内蒙古胡麻地方品种资源遗传多样性分析

doi:10.16035/j.issn.1001-7283.2018.06.009

摘要/Abstract

摘要：

为了揭示内蒙古胡麻地方品种的遗传多样性和亲缘关系,采用SRAP分子标记对23份胡麻地方品种进行了遗传多样性分析。结果表明：胡麻25.0μL SRAP-PCR最佳反应体系为10μmol/L正反向引物0.3μL、2×Taq Master Mix 9.0μL、DNA模板量40ng;18对SRAP引物扩增得到219个条带,平均每对引物扩增的条带为12.17,多态性条带为136,多态性比率为62.10%,观测等位基因数为2.00,平均每个位点有效等位基因数1.59,多态性信息量（PIC）平均为0.61;有效等位基因数（N_e）、香农信息指数（I）和Nei’s遗传相似系数（H）分别为1.5630、0.6715和0.4738;在遗传相似系数0.55处供试胡麻分为两大类,在遗传相似系数0.38处,第一大类群分为3个亚群。结论认为,内蒙古胡麻地方品种的遗传多样性丰富,同一个地区培育的胡麻品种亲缘关系较近。

关键词: 胡麻, 内蒙古地区, 遗传多样性, SRAP

Abstract:

In order to further understand the genetic diversity and genetic relationship of Inner Mongolia flax local varieties, the genetic diversity of 23 flax local varieties was analyzed using SRAP markers. The optimum SRAP PCR system contained 0.3μL of forward and reverse primer (10μmol/L), 9.0μL of 2×Taq Master Mix and 40ng template DNA in 25μL. 219 bands were produced by the 18 pairs of primers with an average of 12.17 bands for each pair of primers. 136 polymorphic bands were obtained and the polymorphic band proportion was 62.10%. The number of observed allele was 2.00, with 1.59 effective alleles for each locus. The average polymorphic information content was 0.61. The effective allele number (N_e), Shannon’s information index (I), and Nei’s genetic similarity coefficient (H) were 1.5630, 0.6715 and 0.438, respectively. When H was 0.55, the population was divided into 2 groups, when H was 0.38, the first population was dividid into 3 sub-groups. It could be concluded that the Inner Mongolia flax local varieties possess abundant genetic diversity and the flax varieties cultivated in the same area are closely related.

Key words: Flax, Inner Mongolia, Genetic diversity, SRAP

伊六喜,斯钦巴特尔,高凤云,周宇,贾霄云,陈明哲,张辉,贾海滨. 内蒙古胡麻地方品种资源遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2018 (6): 53–57

Yi Liuxi,Siqin Bateer,Gao Fengyun,Zhou Yu,Jia Xiaoyun,Chen Mingzhe,Zhang Hui,Jia Haibin. Genetic Diversity of Flax Germplasm Resources in Inner Mongolia[J]. Crops, 2018(6): 53–57

图/表 6

表1

表2

表3

图1

表4

图2

参考文献 26

[1]	伊六喜, 斯钦巴特尔, 贾霄云 ,等. 胡麻种质资源、育种及遗传研究进展. 中国麻业科学, 2017,39(2):81-87. doi: 10.3969/j.issn.1671-3532.2017.02.006
[2]	伊六喜, 斯钦巴特尔, 张辉 ,等. 胡麻种质资源遗传多样性及亲缘关系的SRAP分析. 西北植物学报, 2017,37(10):1941-1950.
[3]	伊六喜, 萨如拉, 张辉 , 等. 胡麻种子产量与主要农艺性状的多重分析. 安徽农业科学, 2018,46(6):33-36.
[4]	李明, 姜硕, 郑东泽 , 等. 亚麻SRAP标记连锁图谱的构建及3个数量性状的定位. 东北农业大学学报, 2014,45(2):12-18.
[5]	安泽山, 严兴初, 党占海 , 等. 利用SRAP标记分析胡麻资源遗传多样性. 西南农业学报, 2014,27(2):530-534. doi: 10.3969/j.issn.1001-4829.2014.02.013
[6]	伊六喜 , 斯钦巴特尔,张辉,等. 胡麻核心种质资源表型变异及SRAP分析. 中国油料作物学报, 2017,39(6):794-804.
[7]	郝荣楷, 严兴初, 党占海 , 等. 我国胡麻育成品种的遗传多样性分析. 中国油料作物学报, 2014,36(3):334-342. doi: 10.7505/j.issn.1007-9084.2014.03.007
[8]	吴建忠, 赵东升, 黄文功 , 等. 12个亚麻品种亲缘关系的SRAP分析. 中国麻业科学, 2012,34(4):153-157. doi: 10.3969/j.issn.1671-3532.2012.04.001
[9]	Stewart C, Via L . A rapid CTAB DNA isolation technique useful for RAPD fingerprinting and other PCR applications. Biotechniques, 1993,14(5):748-750.
[10]	Li G, Quiros C F . Sequence-related amplified polymorphism (SRAP),a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in Brassica. Theoretical & Applied Genetics, 2001,103(2-3):455-461.
[11]	孙翊, 张永春, 殷丽青 , 等. 朱顶红SRAP-PCR反应体系的建立和优化. 分子植物育种, 2017,15(5):1806-1813.
[12]	Gresshoff P M . Fast and sensitive silver staining of DNA in polyacrylamide gels. Analytical Biochemistry, 1991,196(1):80-83. doi: 10.1016/0003-2697(91)90120-I pmid: 1716076
[13]	张安世, 徐九文, 张利民 , 等. 北方部分粳稻品种遗传关系的SRAP分析. 作物杂志, 2009(6):55-58. doi: 10.3969/j.issn.1001-7283.2009.06.014
[14]	石玲艳, 侯建华, 张永虎 , 等. 基于SRAP标记的玉米自交系遗传多样性与群体结构分析. 作物杂志, 2015(3):57-63. doi: 10.16035/j.issn.1001-7283.2015.03.011
[15]	李锐, 白建荣, 王秀红 , 等. 144份甜玉米群体的遗传多样性分析. 作物杂志, 2018(2):17-24.
[16]	张帅, 庞玉辉, 王征宏 , 等. 小麦种质资源农艺性状变异及其遗传多样性分析. 作物杂志, 2018(2):44-51.
[17]	Botstein D, White R L, Skolnick M , et al. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetics, 1980,32(3):314-331.
[18]	令狐斌, 侯思宇, 孙朝霞 , 等. 苦荞SRAP分子标记体系优化与遗传多样性分析. 中国农业大学学报, 2015,20(1):37-43. doi: 10.11841/j.issn.1007-4333.2015.01.05
[19]	李维卫, 王爱兰, 聂臻臻 . S山茴香RAP反应体系正交设计优化及引物筛选. 基因组学与应用生物学, 2017,36(8):3103-3109.
[20]	延娜, 李巧丽, 郭军战 . 果桑遗传差异的SRAP和EST-SSR分析. 西北农业学报, 2015,24(9):91-97.
[21]	李霞, 李书华, 杨林 , 等. 芦笋种质资源的SRAP遗传多样性分析. 农学学报, 2016,6(3):40-45.
[22]	林春华, 李兆龙, 乔燕春 , 等. SRAP分子标记分析体系的建立及白簕资源亲缘关系分析. 基因组学与应用生物学, 2012,31(5):498-504.
[23]	张良波, 王解香, 李培旺 , 等. 梾木属SRAP-PCR反应体系的优化及引物筛选. 分子植物育种, 2014,12(5):1005-1010.
[24]	杨永, 王豪杰, 张学军 , 等. 新疆甜瓜地方种质资源遗传多样性的SRAP分析. 植物遗传资源学报, 2017,18(3):436-448. doi: 10.13430/j.cnki.jpgr.2017.03.008
[25]	黄伟, 鲁敏, 张起 , 等. 利用SRAP标记分析贵州砂梨资源遗传多样性. 西北植物学报, 2016,36(2):280-287. doi: 10.7606/j.issn.1000-4025.2016.02.0280
[26]	朱海生, 叶新如, 陈敏氡 , 等. 丝瓜种质资源的SRAP分析. 分子植物育种, 2016,14(8):2217-2223.

相关文章 15

[1]	吴瑞香,杨建春,王利琴,郭秀娟. 应用多元分析法综合评价胡麻材料抗旱适应性[J]. 作物杂志, 2018, (5): 10–16
[2]	马孟莉,郑云,周晓梅,张婷婷,张晓倩,卢丙越. 云南哈尼梯田红米地方品种遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2018, (5): 21–26
[3]	田荟遥,蒋继志,李成斌,申芬,侯宁. 中国东北地区马铃薯致病疫霉遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2018, (3): 168–173
[4]	李锐,白建荣,王秀红,张丛卓,张效梅,闫蕾,杨瑞娟. 144份甜玉米群体的遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2018, (2): 17–24
[5]	张帅,庞玉辉,王征宏,王黎明,陈春燕,曾占奎,王春平. 小麦种质资源农艺性状变异及其遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2018, (2): 44–51
[6]	赵璐,杨治伟,部丽群,田玲,苏梅,田蕾,张银霞,杨淑琴,李培富. 宁夏和新疆水稻种质资源表型遗传多样性分析及综合评价[J]. 作物杂志, 2018, (1): 25–34
[7]	郭鹏燕,王彩萍,任杰成,赵吉平,许瑛,岳茂林. 不同地理来源绿豆农艺性状的遗传多样性研究[J]. 作物杂志, 2017, (6): 55–59
[8]	台莲梅,左豫虎,张亚玲,金永玲,郭永霞,靳学慧,金光辉. 黑龙江省马铃薯早疫病菌遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2017, (3): 151–156
[9]	曾潮武,梁晓东,李建疆. 中亚引进春小麦种质资源主要农艺性状的遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2017, (2): 67–71
[10]	郭秀娟,冯学金,杨建春,吴瑞香,王利琴. 不同种植密度和肥料配施对胡麻植株性状和经济产量的效应[J]. 作物杂志, 2017, (2): 135–138
[11]	郭秀娟,杨建春,冯学金,姜超. 不同前茬作物对胡麻干物质积累规律、品质及产量构成因子的影响[J]. 作物杂志, 2016, (2): 164–167
[12]	赵利,王利民,赵玮,党照,张建平,党占海. 胡麻RIL群体中粗脂肪和脂肪酸组分的分离及其相关性分析[J]. 作物杂志, 2016, (1): 33–37
[13]	张雪婷, 杨文雄, 王世红, 等. 甘肃省近年来育成冬小麦品种主要农艺性状的遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2015, (4): 27–32
[14]	石玲艳, 侯建华, 张永虎, 等. 基于sRAP标记的玉米自交系遗传多样性与群体结构分析[J]. 作物杂志, 2015, (3): 57–63
[15]	刘晓云, 孙新新, 刘昱, 等. 河北省豆科绿肥作物种质资源相关共生根瘤菌资源的研究[J]. 作物杂志, 2015, (3): 29–35

Metrics

Viewed

Full text

Abstract

Cited

Shared

Discussed

编号Code	品种（系）Cultivar (Line)
1	H919
2	H920
3	H921
4	H922
5	内亚油一号Neiyayouyihao
6	临河17号Linhe No.17
7	集宁1号Jining No.1
8	集宁2号Jining No.2
9	轮选3号Lunxuan No.3
10	轮选2号Lunxuan No.2
11	轮选1号Lunxuan No.1
编号Code	品种（系）Cultivar (Line)
12	内蒙红Neimenghong
13	内亚2号Neiya No.2
14	CH-89
15	内亚5号Neiya No.5
16	内亚6号Neiya No.6
17	内亚7号Neiya No.7
18	华德小胡麻Huadexiaohuma
19	华德大粒高杆Huadedaligaogan
20	多伦小胡麻Duolunxiaohuma
21	多伦大胡麻Duolundahuma
22	后旗普通胡麻Houqiputonghuma
23	乌拉特中旗3号Wulatezhongqi No.3

正向引物Forward primer		反向引物Reverse primer
名称Name	序列Sequence (5'→3')	名称Name	序列Sequence (5'→3')
M1	5′-TGAGTCCAAACCGGCAT-3′	E1	5′-GACTGCGTACGAATTGTA-3′
M2	5′-TGAGTCCAAACCGGACA-3′	E2	5′-GACTGCGTACGAATTCGA-3′
M3	5′-TGAGTCCAAACCGGAAG-3′	E3	5′-GACTGCGTACGAATTGTC-3′
M4	5′-TGAGTCCAAACCGGATG-3′	E4	5′-GACTGCGTACGAATTCAA-3′
M5	5′-TGAGTCCAAACCGGTGC-3′	E5	5′-GACTGCGTACGAATTGTC-3′
M6	5′-TGAGTCCAAACCGGAAT-3′	E6	5′-GACTGCGTACGAATTCTA-3′
M7	5′-TGAGTCCAAACCGGTGC-3′	E7	5′-GACTGCGTACGAATTCGA-3′
M8	5′-TGAGTCCAAACCGGACG-3′	E8	5′-GACTGCGTACGAATTTGA-3′
M9	5′-TGAGTCCAAACCGGTCC-3′	E9	5′-GACTGCGTACGAATTGTA-3′
M10	5′-GACTGCGTACGAATTACT-3′	E10	5′-GACTGCGTACGAATTAGC-3′
M11	5′-TGAGTCCAAACCGGAAC-3′	E11	5′-GACTGCGTACGAATTACT-3′
M12	5′-GACTGCGTACGAATTCGA-3′	E12	5′-GACTGCGTACGAATTAAT-3′

引物名称 Primer name	总位点数 Total loci	多态性位点数Polymorphic loci	多态性位点百分率(%) Percentage of polymorphic loci	有效等位基因数 Effective alleles	PIC
M9E11	12.00	7.00	58.33	1.61	0.59
M1E5	11.00	8.00	72.73	1.71	0.63
M8E2	13.00	9.00	69.23	1.62	0.58
M10E9	14.00	10.00	71.43	1.73	0.67
M6E11	10.00	7.00	70.00	1.49	0.65
M1E9	12.00	8.00	66.67	1.60	0.70
M5E2	13.00	8.00	61.54	1.66	0.54
M7E4	16.00	9.00	56.25	1.55	0.62
M4E4	12.00	7.00	58.33	1.53	0.66
M4E10	11.00	6.00	54.55	1.51	0.62
M3E5	14.00	8.00	57.14	1.69	0.57
M9E6	15.00	9.00	60.00	1.57	0.64
M10E3	13.00	7.00	53.85	1.44	0.61
M4E7	11.00	8.00	72.73	1.65	0.68
M5E6	10.00	5.00	50.00	1.49	0.51
M3E3	9.00	6.00	66.67	1.67	0.58
M10E6	11.00	7.00	63.64	1.55	0.55
M1E3	12.00	7.00	58.33	1.59	0.61
总计Total	219.00	136.00	1 121.42	28.66	11.01
平均值Average	12.17	7.56	62.30	1.59	0.61