作物杂志,2026, 第3期: 4–11 doi: 10.16035/j.issn.1001-7283.2026.03.002

• 第二十八届中国科协年会学术论文专栏(主要粮食作物产能品质提升与高质量发展路径) • 上一篇    下一篇

DNA指纹技术研究进展及其在小麦品种区域试验中的应用

刘丽华(), 刘阳娜(), 张明明, 赵昌平, 杨国航, 张月坤, 魏南南, 贾松羽, 刘彩霞, 徐映, 焦爱通, 李宏博(), 庞斌双()   

  1. 北京市农林科学院杂交小麦研究所/农业农村部农作物DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建)/作物分子设计与智慧育种北京市重点实验室/杂交小麦分子遗传北京市重点实验室, 100097, 北京
  • 收稿日期:2025-03-28 修回日期:2025-04-15 出版日期:2026-06-15 发布日期:2026-06-17
  • 通讯作者: 李宏博,主要从事品种鉴定技术研究,E-mail:li-hb1208@163.com;庞斌双为共同通信作者,主要从事小麦分子育种与品种鉴定技术研究,E-mail:pangbinshuang1122@aliyun.com
  • 作者简介:刘丽华,主要从事小麦分子育种与品种鉴定技术研究,E-mail:llh216@163.com;|刘阳娜为共同第一作者,主要从事品种鉴定技术研究,E-mail:lyn8705i817@163.com
  • 基金资助:
    农业生物育种国家科技重大专项(2022ZD0401902);北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20230301);北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20230307)

DNA Fingerprinting Technology Progress and Its Application in Regional Trials of Wheat Varieties

Liu Lihua(), Liu Yangna(), Zhang Mingming, Zhao Changping, Yang Guohang, Zhang Yuekun, Wei Nannan, Jia Songyu, Liu Caixia, Xu Ying, Jiao Aitong, Li Hongbo(), Pang Binshuang()   

  1. Institute of Hybrid Wheat, Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences / Key Laboratory of Crop DNA Fingerprinting in Innovation and Utilization of the Ministry of Agriculture and Rural Affairs (Co-Construction by Ministry and Province) / Beijing Key Laboratory of Crop Molecular Design and Intelligent Breeding /Beijing Key Laboratory of Molecular Genetics in Hybrid Wheat, Beijing 100097, China
  • Received:2025-03-28 Revised:2025-04-15 Online:2026-06-15 Published:2026-06-17

摘要:

DNA指纹技术在小麦区域试验管理中具有不可替代的重要作用。自2004年起,我国开始系统性开展小麦区域试验品种的DNA指纹技术研究与检测工作,检测内容涵盖品种疑似性、真实性、纯度以及DNA位点纯合率等多个方面。经过20年发展,该技术已从探索阶段逐步迈向完善阶段。其检测规模持续扩大,检测项目日益丰富,检测能力显著提升,为小麦品种的真实性、特异性和纯度提供了有力保障,也为小麦品种审定和管理奠定了坚实的技术基础。本文系统梳理了小麦DNA指纹技术的研发思路与历史进程,全面对比分析了SSR和SNP指纹技术的优缺点,归纳了DNA指纹技术在区域试验中的应用趋势与实际成效,并针对未来发展方向提出若干建议,以期为我国小麦种业的持续健康发展提供理论依据。

关键词: 小麦, DNA指纹技术, 区域试验, 品种管理

Abstract:

DNA fingerprinting technology plays an irreplaceable and important role in the management of wheat regional trials. Since 2004, China has systematically carried out research and testing of DNA fingerprinting technology for wheat varieties in regional trials, covering multiple aspects such as identification of approximate varieties, authenticity, purity, and DNA locus homozygosity rate. After 20 years of development, this technology has gradually progressed from the exploration stage to the mature stage. Its testing scale has continuously expanded, testing items have become increasingly diverse, and testing capabilities have significantly improved, providing a strong guarantee for the authenticity, distinctiveness, and purity of wheat varieties, and laying a solid technical foundation for wheat variety approval and management. This paper systematically reviews the research ideas and historical process of wheat DNA fingerprinting technology, comprehensively compares and analyzes the advantages and disadvantages of SSR and SNP fingerprinting technologies, summarizes the application trends and practical results of DNA fingerprinting technology in regional trials, and offers several suggestions for future development, aiming to provide a theoretical basis for the sustainable and healthy development of China′s wheat seed industry.

Key words: Wheat, DNA fingerprinting technology, Regional trials, Variety management

表1

SSR和SNP检测技术的比较

项目Item SSR SNP
检测平台Detection platform 聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳 实时荧光定量PCR、竞争性等位基因特异性PCR和芯片等
检测通量Detection throughput 低、中 低、中、高
仪器成本Instrument cost 10万~300万元 50万~1000万元
检测成本Testing cost 1~2元/数据点 0.001~0.800元/数据点
技术优势Technical advantage 品种区分能力强、设备成本低、易于推广 自动化和规模化程度高、数据易统计共享
技术劣势Technical disadvantage 位点通量低 单个位点区分能力较弱
应用领域Application area 少/中量样品、少量位点检测 中/大量样品或中/大量位点集中检测
应用方向Application direction
真实性身份验证、特异性筛查和DNA位点纯合率检测等 真实性身份验证、真实性身份鉴定、特异性筛查、实质性派生性品种鉴定和纯度检测等

图1

小麦区域试验检测样品数

图2

国家区试中检测出的疑似品种和问题品种占比情况

[1] 种业管理司. 中华人民共和国种子法. (2023-04-23)[2025-03-28]. https://zys.moa.gov.cn/flfg/202304/t20230423_6426120.htm.
[2] 农业农村部. 主要农作物品种审定办法. (2021-01-21)[2025-03-28]. https://www.gov.cn/zhengce/2022-01/21/content_5721398.htm.
[3] 王凤格, 易红梅, 赵久然, 等. DNA指纹技术在玉米区域试验品种真实性及一致性检测中的应用. 分子植物育种, 2016, 14 (2):456-461.
[4] 王凤格, 杨扬, 易红梅, 等. 中国玉米审定品种标准SSR指纹库的构建. 中国农业科学, 2017, 50(1):1-14.
doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2017.01.001
[5] Tian H L, Yang Y, Yi H M, et al. New resources for genetic studies in maize (Zea mays L.): a genome-wide Maize6H-60K single nucleotide polymorphism array and its application. The Plant Journal, 2021, 105(4):1113-1122.
doi: 10.1111/tpj.v105.4
[6] 田红丽, 张如养, 范亚明, 等. Maize 6H-60K芯片在玉米实质性派生品种鉴定中的应用分析. 作物学报, 2023, 49(11):2876-2885.
doi: 10.3724/SP.J.1006.2023.23066
[7] 田红丽, 杨扬, 范亚明, 等. 用于玉米品种真实性鉴定的最优核心SNP位点集的研发. 作物学报, 2024, 50(5):1115-1123.
doi: 10.3724/SP.J.1006.2024.33052
[8] 程本义, 施勇烽, 沈伟峰, 等. 南方稻区国家水稻区域试验品种的微卫星标记分析. 中国水稻科学, 2007, 21(1):7-12.
[9] 郑向华, 叶俊华, 程朝平, 等. 利用SNP标记进行水稻品种籼粳鉴定. 作物学报, 2022, 48(2):342-352.
doi: 10.3724/SP.J.1006.2022.02085
[10] 王立新, 常利芳, 李宏博, 等. 小麦区试品系DUS测试的分子标记. 作物学报, 2010, 36(7):1114-1125.
[11] 刘丽华, 苑少华, 冯树英, 等. 小麦F型雄性不育系和恢复系SSR指纹图谱构建及遗传差异分析. 作物杂志, 2017(6):30-36.
[12] 刘丽华, 庞斌双, 刘阳娜, 等. 基于SNP标记的小麦高通量身份鉴定模式. 麦类作物学报, 2018, 38(5):529-534.
[13] Liu L H, Qu P P, Zhou Y, et al. Consensus linkage map construction and QTL mapping for eight yield-related traits in wheat using the BAAFS Wheat 90K SNP array. Journal of Integrative Agriculture, 2024, 23(11):3641-3656.
doi: 10.1016/j.jia.2023.07.028
[14] 匡猛, 王延琴, 周大云, 等. 棉花DUS测试标准品种的SSR指纹数据库构建. 棉花学报, 2015, 27(1):46-52.
doi: Y2015/V27/I1/46
[15] 孙正文, 匡猛, 马峙英, 等. 利用CottonSNP63K芯片构建棉花品种的指纹图谱. 中国农业科学, 2017, 50(24):4692-4704.
doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2017.24.003
[16] 关荣霞, 方宏亮, 何艳琴, 等. 国家大豆区域试验品种(系)SSR位点纯合度分析. 作物学报, 2012, 38(10):1760-1765.
doi: 10.3724/SP.J.1006.2012.01760
[17] 魏中艳, 李慧慧, 李骏, 等. 应用SNP精准鉴定大豆种质及构建可扫描身份证. 作物学报, 2018, 44(3):315-323.
[18] 陆光远, 伍晓明, 张冬晓, 等. SSR标记分析国家油菜区试品种的特异性和一致性. 中国农业科学, 2008, 41(1):32-42.
[19] 赵仁欣, 李森业, 郭瑞星, 等. 利用SNP芯片构建我国冬油菜参试品种DNA指纹图谱. 作物学报, 2018, 44(7):956-965.
doi: 10.3724/SP.J.1006.2018.00956
[20] 中华人民共和国农业农村部. 玉米品种鉴定技术规程SSR标记法:NY/T 1432-2014. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2014.
[21] 中华人民共和国农业农村部. 水稻品种鉴定技术规程SSR标记法:NY/T 1433-2014. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2014.
[22] 中华人民共和国农业农村部. 主要农作物品种真实性SSR分子标记检测普通小麦:NY/T 2859-2015. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2015.
[23] 中华人民共和国农业农村部. 向日葵品种真实性鉴定SSR分子标记法:NY/T 3752-2020. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2020.
[24] 中华人民共和国农业农村部. 棉花品种真实性鉴定SSR分子标记法:NY/T 2634-2022. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2022.
[25] 中华人民共和国农业农村部. 大豆品种真实性鉴定SSR分子标记法:NY/T 2595-2025. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2025.
[26] 中华人民共和国农业农村部. 玉米品种纯度鉴定SSR分子标记法:NY/T 3750-2020. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2021.
[27] 中华人民共和国农业农村部. 普通小麦品种纯度鉴定SSR分子标记法:NY/T 3749-2020. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2021.
[28] 中华人民共和国农业农村部. 水稻品种纯度鉴定SSR分子标记法:NY/T 3748-2020. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2021.
[29] 中华人民共和国农业农村部. 玉米品种真实性鉴定SNP标记法:NY/T 4022-2021. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2021.
[30] 中华人民共和国农业农村部. 小麦品种真实性鉴定SNP标记法:NY/T 4021-2021. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2021.
[31] 中华人民共和国农业农村部. 水稻品种真实性鉴定SNP标记法:NY/T 2745-2021. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2021.
[32] 王立新, 李宏博, 廖琴, 等. 利用分子标记筛查小麦相似品种(系). 作物学报, 2010, 36(9):1490-1497.
[33] 孙世贤, 王凤格, 赵久然, 等. 玉米品种试验中DNA指纹检测进展和品种管理对策. 玉米科学, 2009, 17(6):127-131.
[34] 王立新, 李云伏, 常利芳, 等. 建立小麦品种DNA指纹的方法研究. 作物学报, 2007, 33(10):1738-1740.
[35] Wang L X, Li H B, Gu T C, et al. Assessment of wheat variety stability using SSR markers. Euphytica, 2014, 195(3):435-452.
doi: 10.1007/s10681-013-1006-z
[36] Wang L X, Liu L H, Zhang F T, et al. Detecting seed purity of wheat varieties using microsatellite markers based on eliminating the influence of non-homozygous loci. Seed Science and Technology, 2014, 42(3):393-413.
doi: 10.15258/sst
[37] Wang L X, Qiu J, Chang L F, et al. Assessment of wheat variety distinctness using SSR markers. Journal of Integrative Agriculture, 2015, 14(10):1923-1935.
doi: 10.1016/S2095-3119(15)61057-7
[38] Wang L X, Pang B S, Liu L H, et al. Assessment of wheat variety uniformity using SSR markers. Molecular Plant Breeding, 2015, 21:1-17.
[39] 刘丽华, 庞斌双, 刘阳娜, 等. 2009-2014年国家冬小麦区域试验品系的遗传多样性及群体结构分析. 麦类作物学报, 2016, 36(2):165-171.
[40] 刘丽华, 庞斌双, 李宏博, 等. 2009-2015年北京市冬小麦区域试验品系的DNA指纹分析. 作物杂志, 2016(5):13-18.
[41] 国家农作物品种审定委员会. 国家农作物品种审定委员会关于印发《国家级小麦品种审定标准(2024年修订)》的通知. (2024-12-26)[2025-03-28]. https://zys.moa.gov.cn/gsgg/202412/t20241231_6468747.htm.
[42] 国际种子检验协会. 国际种子检验规程. 巴瑟斯多夫:国际种子检验协会, 2017.
[43] Röder M S, Wendehake K, Korzun V, et al. Construction and analysis of a microsatellite-based database of European wheat varieties. Theoretical and Applied Genetics, 2002, 106:67-73.
[1] 张凡, 郜峰, 段剑钊, 薛鑫, 宋志均, 朱倩, 杨春玲. 2021-2024年长江流域和黄淮海区国审小麦品种抗病性评价[J]. 作物杂志, 2026, (3): 117–125
[2] 方一涵, 陈楠楠, 王畅, 王博媛, 张立存, 梁飞. 不同施磷方式下磷肥减施对伊犁黑土区春小麦产量及磷肥利用率的影响[J]. 作物杂志, 2026, (3): 30–37
[3] 柳东亮, 王雅群, 黄琴, 王鹏月, 张鸿雁, 房琴, 李瑞奇. 同化物积累与分配对冬小麦小花发育成粒的影响及密度调控效应[J]. 作物杂志, 2026, (3): 56–63
[4] 展宗冰, 刘秀艳, 张文涛, 张礼军, 杨芳萍. 甘肃省小麦产业高质量发展路径探析[J]. 作物杂志, 2026, (3): 93–101
[5] 袁博, 张晓, 方正武, 李曼, 寿路路, 汪尊杰, 江伟, 肖龙飞, 高德荣. 小麦面粉和鲜面片色泽及相关基因组成分析[J]. 作物杂志, 2026, (2): 1–11
[6] 王丹, 王润, 胡孝庆, 于会勇, 李江涛, 程星, 郭海悦, 刘婷, 胡珍珍, 李华. 外源黄体酮影响小麦根系伸长生长的生理调控途径[J]. 作物杂志, 2026, (2): 154–159
[7] 代丽婷, 车京玉, 刘宁涛, 田超, 尹雪巍, 马勇, 王志坤, 张金鹏, 张起昌. 黑龙江省小麦根腐病病原菌鉴定[J]. 作物杂志, 2026, (2): 230–237
[8] 孙娟, 王新栋, 郄彦敏, 牛雪婧, 王丽娜, 耿立格. 引发处理对低发芽力小麦种子萌发和生理特性的影响[J]. 作物杂志, 2026, (2): 259–264
[9] 袁谦, 赵永涛, 张中州, 甄士聪, 望俊森, 张锋, 陈莉, 刘迪, 周扬. 2020-2024年黄淮麦区强筋和中强筋国审小麦品种的品质及育种策略分析[J]. 作物杂志, 2026, (2): 39–50
[10] 金艳, 宋全昊, 宋佳静, 郜战宁, 马红珍, 陈亮, 朱统泉. 黄淮南片麦区新育成小麦品种(系)高分子量麦谷蛋白遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2026, (2): 59–67
[11] 周喜旺, 刘鸿燕, 王娜, 魏志平, 王希恩, 岳维云, 王伟, 汪石俊, 孙振宇, 张耀辉. 73份甘肃陇南冬小麦品种(系)抗条锈病基因分子检测[J]. 作物杂志, 2026, (2): 82–89
[12] 贾永红, 魏海鹏, 曾潮武, 刘俊, 陈艳妮, 李建疆, 梁晓东. 基于KASP技术鉴定新疆春小麦材料抗病基因[J]. 作物杂志, 2026, (1): 15–19
[13] 叶晓娟, 刘强. 不同降水年型下春小麦产量对降水、施氮及秸秆覆盖的响应模拟[J]. 作物杂志, 2026, (1): 217–224
[14] 王云江, 王玉莹, 刘畅, 敬雪妍, 羊辰, 孙彩霞, 王春平. 施氮量对小麦籽粒主要矿质元素含量的影响和有效性分析[J]. 作物杂志, 2026, (1): 240–248
[15] 李青欣, 金秀良, 宋晓, 张珂珂, 郭腾飞, 黄绍敏, 岳克, 丁世杰, 黄明, 李友军. 有机肥部分替代氮肥对豫东冬小麦生长及土壤特性的影响[J]. 作物杂志, 2025, (6): 121–131
Viewed
Full text


Abstract

Cited

  Shared   
  Discussed   
No Suggested Reading articles found!