作物杂志,2023, 第6期: 252–256 doi: 10.16035/j.issn.1001-7283.2023.06.034

• 植物保护 • 上一篇    下一篇

银川、徐州和赤峰地区番茄病毒病种类的鉴定

温智浩1(), 张胜丰2, 谢学文1, 柴阿丽1, 李建设3, 李磊1, 范腾飞1, 石延霞1(), 李宝聚1()   

  1. 1中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜生物育种全国重点实验室,100081,北京
    2徐州市贾汪区泰瑞农业科技有限公司,221133,江苏徐州
    3宁夏大学,750021,宁夏银川
  • 收稿日期:2022-05-12 修回日期:2023-09-15 出版日期:2023-12-15 发布日期:2023-12-15
  • 通讯作者: 李宝聚,主要从事蔬菜病害综合防治研究,E-mail:libaojuivf@163.com;石延霞为共同通信作者,主要从事蔬菜病害综合防治研究,E-mail:shiyanxia@caas.cn
  • 作者简介:温智浩,主要从事蔬菜病害综合防治研究,E-mail:985626903@qq.com
  • 基金资助:
    国家现代农业产业技术体系(CARS-23);宁夏回族自治区重点研发计划项目(2020BBF02025);中国农业科学院科技创新工程项目(CAAS-ASTIP-IVFCAAS)

Identification of Tomato Virus Diseases in Yinchuan, Xuzhou and Chifeng

Wen Zhihao1(), Zhang Shengfeng2, Xie Xuewen1, Chai Ali1, Li Jianshe3, Li Lei1, Fan Tengfei1, Shi Yanxia1(), Li Baoju1()   

  1. 1State Key Laboratory of Vegetable Biobreeding, Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China
    2Xuzhou Jiawang Tairui Agricultural Science and Technology Co., Ltd., Xuzhou 221133, Jiangsu, China
    3Ningxia University, Yinchuan 750021, Ningxia, China
  • Received:2022-05-12 Revised:2023-09-15 Online:2023-12-15 Published:2023-12-15

摘要:

对2021年发生在银川、徐州、赤峰的番茄叶片出现黄绿相间的斑驳、叶片皱缩卷曲、植株矮化等疑似番茄病毒病的症状进行了鉴定。利用12种番茄病毒病的特异性引物进行RT-PCR检测,发现所检测的不同地区样品中,侵染番茄最多的病毒为黄瓜花叶病毒(CMV),检出率为60.00%,其次是番茄斑萎病毒(TSWV),检出率为46.67%。通过核苷酸序列比对发现,检测出的这2种病毒与CMV(AJ131619.1)和TSWV(MK318839.1)同源性最高,相似度分别为97%和99%。同时,基于CMV和TSWV基因序列构建系统发育树表明,宁夏银川地区番茄病毒样本为CMV和TSWV复合侵染。

关键词: 番茄, 黄瓜花叶病毒, 番茄斑萎病毒, RT-PCR

Abstract:

Tomato plants were identified for the symptoms of suspected tomato virus disease in Yinchuan, Xuzhou and Chifeng in 2021, such as yellow and green mottling, leaf shrinkage and curling, plant dwarfing. The specific primers of 12 tomato virus diseases were used for RT-PCR detection. The results showed that, the virus infecting tomatoes most was cucumber mosaic virus (CMV), with a detection rate of 60.00%, followed by tomato spotted wilt virus (TSWV), with a detection rate of 46.67%. Nucleotide sequence analysis showed 97% and 99% similarity with that of CMV (AJ131619.1) and TSWV (MK318839.1). Phylogenetic trees were constructed with partial gene sequences of CMV and TSWV, respectively. The results showed that tomato plants were co-infected by CMV and TSWV in Yinchuan region.

Key words: Tomato, Cucumber mosaic virus, Tomato spotted wilt virus, RT-PCR

表1

样品信息

样品编号
Sample number
采集日期
Sampling date
采集地点
Sampling site
FQ2021032101~FQ20210321017 2021-03-21 宁夏银川
FQ2021032501~FQ2021032506 2021-03-25 江苏徐州
FQ2021032801~FQ2021032807 2021-03-28 内蒙古赤峰

图1

疑似番茄病毒病植株症状的表现

表2

本研究中所用到的引物

病毒Virus 引物Primer 引物序列Primer sequence PCR产物 PCR product (bp) 参考文献Reference
CMV CMV-F 5′- CTTTGTAGGGAGTGAACGCTG -3′ 248 [8]
CMV-R 5′- AGATGGCGGCAACGGATA -3′
ToMV ToMV-1 5′-ATGTCTTACTCAATCACTTC-3′ 480 [9]
ToMV-2 5′-TTAAGATGCAGGTGCAGAGG-3′
PVX PVX-1 5′-AGTGGTATGGAACTGGATG-3′ 308 [10]
PVX-2 5′-TTATGGTGGTGGTAGAGTGA-3′
PVY PVY-F 5′-GCTCTAGAAGTTTGGGTTATGATGGATGGGGATG-3′ 420 [11]
PVY-R 5′ -CGGAATTCAATCACCCTGCCACCTCTATC-3′
BBWV R2F-F 5′- TTGAACCCGGAAAAAGGGAGTGTG-3′ 1300 [12]
R2F-R 5′- TTGCTAGGYCCAGGYAAATTGTA-3′
TYLCV TYLCV-1 5′-TAATCATTTCCACGCCCGTCTCG-3′ 648 [13]
TYLCV-2 5′-GGTTCTCATACTTGGCTGCCTCCT-3′
TMV TMV-1 5′-CTGTTTAGCCGGTTTGGT-3′ 470 [14]
TMV-2 5′-TCCCTTTACGGACATCAC-3′
ToCV ToCV-F 5′-GGTTTGGATTTTGGTACTACATTCAGT-3′ 450 [14]
ToCV-R 5′-AAACTGCCTGCATGAAAAGTCTC-3′
TSWV TSWV-1 5′-AACCCCGAACATTTCATAGA-3′ 425 [15]
TSWV-2 5′-TCAGACAGGATTGGAGCCAC-3′
TICV TICV-CF 5′-AATCGGTAGTGACACGAGTAGCATC-3′ 416 [16]
TICV-CR 5′-CTTCAAACATCCTCCATCTGCC-3′
ToMMV CP-F 5′-ATGTCTTACGCTATTACTTCTCCG -3′ 480 [17]
CP-R 5′- TTAGGACGCTGGCGCAGAAG-3′
ToBRFV ToBRFV dF 5′-GCAATGATCAATCCTGTATCTAAGCCATT-3′ 255 [18]
ToBRFV dR 5′-CATCACTACGGTGTAATACTTCAATGTTT -3′

图2

银川地区番茄病毒病样本中不同引物PCR的扩增结果 M:BM5000;N:阴性对照(ddH2O);1:CMV;2:TSWV;3:PVX;4:PVY;5:ToMV;6:BBWV;7:TYLCV;8:TMV;9:ToCV;10:番茄传染性褪绿病毒(TICV);11:ToMMV;12:番茄褐色皱纹果病毒(ToBRFV)

表3

银川、徐州、赤峰地区番茄病毒病种类及分布

采样地
Sampling site
样品数
Sample number
检出病毒种类及数量The type and number of viruses detected 病毒检出率
Detection rate
of virus (%)
CMV ToMV TSWV PVY、PVX、BBWV、TYLCV、TMV、
ToCV、TICV、ToMMV、ToBRFV
银川Yinchuan 17 15 0 13 0 88.2
徐州Xuzhou 6 2 0 1 0 33.3
赤峰Chifeng 7 1 2 0 0 28.6
病毒检出率Detection rate (%) 60.00 6.67 46.67 0

图3

基于TSWV和CMV基因组部分核酸序列的系统进化树

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