作物杂志,2020, 第5期: 6570 doi: 10.16035/j.issn.1001-7283.2020.05.010
曾艳华(), 谢和霞, 江禹奉, 周锦国, 谢小东, 周海宇, 谭贤杰, 覃兰秋(), 程伟东()
Zeng Yanhua(), Xie Hexia, Jiang Yufeng, Zhou Jinguo, Xie Xiaodong, Zhou Haiyu, Tan Xianjie, Qin Lanqiu(), Cheng Weidong()
摘要:
为了评价广西爆裂玉米农家品种的遗传多样性,利用56K SNP芯片技术对中国广西45个爆裂玉米农家品种、中国2个爆裂玉米杂交种和6个南美爆裂玉米种质进行全基因组扫描,获得多态性标记14 338个,基因分型为6 种类型。其中A/G类型最多,为5 805个;A/T类型最少,为149个。1号染色体的多态性SNP位点最多,为2 302个;10号染色体最少,为848个。45个农家品种间平均遗传相似系数为0.62,变幅为0.41~0.99,总体遗传相似度高。聚类分析将参试品种划分为三大类群,相同来源的农家品种大多聚在一起;主成分分析显示大部分农家品种聚在一起,与杂交品种和南美品种之间没有交集,表明农家品种遗传相似性较高,与杂交品种和南美品种遗传差异较大。
[1] | 于典司, 王慧, 郑洪建. 爆裂玉米研究进展. 玉米科学, 2020,28(1):86-91. |
[2] | 王玉兰, 乔春贵, 王庆枉, 等. 爆裂玉米距离分析与杂种优势. 作物学报, 1994,20(2):223-228. |
[3] |
Ramesh V K, Zeng X P, Jeffrey L B, et al. Assessment of genetic diversity in dent and popcorn (Zea mays L.) inbred lines using inter-simple sequence repeat (ISSR) amplification. Molecular Breeding, 1995,1(4):365-373.
doi: 10.1007/BF01248414 |
[4] |
Senior M L, Murphy J P, Goodman M M. Utility of SSRs for determining genetic similarities and relationships in maize using an agarose gel system. Crop Science, 1998,38:1088-1098.
doi: 10.2135/cropsci1998.0011183X003800040034x |
[5] |
Romera S J, Smith J S C, Ziegle J, et al. Pedigree analysis and haplotype sharing with in divers groups of Zea mays L. inbreds. Theoretical and Applied Genetics, 2001,103(4):567-574.
doi: 10.1007/PL00002911 |
[6] |
李玉玲, 王延召, 陈绍江, 等. 利用SSR标记划分爆裂玉米杂种优势群的研究. 华北农学报, 2004,19(3):13-17.
doi: 10.3321/j.issn:1000-7091.2004.03.004 |
[7] | 包和平, 李春成, 杨明, 等. 利用SSR标记分析45份爆裂玉米自交系遗传多样性. 吉林农业大学学报, 2008,30(3):252-256. |
[8] |
Eloi I B O, Mangolin C A, Scapim C A, et al. Selection of high heterozygosity popcorn varieties in Brazil based on SSR markers. Genetic and Molecular Research, 2012,11:1851-1860.
doi: 10.4238/2012.July.19.5 |
[9] | 吴渝生, 郑用琏, 孙荣, 等. 基于SSR标记的云南糯玉米、爆裂玉米地方种质遗传多样性研究. 作物学报, 2004,30(1):36-42. |
[10] |
Munhoz R E F, Prioli A J, Amaral A T J, et al. Genetic distances between popcorn populations based on molecular markers and correlations with heterosis estimates made by diallel analysis of hybrids. Genetic and Molecular Research, 2009,8:951-962.
doi: 10.4238/vol8-3gmr692 |
[11] |
Silvia R, Graciele H S, Valéria C P, Deoclécio D G, et al. Genetic Distance Estimated by RAPD markers and performance of topcross hybrids in popcorn. American Journal of Plant Sciences, 2012,3:1666-1673.
doi: 10.4236/ajps.2012.312203 |
[12] |
Geísa P P, José M S V, Fabyano F, et al. SNP frequency change due to selection,and association mapping in popcorn chromosome regions containing QTLs for quality traits. Genetics and Molecular Biology, 2016,39:97-110.
doi: 10.1590/1678-4685-GMB-2015-0126 pmid: 27007903 |
[13] | 董永军, 王陆军, 郝建平, 等. 玉米干种子基因组DNA提取方法的改进. 山西农业科学, 2017,45(12):1903-1906. |
[14] |
Tian H L, Wang F G, Zhao J R, et al. Development of maize SNP3072,a high-throughput compatible SNP array,for DNA fingerprinting identification of Chinese maize varieties. Molecular Breeding, 2015,35:136-145.
doi: 10.1007/s11032-015-0335-0 pmid: 26052247 |
[15] | 刘可心. 利用SNP芯片构建玉米DNA指纹技术的初步研究. 长春:吉林农业大学, 2016. |
[16] |
Yang J, Lee S H, Goddard M E, et al. GCTA:a tool for genome-wide complex trait analysis. The American Journal of Human Genetics, 2011,88(1):76-82.
doi: 10.1016/j.ajhg.2010.11.011 pmid: 21167468 |
[17] |
赵仁欣, 李森业, 郭瑞星, 等. 利用SNP芯片构建我国冬油菜参试品种DNA指纹图谱. 作物学报, 2018,44(7):956-965.
doi: 10.3724/SP.J.1006.2018.00956 |
[18] | 何余堂, 梁文科, 张丽华, 等. 玉米配子体基因研究进展. 玉米科学, 2005,13(3):10-13. |
[19] |
Xu Y B, Li P, Zou C, et al. Enhancing genetic gain in the era of molecular breeding. Journal of Experimental Botany, 2017,68(11):2641-2666.
doi: 10.1093/jxb/erx135 pmid: 28830098 |
[1] | 宫彦龙, 雷月, 闫志强, 刘雪薇, 张大双, 吴健强, 朱速松. 不同生态区粳稻资源表型遗传多样性综合评价[J]. 作物杂志, 2020, (5): 7179 |
[2] | 陈卫国, 张政, 史雨刚, 曹亚萍, 王曙光, 李宏, 孙黛珍. 211份小麦种质资源抗旱性的评价[J]. 作物杂志, 2020, (4): 5363 |
[3] | 齐冰洁, 王敏, 张智勇, 贺鑫, 刘景辉. 燕麦种质资源矿质元素的多样性分析[J]. 作物杂志, 2020, (4): 7278 |
[4] | 公丹, 王素华, 程须珍, 王丽侠. 普通豇豆应用核心种质的SSR指纹图谱构建及多样性分析[J]. 作物杂志, 2020, (4): 7983 |
[5] | 刘栋, 马琴, 李爱荣, 郭娜, 马建富, 乔海明, 苗红梅. 亚麻种质资源种子形态性状与含油量的分析与评价[J]. 作物杂志, 2020, (3): 3441 |
[6] | 刘歆,朱容,杨梅,刘章勇. 再生稻高产种质资源筛选及高产群体分析[J]. 作物杂志, 2020, (2): 2833 |
[7] | 李松,张世成,董云武,施德林,史云东. 基于SSR标记的云南腾冲水稻的遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2019, (5): 1521 |
[8] | 吕伟,韩俊梅,任果香,文飞,王若鹏,刘文萍. 山西芝麻种质资源遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2019, (5): 5763 |
[9] | 李晶,南铭. 俄罗斯和乌克兰引进冬小麦在我国西北地区的农艺性状表现和遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2019, (5): 914 |
[10] | 靳玉龙,白婷,朱明霞,刘小娇,王姗姗,张志薇,胡赟,张玉红. 利用因子分析综合评价9个西藏农家青稞品种的品质[J]. 作物杂志, 2019, (4): 5560 |
[11] | 曲志华,白苇,张丽丽,李峰,胡杨,乔海明. 170份亚麻种质资源主要农艺性状分析[J]. 作物杂志, 2019, (4): 7783 |
[12] | 张自强,王良,白晨,张惠忠,李晓东,付增娟,赵尚敏,鄂圆圆,张辉,张必周. 104份甜菜种质资源主要农艺性状分析[J]. 作物杂志, 2019, (3): 2936 |
[13] | 陈芳,徐世晓,李晓辉,刘超,周建飞,王袁,田培,杨铁钊. 基于SSR标记的80份烟草种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2019, (1): 2231 |
[14] | 黎裕, 王天宇. 美国植物种质资源保护与研究利用[J]. 作物杂志, 2018, (6): 19 |
[15] | 梅日·阿黑哈提,吾买尔夏提·塔汉,艾尔肯·艾林别克,王玉祥. 新疆及周边地区糜子种质资源表型多样性分析[J]. 作物杂志, 2018, (6): 4852 |
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