Assessments of farm yield and district production loss from bacterial leaf blight epidemics in rice
1
2006
... 水稻白叶枯病是由革兰氏阴性菌黄单胞杆菌水稻致病变种(Xanthomonas oryzae pv. oryzae,Xoo)引发的,是普遍危害水稻生产的一种毁灭性细菌病害,其流行范围已遍及全世界,在我国的华中、华东尤其是华南稻区,经常暴发成灾,严重时可使水稻减产50%[1].白叶枯病的病原菌可在土壤、杂草、秸秆等越冬,在水稻生长季节由伤口或水孔入侵,危害稻株维管束,使维管束阻塞,导致植物发病.其病症往往是叶尖出现病斑,随后病斑变黄和扩展,最后病斑蔓延覆盖整个叶片.如果该病发生在抽穗期,则会造成不完熟或者不育的谷粒,导致减产和稻米品质下降.由于该病原菌在维管束内危害,尚缺乏安全和高效的内吸杀菌剂;加之病原菌的入侵方式难以防备,台风和暴雨等造成的损伤和洪涝为其暴发流行创造了有利条件,使得该病往往发病急,传播快,难以控制[2].目前,选育抗病品种是防治白叶枯病非常经济且有针对性的措施.此外,由于该病原菌的致病特点及其高度变异性,选择对应有效的抗性基因是抗病育种的基础,也是抗病品种应用成功的关键.为统一命名鉴定出的白叶枯基因,日本热带农业研究中心和国际水稻研究所合作,制定了统一的鉴别标准[3]. ...
广东野生稻种质资源对白叶枯病的抗性鉴定
1
1986
... 水稻白叶枯病是由革兰氏阴性菌黄单胞杆菌水稻致病变种(Xanthomonas oryzae pv. oryzae,Xoo)引发的,是普遍危害水稻生产的一种毁灭性细菌病害,其流行范围已遍及全世界,在我国的华中、华东尤其是华南稻区,经常暴发成灾,严重时可使水稻减产50%[1].白叶枯病的病原菌可在土壤、杂草、秸秆等越冬,在水稻生长季节由伤口或水孔入侵,危害稻株维管束,使维管束阻塞,导致植物发病.其病症往往是叶尖出现病斑,随后病斑变黄和扩展,最后病斑蔓延覆盖整个叶片.如果该病发生在抽穗期,则会造成不完熟或者不育的谷粒,导致减产和稻米品质下降.由于该病原菌在维管束内危害,尚缺乏安全和高效的内吸杀菌剂;加之病原菌的入侵方式难以防备,台风和暴雨等造成的损伤和洪涝为其暴发流行创造了有利条件,使得该病往往发病急,传播快,难以控制[2].目前,选育抗病品种是防治白叶枯病非常经济且有针对性的措施.此外,由于该病原菌的致病特点及其高度变异性,选择对应有效的抗性基因是抗病育种的基础,也是抗病品种应用成功的关键.为统一命名鉴定出的白叶枯基因,日本热带农业研究中心和国际水稻研究所合作,制定了统一的鉴别标准[3]. ...
Methods and strategy for monitoring race distribution and identification of resistance genes to bacterial leaf blight (Xanthomonas campestris pv. oryzae) in rice
1
1993
... 水稻白叶枯病是由革兰氏阴性菌黄单胞杆菌水稻致病变种(Xanthomonas oryzae pv. oryzae,Xoo)引发的,是普遍危害水稻生产的一种毁灭性细菌病害,其流行范围已遍及全世界,在我国的华中、华东尤其是华南稻区,经常暴发成灾,严重时可使水稻减产50%[1].白叶枯病的病原菌可在土壤、杂草、秸秆等越冬,在水稻生长季节由伤口或水孔入侵,危害稻株维管束,使维管束阻塞,导致植物发病.其病症往往是叶尖出现病斑,随后病斑变黄和扩展,最后病斑蔓延覆盖整个叶片.如果该病发生在抽穗期,则会造成不完熟或者不育的谷粒,导致减产和稻米品质下降.由于该病原菌在维管束内危害,尚缺乏安全和高效的内吸杀菌剂;加之病原菌的入侵方式难以防备,台风和暴雨等造成的损伤和洪涝为其暴发流行创造了有利条件,使得该病往往发病急,传播快,难以控制[2].目前,选育抗病品种是防治白叶枯病非常经济且有针对性的措施.此外,由于该病原菌的致病特点及其高度变异性,选择对应有效的抗性基因是抗病育种的基础,也是抗病品种应用成功的关键.为统一命名鉴定出的白叶枯基因,日本热带农业研究中心和国际水稻研究所合作,制定了统一的鉴别标准[3]. ...
Identification and fine-mapping of a new bacterial blight resistance gene, Xa47(t), in G252, an introgression line of Yuanjiang common wild rice (Oryza rufipogon)
1
2021
... 随着分子生物学的迅猛发展,新的白叶枯病抗性基因不断被鉴定和克隆,并进行功能研究,为抗白叶枯病新品种的培育提供了新选择.截至目前,已报道和确认的与水稻白叶枯病相关的抗性基因有49个,编号已排至Xa47(t)[4].这49个基因分布在除9号和10号染色体外的其他染色体上,包括32个显性基因和17个隐性基因,除7个基因[xa15、Xa16、Xa17、Xa18、xa26(t)、xa28(t)、Xa37(t)]未被定位外,其余42个基因都已被定位,有17个基因已经被成功克隆.有趣的是,有很多抗性基因成簇分布在4号和11号染色体上.鉴定这些基因的无毒菌株(小种)和供体品种都可以在国家水稻数据中心(http://www.ricedata.cn/)查阅.本文对近年来水稻白叶枯病相关抗性基因的定位、克隆和功能研究进行了综述,归纳了我国抗白叶枯病育种的进展,为水稻白叶枯病的研究和分子育种提供参考. ...
Xa1 allelic R genes activate rice blight resistance suppressed by interfering TAL effectors
2
2020
... 白叶枯病抗性基因的克隆是在分子水平上深入认识寄主抗性和寄主与病原菌互作机制的前提.截至目前,水稻中已有17个白叶枯病抗性基因被克隆成功,包括13个显性基因和4个隐性基因,这些基因的详细信息见表1.从这些基因的功能来看,大致有2个特点:(1)基因的表达与否是抗病性的关键,例如Xa1、Xa10、xa13、Xa23、Xa27和xa41(t);(2)通过病原菌表达的蛋白与抗性基因的启动子区或者基因内部保守结构(例如LRR结构)互作,进而产生抗性,例如Xa3/Xa26、Xa10、xa13、Xa21、Xa23、Xa27和xa41(t).Xa4是最近被克隆和功能研究的一个新基因,其首次注册是在20世纪70年代初,是一个被广泛应用到育种中的抗性基因.Xa4基因编码细胞壁相关激酶(WAK),该激酶促进纤维素合成,并抑制细胞壁疏松,增强细胞壁,从而提高植株机械强度,降低植株高度,保证了持久的抗病性.中国的大多籼稻品种都携带Xa4基因.Xa23也是研究较为深入的基因,其对目前检测的生理小种都有高抗性,并且是显性的全生育期抗病.研究[5]发现,已检测的生理小种中都存在TALE效应因子(AvrXa23),AvrXa23能够特异结合Xa23启动子区的TALE结合元件(EBE),进而激活Xa23的表达,而感病xa23则不含有EBE结合元件.Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)是Xa1的等位基因,它们之间的差别在于羧基端由93个氨基酸残基组成的串联重复单元(LRR结构域)的数量不同.其中,Xa14是最少LRR重复单元数(4个)和最广抗谱的成员. ...
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
Expression of Xa1, a bacterial blight-resistance gene in rice, is induced by bacterial inoculation
1
1998
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
Functional analysis of Xa3/Xa26 family members in rice resistance to Xanthomonasoryzae pv. oryzae
1
2007
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
Improvement of multiple agronomic traits by a disease resistance gene via cell wall reinforcement
1
2017
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
The rice bacterial blight resistance gene xa5 encodes a novel form of disease resistance
1
2004
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
Xa7, a new executor R gene that confers durable and broad-spectrum resistance to bacterial blight disease in rice
1
2021
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
The rice TAL effector- dependent resistance protein Xa10triggers cell death and calcium depletion in the endoplasmic reticulum
1
2014
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
Promoter mutations of an essential gene for pollen development result in disease resistance in rice
1
2006
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
A catalytically impaired mutant of the rice Xa21 receptor kinase confers partial resistance to Xanthomonas oryzae pv.oryzae
1
2003
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
Xa23 is an executor R protein and confers broad-spectrum disease resistance in rice
1
2015
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
A paralog of the MtN3/saliva family recessively confers race-specific resistance to Xanthomonas oryzae in rice
1
2011
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
R gene expression induced by a type-III effector triggers disease resistance in rice
1
2005
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
A knowledge-based molecular screen uncovers a broad-spectrum OsSWEET14 resistance allele to bacterial blight from wild rice
1
2015
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
水稻抗白叶枯病基因Xa47(t)a的克隆及生物信息学分析
1
[2023-
... The cloned and functionally studied resistance genes to bacterial blight
Table 1 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 基因座 Gene locus | 功能特点 Function characteristic | 参考文献 Reference |
Xa1
| +
| 4
| LOC_Os04g53120
| Xa1是NBS-LRR类成员,在病原体和伤口接种下被诱导表达 | [6]
|
Xa2 | + | 4 | LOC_Os04g53120 | Xa2、Xa14、Xa31(t)、Xa45(t)均是Xa1的等位基因,能被任一典型结构的TALE激活抗性(ETI)并被iTALE所抑制(ETS)
| [5]
|
Xa14 | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa31(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa45(t) | + | 4 | LOC_Os04g53120 |
Xa3/Xa26
| +
| 11
| LOC_Os11g47000
| Xa3/Xa26是组成型表达基因,编码LRR受体激酶蛋白,抗病Xa3/Xa26和感病xa3/xa26蛋白序列的差异导致了抗性的差异 | [7]
|
Xa4
| +
| 11
| LOC_Os11g47140
| Xa4编码细胞壁相关激酶,通过加强细胞壁增加机械强度并降低植株高度 | [8]
|
xa5
| -
| 5
| LOC_Os05g01710
| xa5编码一个真核生物转录因子ⅡA伽马亚基(TFⅡAγ),抗病xa5与感病Xa5的蛋白序列存在1个氨基酸变异是导致抗性差异的原因 | [9]
|
Xa7
| +
| 6
| 日本晴中缺失该基因位点,镇恢084的6号染色体上M10标记左侧28 kb内的G1基因即Xa7 | Xa7受AvrXa7和PthXo3效应子诱导表达,进而产生抗性
| [10]
|
Xa10
| +
| 11
| LOC_Os11g37570
| Xa10启动子区域含有特异激活Xa10表达的AvrXa10结合元件,Xa10表达导致细胞程序性死亡 | [11]
|
xa13
| -
| 8
| LOC_Os08g42350
| 隐性xa13的启动子突变导致宿主与病原体相互作用时该基因表达下调,进而产生抗性 | [12]
|
Xa21
| +
| 11
| LOC_Os11g35500
| Xa21编码类受体激酶蛋白,与激活因子AvrXa21共同调控白叶枯病的抗性 | [13]
|
Xa23
| +
| 11
| LOC_Os11g37620
| Xa23启动子区含有AvrXa23结合元件,能够特异激活Xa23的表达,进而引发超敏反应 | [14]
|
xa25
| -
| 12
| LOC_Os12g29220
| xa25编码MtN3/saliva家族的一员,对菲律宾小种PXO339表现专抗 | [15]
|
Xa27 | + | 6 | LOC_Os06g39810 | Xa27表达依赖于携带avrXa27的病菌侵染 | [16] |
xa41(t)
| -
| 11
| LOC_Os11g31190
| xa41(t)启动子区18个碱基的缺失与抗性密切相关 | [17]
|
Xa47(t)a
| +
| 11
| LOC_Os11g46200
| Xa47(t)a是Xa47(t)的A基因型,编码NLR类蛋白,受病原菌诱导表达 | [18]
|
2 水稻中已定位的白叶枯病抗性基因除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
A novel resistance gene for bacterial blight in rice, Xa43(t) identified by GWAS, confirmed by QTL mapping using a bi-parental population
2
2019
... 除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
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Xa38
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Identification of novel recessive gene Xa44(t) conferring resistance to bacterial blight races in rice by QTL linkage analysis using an SNP chip
2
2018
... 除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
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|
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
High-resolution genetic mapping of a novel bacterial blight resistance gene xa-45(t) identified from Oryza glaberrima and transferred to Oryza sativa
2
2020
... 除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
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xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
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xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
Xa35(t) | + | 11 | RM7654 (1.1 cM), RM6293 ( 0.7 cM) | | [38] |
Xa36(t) | + | 11 | RM224-RM2136 (4.5 cM) | | [39] |
Xa38
| +
| 4
| Oso4g53050-1
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|
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| -
| 3
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xa-45(t) | - | 8 | IRGSP-1.0 (80 kb) | 9个基因 | [21] |
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Identification of the novel bacterial blight resistance gene Xa46(t) by mapping and expression analysis of the rice mutant H120
2
2020
... 除上述已克隆的17个基因外,目前共有25个白叶枯病抗性基因被定位,包括15个显性基因和10个隐性基因,其中大多数基因都被精细定位,列于表2.Xa43(t)、xa44(t)、xa-45(t)和Xa46(t)是最近被精细定位的4个基因.Xa43(t)和xa44(t)都被定位于11号染色体,Xa43(t)的候选基因(Os11g0687700和Os11g0688000)和xa44(t)的候选基因(Os11g0690066和Os11g0690466)在接种后的表达显著提高[19-20].xa-45(t)被定位于8号染色体IRGSP-1.0上的80 kb区域,有9个候选基因,从LOC_Os08g42410中开发的一个STS标记与xa-45(t)共分离[21].Xa46(t)被定位在11号染色体RM26981和RM26984标记之间约65.34 kb的区域内,Chen等[22]通过RNA-seq分析差异表达基因,LOC_Os11g37540等位基因最可能是Xa46(t)的候选基因. ...
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
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Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
Xa35(t) | + | 11 | RM7654 (1.1 cM), RM6293 ( 0.7 cM) | | [38] |
Xa36(t) | + | 11 | RM224-RM2136 (4.5 cM) | | [39] |
Xa38
| +
| 4
| Oso4g53050-1
| LOC_Os04g53030, LOC_Os04g53050, LOC_Os04g53060 | [40]
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Xa39 | + | 11 | RM26985-DM13 (0.51 cM) | LOC_Os11g37759 | [41] |
Xa40 | + | 11 | RM27320-ID55.WA18-5 (80 kb) | LOC_Os11g46900 | [42] |
xa42
| -
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| KGC3_16.342-KGC3_16.399 (57 kb)
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|
Xa43(t) | + | 11 | IBb27os11_14-S_BB11.ssr_9 (119 kb) | LOC_Os11g46060, LOC_Os11g46100 | [19] |
xa44(t) | - | 11 | #46. Os11g0689400-#5. RM27318 (120 kb) | Os11g0690066, Os11g0690466 | [20] |
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Mapping of bacterial blight resistance gene xa8 in rice (Oryza sativa L.)
1
2014
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
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xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
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Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
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Xa38
| +
| 4
| Oso4g53050-1
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|
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xa42
| -
| 3
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|
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Mapping of bacterial blight resistance gene Xa11 on rice chromosome 3
1
2009
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
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|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
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Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
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xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
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Xa38
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|
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xa42
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
水稻抗白叶枯病基因Xa12区间连锁图的构建
1
2006
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
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Xa38
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|
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xa42
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|
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Chromosomal location of xa19, a broad- spectrum rice bacterial blight-resistant gene from XM5, a mutant line from IR24
1
2023
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
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|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
Xa35(t) | + | 11 | RM7654 (1.1 cM), RM6293 ( 0.7 cM) | | [38] |
Xa36(t) | + | 11 | RM224-RM2136 (4.5 cM) | | [39] |
Xa38
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|
Xa39 | + | 11 | RM26985-DM13 (0.51 cM) | LOC_Os11g37759 | [41] |
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xa-45(t) | - | 8 | IRGSP-1.0 (80 kb) | 9个基因 | [21] |
Xa46(t) | + | 11 | RM26981-RM26984 (65.34 kb) | LOC_Os11g37540, LOC_Os11g37550 | [22] |
3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Linkage analysis of rice bacterial blight resistance gene xa20 in XM6, a mutant line from IR24
1
2021
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Localizing the bacterial blight resistance gene, Xa22(t), to a 100-kilobase bacterial artificial chromosome
1
2003
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Fine genetic mapping of xa24, a recessive gene for resistance against Xanthomonas oryzae pv. oryzae in rice
1
2008
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
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| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
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|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
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Xa38
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
New gene for bacterial blight resistance in rice located on chromosome 12 identified from minghui 63, an elite restorer line
1
2002
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
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Xa36(t) | + | 11 | RM224-RM2136 (4.5 cM) | | [39] |
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
药用野生稻转育后代一个抗白叶枯病新基因的定位
1
2004
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
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|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
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Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
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Xa46(t) | + | 11 | RM26981-RM26984 (65.34 kb) | LOC_Os11g37540, LOC_Os11g37550 | [22] |
3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
水稻抗白叶枯病近等基因系CBB30的培育及Xa30(t)的初步定位
1
2007
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
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|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
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Xa38
| +
| 4
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|
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xa42
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|
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
水稻抗白叶枯病新基因Xa32(t)的鉴定和初步定位
1
2009
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
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Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
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Xa38
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|
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Identifying and mapping new gene xa32(t) for resistance to bacterial blight (Xanthomonas oryzae pv. oryzae, Xoo) from Oryza meyeriana L
1
2008
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
Xa35(t) | + | 11 | RM7654 (1.1 cM), RM6293 ( 0.7 cM) | | [38] |
Xa36(t) | + | 11 | RM224-RM2136 (4.5 cM) | | [39] |
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|
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Identification and fine-mapping of Xa33, a novel gene for resistance to Xanthomonas oryzae pv. oryzae
1
2012
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
Xa35(t) | + | 11 | RM7654 (1.1 cM), RM6293 ( 0.7 cM) | | [38] |
Xa36(t) | + | 11 | RM224-RM2136 (4.5 cM) | | [39] |
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xa-45(t) | - | 8 | IRGSP-1.0 (80 kb) | 9个基因 | [21] |
Xa46(t) | + | 11 | RM26981-RM26984 (65.34 kb) | LOC_Os11g37540, LOC_Os11g37550 | [22] |
3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Identification of microsatellite markers (SSR) linked to a new bacterial blight resistance gene xa33(t) in rice cultivar ‘Ba7’
1
2009
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
Xa35(t) | + | 11 | RM7654 (1.1 cM), RM6293 ( 0.7 cM) | | [38] |
Xa36(t) | + | 11 | RM224-RM2136 (4.5 cM) | | [39] |
Xa38
| +
| 4
| Oso4g53050-1
| LOC_Os04g53030, LOC_Os04g53050, LOC_Os04g53060 | [40]
|
Xa39 | + | 11 | RM26985-DM13 (0.51 cM) | LOC_Os11g37759 | [41] |
Xa40 | + | 11 | RM27320-ID55.WA18-5 (80 kb) | LOC_Os11g46900 | [42] |
xa42
| -
| 3
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|
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Genetic analysis and molecular mapping of a novel recessive gene xa34(t) for resistance against Xanthomonas oryzae pv.oryzae
1
2011
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
Xa35(t) | + | 11 | RM7654 (1.1 cM), RM6293 ( 0.7 cM) | | [38] |
Xa36(t) | + | 11 | RM224-RM2136 (4.5 cM) | | [39] |
Xa38
| +
| 4
| Oso4g53050-1
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|
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xa42
| -
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|
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
小粒野生稻抗白叶枯病新基因的鉴定与初步定位
1
2010
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
Xa35(t) | + | 11 | RM7654 (1.1 cM), RM6293 ( 0.7 cM) | | [38] |
Xa36(t) | + | 11 | RM224-RM2136 (4.5 cM) | | [39] |
Xa38
| +
| 4
| Oso4g53050-1
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|
Xa39 | + | 11 | RM26985-DM13 (0.51 cM) | LOC_Os11g37759 | [41] |
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xa42
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|
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
水稻抗白叶枯病新基因的初步定位
1
2010
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
Xa35(t) | + | 11 | RM7654 (1.1 cM), RM6293 ( 0.7 cM) | | [38] |
Xa36(t) | + | 11 | RM224-RM2136 (4.5 cM) | | [39] |
Xa38
| +
| 4
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|
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xa42
| -
| 3
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| LOC_Os03g28389, LOC_Os03g28400, LOC_Os03g28420, LOC_Os03g28410, LOC_Os03g28910 | [43]
|
Xa43(t) | + | 11 | IBb27os11_14-S_BB11.ssr_9 (119 kb) | LOC_Os11g46060, LOC_Os11g46100 | [19] |
xa44(t) | - | 11 | #46. Os11g0689400-#5. RM27318 (120 kb) | Os11g0690066, Os11g0690466 | [20] |
xa-45(t) | - | 8 | IRGSP-1.0 (80 kb) | 9个基因 | [21] |
Xa46(t) | + | 11 | RM26981-RM26984 (65.34 kb) | LOC_Os11g37540, LOC_Os11g37550 | [22] |
3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
New PCR-based sequence-tagged site marker for bacterial blight resistance gene Xa38 of rice
1
2012
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
Xa35(t) | + | 11 | RM7654 (1.1 cM), RM6293 ( 0.7 cM) | | [38] |
Xa36(t) | + | 11 | RM224-RM2136 (4.5 cM) | | [39] |
Xa38
| +
| 4
| Oso4g53050-1
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|
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xa42
| -
| 3
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|
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Xa39,a novel dominant gene conferring broad-spectrum resistance to Xanthomonas oryzae pv. oryzae in rice
1
2015
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
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Xa38
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|
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xa42
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|
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Identification and fine-mapping of a new resistance gene, Xa40, conferring resistance to bacterial blight races in rice (Oryza sativa L.)
1
2015
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
Xa35(t) | + | 11 | RM7654 (1.1 cM), RM6293 ( 0.7 cM) | | [38] |
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Xa38
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|
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|
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3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
High-resolution mapping and characterization of xa42, a resistance gene against multiple Xanthomonas oryzae pv. oryzae races in rice (Oryza sativa L.)
1
2018
... The mapped resistance genes to bacterial blight
Table 2 基因 Gene | 显/隐性 Dominance(+)/recessive(-) | 染色体 Chromosome | 连锁标记或位置 Linked marker or position | 候选基因 Candidate gene | 参考文献 Reference |
xa8
| -
| 7
| RM21044 (7.0 cM), RM21045 (9.9 cM)
| LOC_Os07g07400, LOC_Os07g07410, LOC_Os07g07420 | [23]
|
Xa11 | + | 3 | RM347 (2.0 cM), KUX11 (1.0 cM) | 9个BAC克隆 | [24] |
Xa12 | + | 4 | | | [25] |
xa19 | - | 7 | RM8262-RM6728 (0.8 cM) | | [26] |
xa20 | - | 3 | KIC3-33.88 (33.0 Mb), KIC3-34.06 (33.2 Mb) | 34个基因 | [27] |
Xa22(t) | + | 11 | R1506-M3H8 (100 kb) | | [28] |
xa24(t) | - | 2 | RM14222-RM14226 (0.07 cM) | 16个基因 | [29] |
Xa25(t) | + | 12 | NBS109 (2.5 cM), G1314 (7.3 cM) | | [30] |
Xa29(t) | + | 1 | C904-R596 (1.3 cM) | | [31] |
Xa30(t) | + | 11 | RM1341 (11.4 cM) | | [32] |
Xa32(t) | + | 11 | ZCK24 (0.5 cM), RM6293 (1.5 cM) | | [33] |
xa32(t) | - | 12 | RM20A (1.7 cM) | | [34] |
Xa33 | + | 7 | RMWR7.1 (0.9 cM), RMWR7.6 (1.2 cM) | 8个基因 | [35] |
xa33(t) | - | 6 | RM20593 | | [36] |
xa34(t) | - | 1 | RM10929-BGID25 (204 kb) | 21个开放阅读框 | [37] |
Xa35(t) | + | 11 | RM7654 (1.1 cM), RM6293 ( 0.7 cM) | | [38] |
Xa36(t) | + | 11 | RM224-RM2136 (4.5 cM) | | [39] |
Xa38
| +
| 4
| Oso4g53050-1
| LOC_Os04g53030, LOC_Os04g53050, LOC_Os04g53060 | [40]
|
Xa39 | + | 11 | RM26985-DM13 (0.51 cM) | LOC_Os11g37759 | [41] |
Xa40 | + | 11 | RM27320-ID55.WA18-5 (80 kb) | LOC_Os11g46900 | [42] |
xa42
| -
| 3
| KGC3_16.342-KGC3_16.399 (57 kb)
| LOC_Os03g28389, LOC_Os03g28400, LOC_Os03g28420, LOC_Os03g28410, LOC_Os03g28910 | [43]
|
Xa43(t) | + | 11 | IBb27os11_14-S_BB11.ssr_9 (119 kb) | LOC_Os11g46060, LOC_Os11g46100 | [19] |
xa44(t) | - | 11 | #46. Os11g0689400-#5. RM27318 (120 kb) | Os11g0690066, Os11g0690466 | [20] |
xa-45(t) | - | 8 | IRGSP-1.0 (80 kb) | 9个基因 | [21] |
Xa46(t) | + | 11 | RM26981-RM26984 (65.34 kb) | LOC_Os11g37540, LOC_Os11g37550 | [22] |
3 白叶枯病抗性QTL的研究进展由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
利用DH群体定位白叶枯病抗性QTL
1
2009
... 由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
优质稻“粤农丝苗”白叶枯病抗性遗传分析及主效QTL qBB-11-1的精细定位
1
2022
... 由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Identification of quantitative trait loci associated with resistance to Xanthomonas oryzae pv. oryzae pathotypes prevalent in South China
1
2022
... 由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Genome-wide association study and transcriptome analysis discover new genes for bacterial leaf blight resistance in rice (Oryza sativa L.)
1
2021
... 由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Genome-wide association mapping and gene expression analysis reveal the negative role of OsMYB21 in regulating bacterial blight resistance in rice
1
2021
... 由于白叶枯病菌具有多样性和快速进化的特性,非小种特异性数量抗性QTL的鉴定和利用成为防治白叶枯病的有效策略.目前,利用重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体和双单倍体(doubled haploid,DH)群体定位到的白叶枯病抗性QTL已经超过70多个.如张剑霞等[44]以珍汕97和武育梗2号构建DH群体,共检测到26个QTL.薛皦等[45]利用粤农丝苗和丽江新团黑谷构建RILs及回交群体,在11号染色体精细定位到一个抗性QTL qBB-11-1.随着测序技术的快速发展,基于连锁不平衡的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来鉴定QTL/基因的高效方法之一,并迅速应用于遗传分析.Lu等[46]鉴定了421份水稻对我国华南地区强毒力菌株C5和IV型白叶枯病菌的抗性,根据表型和GWAS鉴定到13个白叶枯病抗性QTL,其中有5个QTL区间为已克隆或精细定位的水稻白叶枯病抗性基因,其余8个为未报道的新位点,并在5号染色体上的一个新位点qBB5.1鉴定到一个抗病候选基因LOC_Os05g01610.Shu等[47]通过259份水稻材料对2个白叶枯病小种的抗性变异数据,结合GWAS和转录组分析,检测到抗感水稻材料之间109个差异表达基因,并获得2个候选基因LOC_ Os07g02560和LOC_Os07g02570.Yang等[48]对华南水稻核心种质白叶枯病抗性进行了全基因组关联分析,共鉴定出17个与抗性相关的QTL,其中有13个新发现的QTL,并鉴定出一个新位点qBBR11-4的候选基因OsMYB21,过量表达OsMYB21基因导致白叶枯病抗性下降. ...
Introgression of bacterial blight resistance genes Xa7, Xa21, Xa22 and Xa23 into hybrid rice restorer lines by molecular marker-assisted selection
1
2012
... 早期育种家们通过常规育种的办法,选育出一批抗白叶枯病的品种和材料.但该方法耗时耗力,对于多基因聚合和隐性基因的利用比较困难.随着白叶枯病抗性基因不断被鉴定和分子标记的开发,分子标记辅助选择已成为育种常规化的手段.利用紧密连锁的分子标记或功能标记来追踪抗性基因,可在早代选择并不受生理小种和环境的影响,提高育种效率.利用白叶枯病抗性单基因、多基因、以及其他优异基因的聚合一直被广泛应用于水稻的分子育种.Xa3和Xa4是最早使用的主要抗性基因,随着抗性被病原菌不断克服,xa5、Xa7、Xa21和Xa23等广谱抗性基因逐渐被应用到育种中,这几个基因也是目前抗白叶枯病分子育种中最常利用的基因.由于白叶枯病抗性基因之间存在互作性,不同抗性基因的组合能够增强对病原菌的抗性和拓宽抗谱,因此,白叶枯病抗性的聚合成为抗病品种培育的一个重要途径,常见的组合有Xa4/xa5、Xa4/Xa21、Xa7/Xa21、Xa21/Xa23、Xa4/Xa21/Xa27、xa5/xa13/Xa21、Xa4/xa5/xa13/Xa21等.Huang等[49]将4个白叶枯病抗性基因Xa7、Xa21、Xa22和Xa23聚合到华恢1035,后代材料对我国11个代表性的白叶枯病菌表现出不同程度的抗性水平.此外,在分子育种过程中,往往需要同时兼顾选择其他优良性状相关基因,例如其他抗病虫害基因、优良米质基因和杂交水稻相关的育性基因等.Kumar等[50]通过回交育种,将白叶枯病抗性基因Xa21和稻瘟病抗性基因Pi54聚合到恢复系RPHR- 1005,获得抗白叶枯病和稻瘟病的后代材料.Xu等[51]以水稻品种Kitaake为背景,通过基因编辑技术(CRISPR/Cas9)对3个感病基因(OsSWEET11、OsSWEET13和OsSWEET14)的效应子结合元件(effector binding elements,EBEs)进行编辑修饰,创制了水稻白叶枯病广谱抗性的新种质.Zhou等[52]对隆科638S进行基因编辑,利用CRISPR/Cas9技术敲除了3个感病基因Bsr-d1、Pi21和ERF922,获得的新种质对白叶枯病和稻瘟病具有广谱抗性,其中Pi21或ERF922的敲除可以提高白叶枯病抗性.陈深等[53]研究分析华南水稻白叶枯病菌致病性,发现华南白叶枯病菌主要有IV、V和IX 3种致病型,其中,IV型菌是华南稻区过去的优势致病型,Xa4是其主要的抗性基因,而V型菌和IX型菌具有强毒性,对现在的主栽品种有极高的致病率.目前,V型菌已经演变为华南水稻优势致病菌系,毒性更强的IX型菌发展趋势很快,单个抗性基因或者专一抗性容易被克服,所以华南地区水稻抗白叶枯病育种可利用xa5、Xa7、Xa23和xa34(t)等广谱抗性基因或者多基因聚合,以确保持久稳定的抗性. ...
Marker- assisted introgression of the major bacterial blight resistance gene, Xa21 and blast resistance gene, pi54 into RPHR-1005, the restorer line of the popular rice hybrid, DRRH3
1
2016
... 早期育种家们通过常规育种的办法,选育出一批抗白叶枯病的品种和材料.但该方法耗时耗力,对于多基因聚合和隐性基因的利用比较困难.随着白叶枯病抗性基因不断被鉴定和分子标记的开发,分子标记辅助选择已成为育种常规化的手段.利用紧密连锁的分子标记或功能标记来追踪抗性基因,可在早代选择并不受生理小种和环境的影响,提高育种效率.利用白叶枯病抗性单基因、多基因、以及其他优异基因的聚合一直被广泛应用于水稻的分子育种.Xa3和Xa4是最早使用的主要抗性基因,随着抗性被病原菌不断克服,xa5、Xa7、Xa21和Xa23等广谱抗性基因逐渐被应用到育种中,这几个基因也是目前抗白叶枯病分子育种中最常利用的基因.由于白叶枯病抗性基因之间存在互作性,不同抗性基因的组合能够增强对病原菌的抗性和拓宽抗谱,因此,白叶枯病抗性的聚合成为抗病品种培育的一个重要途径,常见的组合有Xa4/xa5、Xa4/Xa21、Xa7/Xa21、Xa21/Xa23、Xa4/Xa21/Xa27、xa5/xa13/Xa21、Xa4/xa5/xa13/Xa21等.Huang等[49]将4个白叶枯病抗性基因Xa7、Xa21、Xa22和Xa23聚合到华恢1035,后代材料对我国11个代表性的白叶枯病菌表现出不同程度的抗性水平.此外,在分子育种过程中,往往需要同时兼顾选择其他优良性状相关基因,例如其他抗病虫害基因、优良米质基因和杂交水稻相关的育性基因等.Kumar等[50]通过回交育种,将白叶枯病抗性基因Xa21和稻瘟病抗性基因Pi54聚合到恢复系RPHR- 1005,获得抗白叶枯病和稻瘟病的后代材料.Xu等[51]以水稻品种Kitaake为背景,通过基因编辑技术(CRISPR/Cas9)对3个感病基因(OsSWEET11、OsSWEET13和OsSWEET14)的效应子结合元件(effector binding elements,EBEs)进行编辑修饰,创制了水稻白叶枯病广谱抗性的新种质.Zhou等[52]对隆科638S进行基因编辑,利用CRISPR/Cas9技术敲除了3个感病基因Bsr-d1、Pi21和ERF922,获得的新种质对白叶枯病和稻瘟病具有广谱抗性,其中Pi21或ERF922的敲除可以提高白叶枯病抗性.陈深等[53]研究分析华南水稻白叶枯病菌致病性,发现华南白叶枯病菌主要有IV、V和IX 3种致病型,其中,IV型菌是华南稻区过去的优势致病型,Xa4是其主要的抗性基因,而V型菌和IX型菌具有强毒性,对现在的主栽品种有极高的致病率.目前,V型菌已经演变为华南水稻优势致病菌系,毒性更强的IX型菌发展趋势很快,单个抗性基因或者专一抗性容易被克服,所以华南地区水稻抗白叶枯病育种可利用xa5、Xa7、Xa23和xa34(t)等广谱抗性基因或者多基因聚合,以确保持久稳定的抗性. ...
Engineering broad-spectrum bacterial blight resistance by simultaneously disrupting variable TALE-binding elements of multiple susceptibility genes in rice
1
2019
... 早期育种家们通过常规育种的办法,选育出一批抗白叶枯病的品种和材料.但该方法耗时耗力,对于多基因聚合和隐性基因的利用比较困难.随着白叶枯病抗性基因不断被鉴定和分子标记的开发,分子标记辅助选择已成为育种常规化的手段.利用紧密连锁的分子标记或功能标记来追踪抗性基因,可在早代选择并不受生理小种和环境的影响,提高育种效率.利用白叶枯病抗性单基因、多基因、以及其他优异基因的聚合一直被广泛应用于水稻的分子育种.Xa3和Xa4是最早使用的主要抗性基因,随着抗性被病原菌不断克服,xa5、Xa7、Xa21和Xa23等广谱抗性基因逐渐被应用到育种中,这几个基因也是目前抗白叶枯病分子育种中最常利用的基因.由于白叶枯病抗性基因之间存在互作性,不同抗性基因的组合能够增强对病原菌的抗性和拓宽抗谱,因此,白叶枯病抗性的聚合成为抗病品种培育的一个重要途径,常见的组合有Xa4/xa5、Xa4/Xa21、Xa7/Xa21、Xa21/Xa23、Xa4/Xa21/Xa27、xa5/xa13/Xa21、Xa4/xa5/xa13/Xa21等.Huang等[49]将4个白叶枯病抗性基因Xa7、Xa21、Xa22和Xa23聚合到华恢1035,后代材料对我国11个代表性的白叶枯病菌表现出不同程度的抗性水平.此外,在分子育种过程中,往往需要同时兼顾选择其他优良性状相关基因,例如其他抗病虫害基因、优良米质基因和杂交水稻相关的育性基因等.Kumar等[50]通过回交育种,将白叶枯病抗性基因Xa21和稻瘟病抗性基因Pi54聚合到恢复系RPHR- 1005,获得抗白叶枯病和稻瘟病的后代材料.Xu等[51]以水稻品种Kitaake为背景,通过基因编辑技术(CRISPR/Cas9)对3个感病基因(OsSWEET11、OsSWEET13和OsSWEET14)的效应子结合元件(effector binding elements,EBEs)进行编辑修饰,创制了水稻白叶枯病广谱抗性的新种质.Zhou等[52]对隆科638S进行基因编辑,利用CRISPR/Cas9技术敲除了3个感病基因Bsr-d1、Pi21和ERF922,获得的新种质对白叶枯病和稻瘟病具有广谱抗性,其中Pi21或ERF922的敲除可以提高白叶枯病抗性.陈深等[53]研究分析华南水稻白叶枯病菌致病性,发现华南白叶枯病菌主要有IV、V和IX 3种致病型,其中,IV型菌是华南稻区过去的优势致病型,Xa4是其主要的抗性基因,而V型菌和IX型菌具有强毒性,对现在的主栽品种有极高的致病率.目前,V型菌已经演变为华南水稻优势致病菌系,毒性更强的IX型菌发展趋势很快,单个抗性基因或者专一抗性容易被克服,所以华南地区水稻抗白叶枯病育种可利用xa5、Xa7、Xa23和xa34(t)等广谱抗性基因或者多基因聚合,以确保持久稳定的抗性. ...
Engineering of rice varieties with enhanced resistances to both blast and bacterial blight diseases via CRISPR/Cas9
1
2021
... 早期育种家们通过常规育种的办法,选育出一批抗白叶枯病的品种和材料.但该方法耗时耗力,对于多基因聚合和隐性基因的利用比较困难.随着白叶枯病抗性基因不断被鉴定和分子标记的开发,分子标记辅助选择已成为育种常规化的手段.利用紧密连锁的分子标记或功能标记来追踪抗性基因,可在早代选择并不受生理小种和环境的影响,提高育种效率.利用白叶枯病抗性单基因、多基因、以及其他优异基因的聚合一直被广泛应用于水稻的分子育种.Xa3和Xa4是最早使用的主要抗性基因,随着抗性被病原菌不断克服,xa5、Xa7、Xa21和Xa23等广谱抗性基因逐渐被应用到育种中,这几个基因也是目前抗白叶枯病分子育种中最常利用的基因.由于白叶枯病抗性基因之间存在互作性,不同抗性基因的组合能够增强对病原菌的抗性和拓宽抗谱,因此,白叶枯病抗性的聚合成为抗病品种培育的一个重要途径,常见的组合有Xa4/xa5、Xa4/Xa21、Xa7/Xa21、Xa21/Xa23、Xa4/Xa21/Xa27、xa5/xa13/Xa21、Xa4/xa5/xa13/Xa21等.Huang等[49]将4个白叶枯病抗性基因Xa7、Xa21、Xa22和Xa23聚合到华恢1035,后代材料对我国11个代表性的白叶枯病菌表现出不同程度的抗性水平.此外,在分子育种过程中,往往需要同时兼顾选择其他优良性状相关基因,例如其他抗病虫害基因、优良米质基因和杂交水稻相关的育性基因等.Kumar等[50]通过回交育种,将白叶枯病抗性基因Xa21和稻瘟病抗性基因Pi54聚合到恢复系RPHR- 1005,获得抗白叶枯病和稻瘟病的后代材料.Xu等[51]以水稻品种Kitaake为背景,通过基因编辑技术(CRISPR/Cas9)对3个感病基因(OsSWEET11、OsSWEET13和OsSWEET14)的效应子结合元件(effector binding elements,EBEs)进行编辑修饰,创制了水稻白叶枯病广谱抗性的新种质.Zhou等[52]对隆科638S进行基因编辑,利用CRISPR/Cas9技术敲除了3个感病基因Bsr-d1、Pi21和ERF922,获得的新种质对白叶枯病和稻瘟病具有广谱抗性,其中Pi21或ERF922的敲除可以提高白叶枯病抗性.陈深等[53]研究分析华南水稻白叶枯病菌致病性,发现华南白叶枯病菌主要有IV、V和IX 3种致病型,其中,IV型菌是华南稻区过去的优势致病型,Xa4是其主要的抗性基因,而V型菌和IX型菌具有强毒性,对现在的主栽品种有极高的致病率.目前,V型菌已经演变为华南水稻优势致病菌系,毒性更强的IX型菌发展趋势很快,单个抗性基因或者专一抗性容易被克服,所以华南地区水稻抗白叶枯病育种可利用xa5、Xa7、Xa23和xa34(t)等广谱抗性基因或者多基因聚合,以确保持久稳定的抗性. ...
华南水稻白叶枯病菌致病性分化检测与分析
2
2017
... 早期育种家们通过常规育种的办法,选育出一批抗白叶枯病的品种和材料.但该方法耗时耗力,对于多基因聚合和隐性基因的利用比较困难.随着白叶枯病抗性基因不断被鉴定和分子标记的开发,分子标记辅助选择已成为育种常规化的手段.利用紧密连锁的分子标记或功能标记来追踪抗性基因,可在早代选择并不受生理小种和环境的影响,提高育种效率.利用白叶枯病抗性单基因、多基因、以及其他优异基因的聚合一直被广泛应用于水稻的分子育种.Xa3和Xa4是最早使用的主要抗性基因,随着抗性被病原菌不断克服,xa5、Xa7、Xa21和Xa23等广谱抗性基因逐渐被应用到育种中,这几个基因也是目前抗白叶枯病分子育种中最常利用的基因.由于白叶枯病抗性基因之间存在互作性,不同抗性基因的组合能够增强对病原菌的抗性和拓宽抗谱,因此,白叶枯病抗性的聚合成为抗病品种培育的一个重要途径,常见的组合有Xa4/xa5、Xa4/Xa21、Xa7/Xa21、Xa21/Xa23、Xa4/Xa21/Xa27、xa5/xa13/Xa21、Xa4/xa5/xa13/Xa21等.Huang等[49]将4个白叶枯病抗性基因Xa7、Xa21、Xa22和Xa23聚合到华恢1035,后代材料对我国11个代表性的白叶枯病菌表现出不同程度的抗性水平.此外,在分子育种过程中,往往需要同时兼顾选择其他优良性状相关基因,例如其他抗病虫害基因、优良米质基因和杂交水稻相关的育性基因等.Kumar等[50]通过回交育种,将白叶枯病抗性基因Xa21和稻瘟病抗性基因Pi54聚合到恢复系RPHR- 1005,获得抗白叶枯病和稻瘟病的后代材料.Xu等[51]以水稻品种Kitaake为背景,通过基因编辑技术(CRISPR/Cas9)对3个感病基因(OsSWEET11、OsSWEET13和OsSWEET14)的效应子结合元件(effector binding elements,EBEs)进行编辑修饰,创制了水稻白叶枯病广谱抗性的新种质.Zhou等[52]对隆科638S进行基因编辑,利用CRISPR/Cas9技术敲除了3个感病基因Bsr-d1、Pi21和ERF922,获得的新种质对白叶枯病和稻瘟病具有广谱抗性,其中Pi21或ERF922的敲除可以提高白叶枯病抗性.陈深等[53]研究分析华南水稻白叶枯病菌致病性,发现华南白叶枯病菌主要有IV、V和IX 3种致病型,其中,IV型菌是华南稻区过去的优势致病型,Xa4是其主要的抗性基因,而V型菌和IX型菌具有强毒性,对现在的主栽品种有极高的致病率.目前,V型菌已经演变为华南水稻优势致病菌系,毒性更强的IX型菌发展趋势很快,单个抗性基因或者专一抗性容易被克服,所以华南地区水稻抗白叶枯病育种可利用xa5、Xa7、Xa23和xa34(t)等广谱抗性基因或者多基因聚合,以确保持久稳定的抗性. ...
... (2)通过菌群结构的变化检测,合理使用和轮换抗性基因,有效控制病菌.例如陈深等[53]通过对华南地区水稻白叶枯病菌致病性分化检测与分析,发现较强毒性的V型菌已成为华南的主要菌系,同时毒性更强的优势小种R8和IX型菌的上升趋势较快,建议华南地区的白叶枯病抗性基因选用xa5、Xa7、Xa23和xa34(t)等基因. ...
Transcription activator-like type III effector AvrXa 27 depends on OsTFIIAgamma5 for the activation of Xa27 transcription in rice that triggers disease resistance to Xanthomonas oryzae pv.oryzae
1
2009
... (3)通过抗性基因的聚合来增强抗病性和拓宽抗谱.白叶枯病的特性符合基因对基因假说,水稻的抗性基因对应着非亲和小种中的无毒基因.当某个水稻品种存在多个抗性基因的聚合,其非亲和小种所对应的无毒基因同时发生突变的概率将大幅降低.但多基因的聚合并非一定能增强抗病能力,Gu等[54]发现,xa5使Xa27介导的Xoo抗性衰减;病原菌(Xoo strain PXO99)对Xa23的诱导表达在xa5纯合(TFIIAγ5V39E/ TFIIAγ5V39E)突变后丧失[55].因此,如何合理聚合和利用抗性基因是增强抗病能力的关键.此外,对抗性基因分子机制的深入研究,有利于从基因工程的角度对基因进行改造,通过基因编辑选育或者储备抗病材料. ...
A host basal transcription factor is a key component for infection of rice by TALE-carrying bacteria
1
2016
... (3)通过抗性基因的聚合来增强抗病性和拓宽抗谱.白叶枯病的特性符合基因对基因假说,水稻的抗性基因对应着非亲和小种中的无毒基因.当某个水稻品种存在多个抗性基因的聚合,其非亲和小种所对应的无毒基因同时发生突变的概率将大幅降低.但多基因的聚合并非一定能增强抗病能力,Gu等[54]发现,xa5使Xa27介导的Xoo抗性衰减;病原菌(Xoo strain PXO99)对Xa23的诱导表达在xa5纯合(TFIIAγ5V39E/ TFIIAγ5V39E)突变后丧失[55].因此,如何合理聚合和利用抗性基因是增强抗病能力的关键.此外,对抗性基因分子机制的深入研究,有利于从基因工程的角度对基因进行改造,通过基因编辑选育或者储备抗病材料. ...
水稻白叶枯病抗性基因和相关因子研究利用进展
1
2022
... (5)进行新抗性基因的挖掘和已定位抗性基因的克隆.在已报道的水稻白叶枯病抗性基因中,有超过1/3被定位于11号染色体,如 Xa3/Xa26、Xa4、Xa10和Xa21等.因此,可以推断水稻11号染色体上应该还有未发掘的抗性基因[56].目前,已克隆的白叶枯病抗性基因有17个,仅占已报道抗性基因总数的1/3,仍有大量抗性基因未被克隆利用.有些抗性基因由于定位区间过大、候选基因复杂,导致其较难克隆.对此,可结合多种技术手段来克隆目标基因,例如Xa7就是通过图位克隆与突变体筛选相结合克隆到的.随着测序技术的快速发展,多组学技术分析可应用于白叶枯病抗性基因的精细定位以及克隆.深入挖掘和利用抗性基因为解析水稻白叶枯抗病机制以及抗病品种的选育奠定了分子基础. ...