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作物杂志,2018, 第2期: 17–24 doi: 10.16035/j.issn.1001-7283.2018.02.004

• 遗传育种·种质资源·生物技术 • 上一篇    下一篇

144份甜玉米群体的遗传多样性分析

李锐1,白建荣1,2,3,王秀红2,张丛卓1,张效梅3,闫蕾1,杨瑞娟1   

  1. 1 山西省农业科学院作物科学研究所,030031,山西太原
    2 山西省农业科学院现代农业研究中心,030031,山西太原
    3 农业部黄土高原作物基因资源与种质创新重点实验室,030031,山西太原
  • 收稿日期:2017-11-10 修回日期:2018-02-08 出版日期:2018-04-20 发布日期:2018-08-27
  • 作者简介:李锐,助理研究员,主要从事分子育种工作
  • 基金资助:
    山西省财政支农项目(2014ZYFZ-12);山西省财政支农项目(2015ZYFZ-12)

Population Genetic Diversity of 144 Sweet Maizes

Li Rui1,Bai Jianrong1,2,3,Wang Xiuhong2,Zhang Congzhuo1,Zhang Xiaomei3,Yan Lei1,Yang Ruijuan1   

  1. 1 Institute of Crop Science, Shanxi Academy of Agricultural Sciences, Taiyuan 030031, Shanxi, China
    2 Modern Agricultural Research Center, Shanxi Academy of Agricultural Sciences, Taiyuan 030031, Shanxi, China
    3 Key Laboratory of Crop Gene Resources and Germplasm Enhancement on Loess Plateau, Ministry of Agriculture, Taiyuan 030031, Shanxi, China
  • Received:2017-11-10 Revised:2018-02-08 Online:2018-04-20 Published:2018-08-27

RichHTML

9

PDF (PC)

198

摘要：

利用SSR技术对来源于144份甜玉米群体的40个位点进行了分析,共检测出343个等位变异,每对引物检测出4~17个等位变异,平均8.58个。40个位点的多态性信息量PIC值变化范围在0.46~0.90,平均0.76/位点。标记索引指数MI变化范围在2.30~15.19,平均6.80/位点。在33个位点共检测到稀有等位变异70个,在15个位点共检测到特有等位变异16个。在144份材料中,117份材料有稀有等位变异,其中1份材料有8个稀有等位变异;14份材料有特有等位变异,2份材料有2个特有等位变异。聚类分析可初步将144份甜玉米群体划为7个类群,其中最大的Ⅰ群包括89份,第Ⅱ群包括35份。从研究结果得出群体材料的利用价值,对新的群体的合成及杂优模式的建立进行了探讨,为育种者提供新的思路和方法。

关键词: 甜玉米, 群体, SSR, 遗传多样性

Abstract:

Genetic diversity of 144 sweet maize populations were analyzed with 40 SSR loci. Totally 343 alleles in 144 populations were detected with an average of 6.8 ranged from 4 to 17 per locus. PIC among them ranged from 0.46 to 0.90 per locus with an average of 0.76. MI among them ranged from 2.30 to 15.19 per locus with an average of 6.80. Also 70 rare alleles from 33 loci and 16 unique alleles from 15 loci were identified. There were rare alleles in 117 populations and unique alleles in 14 populations. They were clustered into 7 groups,among which the biggest group included 89 populations and the second biggest group had 35 populations. It also provided the application values of them and new methods for new populations and heterosis utilizing models for breeders.

Key words: Sweet maize, Population, SSR, Genetic diversity

表1

甜玉米群体信息"

编号No. 材料来源Resource 搜集地区Collection place
001 透明贴 中国山西省太谷县
002 黄甜 中国山西省平遥县
003 蜜玉01 中国山西省平遥县
004 甜皇后 中国山西省平遥县
005 蜜玉米 中国山西省祁县
006 密诊2号 中国山西省祁县
007 sct11 中国海南
008 sct13 中国海南
009 中甜米 中国北京
010 油包米 中国山西省平遥县
011 黄糖包米 中国山西省平遥县
012 糖包米 中国山西省屯留县
013 甜包米 中国山西省屯留县
014 白糖包米 中国山西省屯留县
015 红糖包米 中国山西省安泽县
016 透明贴 中国山西省安泽县
017 黄日甜 日本
018 甜包米 中国山西省隰县
019 白糖包米 中国山西省屯留县
020 蜜玉 中国山西省安泽县
021 密诊 中国山西省安泽县
022 3108 中国海南
023 D010 中国海南
024 泰国甜 日本
025 油包米 中国山西省隰县
026 黄糖包米 中国山西省隰县
027 糖包米 中国山西省安泽县
028 甜包米 中国山西省安泽县
029 白糖包米 中国山西省沁源县
030 红糖包米 中国山西省沁源县
031 127 中国海南
032 7030 中国海南
033 h0011 日本
034 黄甜 中国山西省临汾市尧都区
035 皇后 中国山西省临汾市尧都区
036 南甜13 中国山西省隰县
037 黄甜60 中国山西省隰县
038 甜皇后 中国山西省隰县
039 培甜2 中国山西省吉县
040 胡甜 中国山西省吉县
041 hla甜 日本
042 tn61甜6 日本
043 白超1 中国山西省吉县
044 玉米11 中国山西省吉县
045 培甜3-5 中国山西省吉县
046 16纯 中国山西省吉县
047 南甜49 中国山西省吉县
048 培甜6 中国山西省吉县
049 甜64 中国山西省安泽县
050 日甜34 日本
051 甜14 中国山西省大宁县
052 皇后玉米 中国山西省隰县
053 蜜苞米 中国山西省吉县
054 密诊玉米 中国山西省吉县
055 甜苞米 中国山西省大宁县
056 甜玉米 中国山西省大宁县
057 中甜玉米 中国山西省阳曲县
058 油包米 中国山西省隰县
059 黄糖包米 中国山西省阳曲县
060 糖包米 中国山西省阳曲县
061 甜包米 中国山西省阳曲县
062 白糖苞米 中国山西省阳曲县
063 红糖包米 中国山西省阳曲县
064 透明玉米 中国海南
065 蜜苞米 中国海南
066 泰国甜玉米 日本
067 超甜75 日本
068 黄甜68 中国海南
069 4HT-30 中国海南
070 856福 中国海南
071 6882 不详
072 4788 不详
073 849h 不详
074 Canberra 不详
075 440009 不详
076 440010 不详
077 440011 不详
078 mellogold 不详
079 ilinltrasweet 不详
080 白甜 日本
081 702141 日本
082 whitehul 中国海南
083 702088 中国海南
084 ch2183 不详
085 ch2197 不详
086 ch2572 不详
087 ch2628 不详
088 ch2690 不详
089 ch2757 不详
090 ch 2800 不详
091 ch2839 不详
092 HT-8 日本
093 gss3492 不详
094 gss3617 不详
095 guardian 不详
096 f-m cross 不详
097 flokioxtray 不详
098 sweet 不详
099 ca11 y92-01 不详
100 ca16 y92-02 不详
101 圣地亚哥甜玉米 日本
102 osorno1 不详
103 osorno2 不详
104 white2 不详
105 矮黄金 日本
106 roger shybrid 不详
107 Seneca sentry 不详
108 show case 不详
109 silverado 不详
110 silveyetal 不详
111 矮秆黄金 日本
112 jelly bantarm 不详
113 jibmephamnbr 不详
114 403034 不详
115 292s2 不详
116 292s8 不详
117 6HT-81 不详
118 ny717 不详
119 ny856 不详
120 ny863 不详
121 ny866 不详
122 miracle 不详
123 7-202 不详
124 超甜69 中国海南
125 超甜34-2 中国海南
126 超甜34-1 中国海南
127 超甜19 中国海南
128 6HT-95 不详
129 5HT-61 不详
130 7-248 中国海南
131 日甜61 日本
132 超甜68 中国海南
133 HT11 不详
134 HT-62 不详
135 南甜44 中国海南
136 6HT-85 不详
137 超甜59 中国海南
138 239-1 不详
139 6HT 不详
140 7-22-1 不详
141 白甜米 日本
142 黑糖苞米 中国海南
143 超甜14 中国海南
144 黑糖070 中国海南

表2

40对SSR引物在144个甜玉米群体检测到的遗传变异"

编号
No.		 SSR位点
Loci		 位置
Bin		 序列长度(bp)
Sequence length		 等位变异数
Allele		 多态信息量
PIC		 标记索引系数
MI		 稀有等位变异
Rare allele		 特有等位变异
Unique allele
1 bnlg439wl 1.03 319~369 7.00 0.81 5.71 1 0
2 umc1335y5 1.06 233~257 5.00 0.46 2.30 3 0
3 umc2007y4 2.04 233~300 13.00 0.87 11.39 1 1
4 bnlg1940k7 2.08 324~388 17.00 0.89 15.19 8 1
5 umc2105k3 3.00 280~350 7.00 0.78 5.47 1 0
6 phi053k2 3.05 333~363 12.00 0.80 9.69 6 0
7 phi072k4 4.01 408~432 10.00 0.81 8.16 1 1
8 bnlg229lk4 4.06 362~421 10.00 0.87 8.71 0 0
9 umc1705wl 5.03 254~349 11.00 0.88 9.69 1 0
10 bnlg2305k4 5.07 240~312 10.00 0.85 8.55 2 1
11 bnlg16lk8 6.00 154~216 14.00 0.89 12.54 2 1
12 bnlgl702kl 6.05 260~347 10.00 0.85 8.60 1 1
13 umc1545y2 7.00 180~249 12.00 0.90 10.80 2 0
14 umc1125V3 7.04 149~175 5.00 0.49 2.47 2 0
15 bnlg240kl 8.06 220~239 6.00 0.55 3.32 2 0
16 phi080k15 8.08 202~238 7.00 0.68 4.77 4 0
17 phi065k9 9.03 391~415 6.00 0.75 4.52 2 0
18 umc1492y13 9.04 270~290 4.00 0.63 2.55 0 0
19 umc1432y6 10.02 211~259 6.00 0.78 4.68 0 1
20 umc1506k12 10.05 163~196 6.00 0.72 4.32 0 1
21 umc1147y4 1.07 149~172 7.00 0.65 4.59 1 0
22 bnlg1671y17 1.10 173~255 15.00 0.89 13.46 2 0
23 phi96100y1 2.00 231~287 6.00 0.77 4.65 0 1
24 umc1536k9 2.07 216~238 8.00 0.75 6.04 3 1
25 bnlg1520k1 2.09 156~204 6.00 0.73 4.39 1 0
26 umc1489y3 3.07 231~265 7.00 0.70 4.96 2 0
27 bnlg490y4 4.04 245~331 9.00 0.70 6.37 1 2
28 umc1999y3 4.09 167~200 7.00 0.68 4.79 1 1
29 umc2115k3 5.02 265~295 7.00 0.78 5.47 0 0
30 umc1429y7 5.03 125~145 6.00 0.69 4.18 1 0
31 bnlg249k2 6.01 259~313 11.00 0.86 9.52 1 0
32 phi299852y2 6.07 200~254 11.00 0.82 9.10 3 1
33 umc2160k3 7.01 198~244 12.00 0.88 10.68 2 0
34 umc1936k4 7.03 153~176 9.00 0.76 6.89 4 0
35 bnlg2235y5 8.02 174~198 7.00 0.78 5.47 1 1
36 phi233376y1 8.09 180~222 6.00 0.72 4.35 0 1
37 umc2084w2 9.01 184~214 10.00 0.83 8.38 2 0
38 umc1231k4 9.05 239~283 5.00 0.56 2.82 3 0
39 phi041y6 10.00 296~334 6.00 0.71 4.27 2 0
40 umc2163w3 10.04 280~352 10.00 0.81 8.18 1 0
总数 - - 343.00 - - 70 16
最大值Maximum - - 17.00 0.90 15.19 8 2
最小值Minimum - - 4.00 0.46 2.30 1 1
平均值Average - - 8.58 0.76 6.80 - -

表3

144份甜玉米群体检测到的稀有等位变异数和特有等位变异数"

编号
No.		 稀有等位变异
Rare allele		 特有等位变异
Unique allele		 编号
No.		 稀有等位变异
Rare allele		 特有等位变异
Unique allele		 编号
No.		 稀有等位变异
Rare allele		 特有等位变异
Unique allele
001 0 0 049 4 1 097 6 0
002 0 0 050 1 0 098 1 0
003 0 0 051 2 0 099 3 0
004 1 0 052 1 0 100 1 1
005 0 0 053 2 0 101 3 0
006 0 0 054 1 0 102 2 0
007 0 0 055 1 0 103 2 1
008 0 0 056 2 0 104 1 0
009 2 0 057 2 0 105 2 0
010 1 0 058 1 0 106 1 1
011 1 0 059 2 0 107 3 0
012 0 0 060 2 0 108 1 0
013 1 1 061 7 1 109 1 0
014 0 0 062 3 0 110 6 0
015 2 0 063 8 0 111 5 0
016 3 0 064 1 0 112 5 0
017 1 0 065 1 0 113 1 0
018 1 0 066 1 0 114 6 2
019 0 0 067 1 0 115 3 0
020 0 0 068 3 0 116 1 0
021 1 0 069 4 0 117 4 0
022 3 0 070 4 1 118 2 0
023 1 0 071 1 0 119 4 0
024 1 0 072 4 0 120 0 0
025 0 0 073 3 1 121 4 0
026 0 0 074 6 0 122 2 0
027 1 0 075 1 1 123 5 1
028 0 0 076 6 0 124 3 0
029 1 1 077 5 0 125 2 0
030 0 0 078 6 0 126 6 0
031 5 0 079 3 0 127 6 0
032 1 0 080 3 0 128 4 0
033 0 0 081 1 0 129 5 0
034 1 1 082 2 0 130 4 0
035 1 0 083 4 0 131 1 0
036 5 0 084 4 0 132 3 0
037 0 0 085 1 0 133 3 0
038 0 0 086 4 0 134 0 0
039 0 0 087 2 0 135 1 0
040 0 0 088 7 0 136 5 0
041 1 0 089 0 0 137 1 0
042 2 0 090 4 0 138 3 0
043 0 0 091 3 0 139 2 0
044 1 0 092 2 0 140 5 0
045 4 0 093 2 2 141 2 0
046 0 0 094 3 0 142 0 0
047 0 0 095 0 0 143 4 0
048 1 0 096 1 0 144 2 0

图1

144份甜玉米群体的聚类树状图"

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