作物杂志,2017, 第6期: 30–36 doi: 10.16035/j.issn.1001-7283.2017.06.006

• 遗传育种·种质资源·生物技术 • 上一篇    下一篇

小麦F型雄性不育系和恢复系SSR指纹图谱构建及遗传差异分析

刘丽华1,苑少华1,冯树英2,庞斌双1,李宏博1,刘阳娜1,张立平1,赵昌平1   

  1. 1北京市农林科学院杂交小麦工程技术研究中心/杂交小麦分子遗传北京市重点实验室,100097,北京
    2蓝红杂交小麦研究中心,044000,山西运城
  • 收稿日期:2017-07-04 修回日期:2017-09-22 出版日期:2017-12-15 发布日期:2018-08-26
  • 通讯作者: 张立平,赵昌平
  • 作者简介:刘丽华,助理研究员,主要从事小麦分子遗传育种研究
  • 基金资助:
    国家科技支撑计划课题(2013BAD04B01);北京市科技计划项目(D17110002517001);北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20161502);北京市农林科学院青年基金(QNJJ201509)

Genetic Difference Analysis and Construction of SSR Fingerprinting Database for F-Type Wheat Male Sterile Line and Restorer Lines

Liu Lihua1,Yuan Shaohua1,Feng Shuying2,Pang Binshuang1,Li Hongbo1,Liu Yangna1,Zhang Liping1,Zhao Changping1   

  1. 1Beijing Engineering and Technique Research Center for Hybrid Wheat,Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences,The Municipal Key Laboratory of the Molecular Genetics of Hybrid Wheat,Beijing 100097,China
    2Blue and Red Hybrid Wheat Research Center,Yuncheng 044000,Shanxi,China
  • Received:2017-07-04 Revised:2017-09-22 Online:2017-12-15 Published:2018-08-26
  • Contact: Liping Zhang,Changping Zhao

摘要:

基于荧光毛细管电泳检测系统和SSR指纹数据库管理系统,采用21对SSR核心引物对小麦F型不育系和恢复系进行SSR指纹图谱构建和遗传差异分析,以保护其品种权,同时为杂交组合的选配提供参考。结果显示21对核心SSR引物在F型不育系和442个恢复系中共检测到214个等位变异,不同位点等位变异数的变幅为6~16,平均等位变异数为10.76个;平均多态性信息含量(PIC)与基因多样性分别为0.70和0.73,21对核心SSR引物的分辨率达100%;获得了每份材料独特的DNA指纹图谱报告,为品种权保护提供了技术支撑;恢复系间的遗传距离为0.014~0.952,平均遗传距离为0.723,遗传距离大于0.500的占95%,说明恢复系间遗传多样性比较丰富;不育系与恢复系材料间的遗传距离为0.300~0.952,平均遗传距离为0.681,遗传距离大于0.500的占93%,说明不育系材料与恢复系材料间遗传差异较大,可以从中选择遗传距离大的配制组合。

关键词: 小麦, F型不育系, 恢复系, SSR标记, 指纹图谱, 遗传差异

Abstract:

In order to protect wheat variety and provide theoretical reference for the selection of hybrid wheat combinations, twenty-one core SSRs covering the entire wheat genome were used to construct fingerprinting database and analyze genetic difference for F-type wheat male sterile line and 442 restorer lines, based on fluorescence capillary electrophoresis detection platforms and SSR fingerprint database management system. Two hundred and fourteen allelic variations were detected with an average allele number of 10.76. The average of polymorphism information content (PIC) and gene diversity values were determined to be 0.70 and 0.73, respectively. The resolution of twenty-one core SSR primers was 100%. The unique DNA fingerprinting of each material was obtained, which provided technical support for the protection of variety rights. The genetic distance between the restorer lines was 0.014-0.952 with an average allele number of 0.723, and the genetic distance greater than 0.500 reached 95%, which indicated that the genetic diversity among the restorer lines was more abundant. The genetic distance between sterile line and restorer lines was 0.300-0.952, with an average allele number of 0.681, and the restorer lines accounted for 93% with genetic distance greater than 0.500, which showed that there was a great genetic difference between sterile line and restorer lines and it was beneficial to select the restorer line and sterile line configuration with large genetic distance.

Key words: Wheat, F-type male sterile line, Restorer, SSR markers, Fingerprinting database, Genetic difference

图1

引物gwm155在供试材料中检测到的8个等位变异峰 纵坐标表示荧光信号强度;横坐标上的127、130、142、144、146、148、150、152表示等位变异名称"

表1

21对SSR核心引物的多态性评估"

引物编号
Primer No.
引物名称
Primer name
等位变异数
Allele number
PIC 基因多样性
Gene diversity
WP01 cwm65 9 0.68 0.73
WP02 barc80 6 0.61 0.66
WP03 cfd72 10 0.65 0.70
WP04 gwm294 12 0.72 0.74
WP05 gwm429 12 0.69 0.73
WP06 gwm261 10 0.68 0.71
WP07 gwm155 8 0.75 0.78
WP08 gwm285 14 0.83 0.85
WP09 gdm72 8 0.72 0.75
WP10 gwm610 6 0.56 0.61
WP11 ksum62 9 0.76 0.79
WP12 barc91 12 0.77 0.79
WP13 gwm304 11 0.74 0.77
WP14 gwm67 7 0.58 0.63
WP15 cfd29 15 0.83 0.84
WP16 gwm459 12 0.81 0.82
WP17 barc198 11 0.69 0.72
WP18 cfd76 13 0.79 0.81
WP19 cfa2028 8 0.51 0.56
WP20 gwm333 6 0.63 0.67
WP21 gwm437 16 0.63 0.65

图2

小麦F型雄性不育系指纹图谱"

图3

442份小麦恢复系的UPGMA聚类图 浅色部分表示类群I,黑色部分表示类群Ⅱ"

图4

不育系与恢复系间的遗传距离分布"

[1] 赵昌平 . 中国杂交小麦研究现状与趋势. 中国农业科技导报, 2010,12(2):5-8.
[2] 中华人民共和国农业部. NY/T2859-2015.主要农作物品种真实性SSR分子标记检测普通小麦.北京: 中国农业科学技术出版社, 2015.
[3] 刘丽华, 庞斌双, 刘阳娜 , 等. 2009-2014年国家冬小麦区域试验品系的遗传多样性及群体结构分析. 麦类作物学报, 2016,26(2):165-171.
doi: 10.7606/j.issn.1009-1041.2016.02.06
[4] 刘丽华, 庞斌双, 李宏博 , 等. 2009 -2015 年北京市冬小麦区域试验品系的DNA 指纹分析. 作物杂志, 2016(5):13-18.
doi: 10.16035/j.issn.1001-7283.2016.05.003
[5] Wang L X, Qiu J, Chang L F , et al.Assessment of wheat variety distinctness using SSR markers. Journal of Integrative Agriculture, 2015,14(10):1923-1935.
doi: 10.1016/S2095-3119(15)61057-7
[6] 中华人民共和国农业部. NY/T 1432-2014.玉米品种鉴定DNA指纹方法.北京: 中国农业科学技术出版社, 2014.
[7] 王凤格, 杨扬, 易红梅 , 等. 中国玉米审定品种标准SSR指纹库的构建. 中国农业科学, 2017,50(1):1-14.
[8] 王凤格, 田红丽, 赵久然 , 等. 中国328个玉米品种(组合)SSR标记遗传多样性分析. 中国农业科学, 2014,47(5):856-864.
doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2014.05.003
[9] 中华人民共和国农业部. NY/T 1433-2014.水稻品种鉴定DNA指纹方法.北京: 中国农业科学技术出版社, 2014.
[10] 庄杰云, 施勇烽, 应杰政 , 等. 中国主栽水稻品种微卫星标记数据库的初步构建. 中国水稻科学, 2006,20(5):460-468.
doi: 10.3321/j.issn:1001-7216.2006.05.002
[11] Courtois B, Frouin J, Greco R , et al. Genetic diversity and population structure in a European collection of rice. Crop Science, 2012,52:1663-1675.
doi: 10.2135/cropsci2011.11.0588
[12] 中华人民共和国农业部. NY/T 2634-2014.棉花品种真实性鉴定 SSR分子标记法.北京: 中国农业科学技术出版社, 2014.
[13] 匡猛, 杨伟华, 许红霞 , 等. 中国棉花主栽品种DNA指纹图谱构建及SSR标记遗传多样性分析. 中国农业科学, 2011,44(1):20-27.
doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.01.003
[14] 关荣霞, 刘燕, 刘章雄 , 等. 利用SSR方法鉴定大豆品种纯度. 分子植物育种, 2003,1(3):357-360.
doi: 10.3969/j.issn.1672-416X.2003.03.010
[15] 张军, 赵团结, 盖钧镒 . 中国东北大豆育成品种遗传多样性和群体遗传结构分析. 作物学报, 2008,34(9):1529-1536.
doi: 10.3724/SP.J.1006.2008.01529
[16] 陆光远, 伍晓明, 张冬晓 , 等. SSR标记分析国家油菜区试品种的特异性和一致性. 中国农业科学, 2008,41(1):32-42.
[17] 段艳凤, 刘杰, 卞春松 , 等. 中国88个马铃薯审定品种SSR指纹图谱构建与遗传多样性分析. 作物学报, 2009,35(8):1451-1457.
doi: 10.3724/SP.J.1006.2009.01451
[18] 刘红艳, 左阳, 吴坤 , 等. 国家芝麻区域试验新品种(系)的DNA指纹分析. 作物学报, 2012,38(4):596-605.
doi: 10.3724/SP.J.1006.2012.00596
[19] 季伟, 王立新, 孙辉 , 等. 小麦SSR分析体系的简化. 农业生物技术学报, 2007,15(5):907-908.
[20] Liu K, Muse S V . PowerMarker:an integrated analysis environment for genetic marker data. Bioinformatics, 2005,21(9):2128-2129.
doi: 10.1093/bioinformatics/bti282
[21] Brandle J E, McVetty P B E .Geographical diversity parental selection and heterosis in oilseed rape. Canadian Journal of Plant Science, 1990,70:935-940.
doi: 10.4141/cjps90-115
[1] 王汉霞 单福华 田立平 马巧云 赵昌平 张风廷. 北部冬麦区冬小麦区试品种(系)的#br# 稳定性和适应性分析[J]. 作物杂志, 2018, (5): 40–44
[2] 安 霞 张海军 蒋方山 吕连杰 陈 军. 播期播量对不同穗型冬小麦群体及子粒产量的影响[J]. 作物杂志, 2018, (5): 132–136
[3] 王嘉楠 李小艳 魏石美 赵会杰 赵明奇 汪月霞. 5-ALA 对干旱胁迫下小麦幼苗#br# 光合作用及D1 蛋白的调节作用[J]. 作物杂志, 2018, (5): 121–126
[4] 赵广才,常旭虹,王德梅,陶志强,王艳杰,杨玉双,朱英杰. 小麦生产概况及其发展[J]. 作物杂志, 2018, (4): 1–7
[5] 陆梅,孙敏,任爱霞,雷妙妙,薛玲珠,高志强. 喷施叶面肥对旱地小麦生长的影响及与产量的关系[J]. 作物杂志, 2018, (4): 121–125
[6] 温辉芹,程天灵,裴自友,李雪,张立生,朱玫. 山西省近年审定小麦品种的综合性状分析[J]. 作物杂志, 2018, (4): 32–36
[7] 杨飞,马文礼,陈永伟,张战胜,王昊. 匀播、滴灌对春小麦幼穗分化进程及产量的影响[J]. 作物杂志, 2018, (4): 84–88
[8] 王君婵,高致富,李东升,朱冬梅,吴宏亚. 农业信息技术在小麦育种中的应用研究[J]. 作物杂志, 2018, (3): 37–43
[9] 张彬,李金秀,王震,冯浩,李金榜. 小麦主要农艺性状的相关性及聚类分析[J]. 作物杂志, 2018, (3): 57–60
[10] 田荟遥,蒋继志,李成斌,申芬,侯宁. 中国东北地区马铃薯致病疫霉遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2018, (3): 168–173
[11] 王拯,陈兆波,张胜全,任立平,高新欢,叶志杰,张风廷. BS系列杂交小麦在陕西渭南地区制种可行性分析[J]. 作物杂志, 2018, (3): 174–179
[12] 石晓华,杨海鹰,康文钦,秦永林,樊明寿,贾立国. 不同施氮量对马铃薯-小麦轮作体系产量及土壤氮素平衡的影响[J]. 作物杂志, 2018, (2): 108–116
[13] 黄少辉,杨云马,刘克桐,孙彦铭,杨军芳,贾良良. 河北省小麦产量潜力、产量差与效率差分析[J]. 作物杂志, 2018, (2): 118–122
[14] 宋敏,张海鹏,路兴涛,吴翠霞,张勇. 不同除草剂对冬小麦田宝盖草的防除效果[J]. 作物杂志, 2018, (2): 161–165
[15] 张帅,庞玉辉,王征宏,王黎明,陈春燕,曾占奎,王春平. 小麦种质资源农艺性状变异及其遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2018, (2): 44–51
Viewed
Full text


Abstract

Cited

  Shared   
  Discussed   
[1] 赵广才,常旭虹,王德梅,陶志强,王艳杰,杨玉双,朱英杰. 小麦生产概况及其发展[J]. 作物杂志, 2018, (4): 1 –7 .
[2] 权宝全,白冬梅,田跃霞,薛云云. 不同源库关系对花生光合特性及产量的影响[J]. 作物杂志, 2018, (4): 102 –105 .
[3] 黄学芳,黄明镜,刘化涛,赵聪,王娟玲. 覆膜穴播条件下降水年型和群体密度对张杂谷5号分蘖成穗及产量的影响[J]. 作物杂志, 2018, (4): 106 –113 .
[4] 黄文辉, 王会, 梅德圣. 农作物抗倒性研究进展[J]. 作物杂志, 2018, (4): 13 –19 .
[5] 赵云,徐彩龙,杨旭,李素真,周静,李继存,韩天富,吴存祥. 不同播种方式对麦茬夏大豆保苗和生产效益的影响[J]. 作物杂志, 2018, (4): 114 –120 .
[6] 陆梅,孙敏,任爱霞,雷妙妙,薛玲珠,高志强. 喷施叶面肥对旱地小麦生长的影响及与产量的关系[J]. 作物杂志, 2018, (4): 121 –125 .
[7] 王晓飞,徐海军,郭梦桥,肖宇,程薪宇,刘淑霞,关向军,吴耀坤,赵伟华,魏国江. 播期、密度及施肥对寒地油用型紫苏产量的影响[J]. 作物杂志, 2018, (4): 126 –130 .
[8] 朱鹏锦,庞新华,梁春,谭秦亮,严霖,周全光,欧克维. 低温胁迫对甘蔗幼苗活性氧代谢和抗氧化酶的影响[J]. 作物杂志, 2018, (4): 131 –137 .
[9] 高杰,李青风,彭秋,焦晓燕,王劲松. 不同养分配比对糯高粱物质生产及氮磷钾利用效率的影响[J]. 作物杂志, 2018, (4): 138 –142 .
[10] 商娜,杨中旭,李秋芝,尹会会,王士红,李海涛,李彤,张晗. 鲁西地区常规棉聊棉6号留叶枝栽培的适宜密度研究[J]. 作物杂志, 2018, (4): 143 –148 .