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作物杂志,2014, 第3期: 14–21

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大豆和拟南芥NFYB基因家族同义密码子使用偏好性的比较

李真, 李永光, 薄蕾, 等   

  • 发布日期:2018-08-25

  • Published:2018-08-25

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389

摘要： 运用CodonW软件对大豆核因子NFYB(nuclear transcription factor Y B-subunit)基因家族CDS序列(coding sequence)的密码子组成、密码子使用性各参数和同义密码子相对使用度进行计算和统计分析，并与模式植物拟南芥NFYB基因进行比较。结果表明，NFYB基因家族CDS序列GC含量及同义密码子第3位的碱基含量直接影响着密码子使用偏好性程度的大小，并影响基因的表达水平。大豆GmNFYB基因与拟南芥AtNFYB基因对密码子的使用存在差异，AtNFYB基因家族偏好使用以A,U结尾的密码子，GmNFYB家族各基因偏好使用以G,C结尾的密码子。大豆不同GmNFYB基因在密码子使用上也存在差异，可能与基因表达水平、蛋白质结构和功能等因素有关。

关键词: 大豆, 拟南芥, NFYB基因, 密码子偏好性

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