轮选2号Lunxuan No.2
11 轮选1号Lunxuan No.1
编号Code 品种(系)Cultivar (Line)
12 内蒙红Neimenghong
13 内亚2号Neiya No.2
14 CH-89
15 内亚5号Neiya No.5
16 内亚6号Neiya No.6
17 内亚7号Neiya No.7
18 华德小胡麻Huadexiaohuma
19 华德大粒高杆Huadedaligaogan
20 多伦小胡麻Duolunxiaohuma
21 多伦大胡麻Duolundahuma
22 后旗普通胡麻Houqiputonghuma
23 乌拉特中旗3号Wulatezhongqi No.3

表2

供试SRAP引物序列"

正向引物Forward primer 反向引物Reverse primer
名称Name 序列Sequence (5'→3') 名称Name 序列Sequence (5'→3')
M1 5′-TGAGTCCAAACCGGCAT-3′ E1 5′-GACTGCGTACGAATTGTA-3′
M2 5′-TGAGTCCAAACCGGACA-3′ E2 5′-GACTGCGTACGAATTCGA-3′
M3 5′-TGAGTCCAAACCGGAAG-3′ E3 5′-GACTGCGTACGAATTGTC-3′
M4 5′-TGAGTCCAAACCGGATG-3′ E4 5′-GACTGCGTACGAATTCAA-3′
M5 5′-TGAGTCCAAACCGGTGC-3′ E5 5′-GACTGCGTACGAATTGTC-3′
M6 5′-TGAGTCCAAACCGGAAT-3′ E6 5′-GACTGCGTACGAATTCTA-3′
M7 5′-TGAGTCCAAACCGGTGC-3′ E7 5′-GACTGCGTACGAATTCGA-3′
M8 5′-TGAGTCCAAACCGGACG-3′ E8 5′-GACTGCGTACGAATTTGA-3′
M9 5′-TGAGTCCAAACCGGTCC-3′ E9 5′-GACTGCGTACGAATTGTA-3′
M10 5′-GACTGCGTACGAATTACT-3′ E10 5′-GACTGCGTACGAATTAGC-3′
M11 5′-TGAGTCCAAACCGGAAC-3′ E11 5′-GACTGCGTACGAATTACT-3′
M12 5′-GACTGCGTACGAATTCGA-3′ E12 5′-GACTGCGTACGAATTAAT-3′

表3

反应体系L16(4)3正交试验设计"

编号
Code
引物量(μL)
Primer quantity
2×Taq (μL)
Master Mix
DNA模板量(ng)
DNA template quantity
1 0.1 7.0 25
2 0.1 9.0 30
3 0.1 12.0 35
4 0.1 15.0 40
5 0.2 7.0 30
6 0.2 9.0 25
7 0.2 12.0 40
8 0.2 15.0 35
9 0.3 7.0 35
10 0.3 9.0 40
11 0.3 12.0 25
12 0.3 15.0 30
13 0.5 7.0 40
14 0.5 9.0 35
15 0.5 12.0 30
16 0.5 15.0 25

图1

正交试验设计SRAP-PCR反应体系的扩增产物 M,1500bp DNA marker;1~16,正交试验组合"

表4

18对SRAP引物组合对胡麻的扩增"

引物名称
Primer name
总位点数
Total loci
多态性位点数Polymorphic loci 多态性位点百分率(%)
Percentage of polymorphic loci
有效等位基因数
Effective alleles
PIC
M9E11 12.00 7.00 58.33 1.61 0.59
M1E5 11.00 8.00 72.73 1.71 0.63
M8E2 13.00 9.00 69.23 1.62 0.58
M10E9 14.00 10.00 71.43 1.73 0.67
M6E11 10.00 7.00 70.00 1.49 0.65
M1E9 12.00 8.00 66.67 1.60 0.70
M5E2 13.00 8.00 61.54 1.66 0.54
M7E4 16.00 9.00 56.25 1.55 0.62
M4E4 12.00 7.00 58.33 1.53 0.66
M4E10 11.00 6.00 54.55 1.51 0.62
M3E5 14.00 8.00 57.14 1.69 0.57
M9E6 15.00 9.00 60.00 1.57 0.64
M10E3 13.00 7.00 53.85 1.44 0.61
M4E7 11.00 8.00 72.73 1.65 0.68
M5E6 10.00 5.00 50.00 1.49 0.51
M3E3 9.00 6.00 66.67 1.67 0.58
M10E6 11.00 7.00 63.64 1.55 0.55
M1E3 12.00 7.00 58.33 1.59 0.61
总计Total 219.00 136.00 1 121.42 28.66 11.01
平均值Average 12.17 7.56 62.30 1.59 0.61

图2

23份胡麻种质的SRAP聚类分析 A,第一类群;B,第二类群;Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ,分别代表3个亚群;1~23对应材料见表1"

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