作物杂志,2019, 第1期: 2231 doi: 10.16035/j.issn.1001-7283.2019.01.004
所属专题: 其他作物
陈芳,徐世晓,李晓辉,刘超,周建飞,王袁,田培,杨铁钊
Fang Chen,Shixiao Xu,Xiaohui Li,Chao Liu,Jianfei Zhou,Yuan Wang,Pei Tian,Tiezhao Yang
摘要:
利用均匀分布于烟草24个连锁群上的48个SSR标记对80份烟草材料进行分析。结果显示,48个SSR标记共扩增出211个等位基因,平均每个标记4.396个,Shannon′s信息指数I为1.034,多态信息含量值为0.229~0.905,观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和Nei′s多样性指数(H)平均值分别为0.320、0.572、0.431。聚类结果表明,在遗传距离为0.68时可以将80份烟草种质分为2个类群。5个烟草居群间的遗传一致度在0.643~0.765范围内,遗传距离分布在0.268~0.442。筛选4对核心引物构建了不同烟草种质资源的数字指纹图谱, 可将这80份烟草种质资源全部区分开。本研究在分子水平上为筛选优质烟草种质资源、挖掘重要基因以及拓宽烟草育种遗传基础等工作提供科学依据。
[1] |
常爱霞, 贾兴华, 冯全福 , 等. 我国主要烤烟品种的亲源系谱分析及育种工作建议. 中国烟草科学, 2017(1):1-6.
doi: 10.3969/j.issn.1007-5119.2013.01.001 |
[2] | 王元英, 周健 . 中美主要烟草品种亲源分析与烟草育种. 中国烟草学报, 1995,2(1):11-22. |
[3] |
Bindler G, Van d H R,Gunduz I ,et al. A microsatellite marker based linkage map of tobacco. Theoretical & Applied Genetics, 2007,114(2):341-349.
doi: 10.1007/s00122-006-0437-5 pmid: 17115128 |
[4] | 刘纪麟 . 玉米育种学. 北京: 中国农业出版社, 2000: 143-175. |
[5] | 郑殿升, 杨庆文, 刘旭 . 中国作物种质资源多样性. 植物遗传资源学报, 2011,12(4):497-500,506. |
[6] |
Ren N, Timko M P . AFLP analysis of genetic polymorphism and evolutionary relationships among cultivated and wild Nicotiana species. Genome, 2001,44(4):559-571.
doi: 10.1139/g01-060 pmid: 11550889 |
[7] |
Julio E, Verrier J L, Borne F D D . Development of SCAR markers linked to three disease resistances based on AFLP within Nicotiana tabacum L. Theoretical & Applied Genetics, 2006,112(2):335-346.
doi: 10.1007/s00122-005-0132-y pmid: 16283232 |
[8] |
Deng S L, Huang Y L, He H H , et al. Genetic diversity of Aegiceras corniculatum (Myrsinaceae) revealed by amplified fragment length polymorphism (AFLP). Aquatic Botany, 2009,90(4):275-281.
doi: 10.1016/j.aquabot.2008.11.002 |
[9] |
Piano, L D, Abet M,Sorrentino C ,et al. Genetic variability in Nicotiana tabacum and Nicotiana species as revealed by RAPD markers:1. Development of the RAPD procedure. Beiträge Zur Tabakforschung, 2014,19(1):1-15.
doi: 10.2478/cttr-2013-0690 |
[10] |
Bai D, Reeleder R, Brandie J E . Identification of two RAPD markers tightly linked with the Nicotiana debneyi gene for resistance to black root rot of tobacco. Theoretical & Applied Genetics, 1995,91(8):1184-1189.
doi: 10.1007/BF00220927 pmid: 24170044 |
[11] |
祁建民, 梁景霞, 陈美霞 , 等. 应用ISSR与SRAP分析烟草种质资源遗传多样性及遗传演化关系. 作物学报, 2012,38(8):1425-1434.
doi: 10.3724/SP.J.1006.2012.01425 |
[12] | Denduang, Boripant J, Setaphan S ,et al. Determination of local tobacco cultivars using ISSR molecular marker. Chiang Mai Journal of Science, 2009,37(2):293-303. |
[13] |
Bindler G, Plieske J, Bakaher N , et al. A high density genetic map of tobacco (Nicotiana tabacum L.) obtained from large scale microsatellite marker development. Theoretical & Applied Genetics, 2011,123(2):219-230.
doi: 10.1007/s00122-011-1578-8 pmid: 21461649 |
[14] |
Moon H S, Nicholson J S, Lewis R S . Use of transferable Nicotiana tabacum L. microsatellite markers for investigating genetic diversity in the genus Nicotiana. Genome, 2008,51(8):547-559.
doi: 10.1200/JCO.2005.05.511 pmid: 18650945 |
[15] |
陈杰, 杨静, 陈建军 , 等. 烤烟种质资源形态学标记及SSR标记的多样性研究. 华南农业大学学报, 2017(4):450-457.
doi: 10.7671/j.issn.1001-411X.2013.04.002 |
[16] |
丁浩, 郑唐春, 梁德洋 , 等. 一种简易高效提取多种植物纯净DNA的方法. 植物研究, 2015,35(3):457-461.
doi: 10.7525/j.issn.1673-5102.2015.03.021 |
[17] | 童治军 . 烟草微卫星标记的开发与利用. 杭州:浙江大学, 2012. |
[18] | NY/T 1433-2007 Y/T 1433-2007. 水稻品种鉴定-DNA指纹方法. 北京: 中国标准出版社, 2007. |
[19] | NY/T 1432-2007 Y/T 1432-2007. 玉米品种鉴定-DNA指纹方法. 北京: 中国标准出版社, 2007. |
[20] |
宋海斌, 崔喜波, 马鸿艳 , 等. 基于SSR标记的甜瓜品种(系)DNA指纹图谱库的构建. 中国农业科学, 2012,45(13):2676-2689.
doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.13.012 |
[21] |
刘国祥, 邹昆晏, 任民 , 等. 33份晒烟种质资源SSR标记的指纹图谱构建. 中国烟草学报, 2017,23(5):57-64.
doi: 10.16472/j.chinatobacco.2017.125 |
[22] |
陈婷婷, 李显富, 贾春雷 , 等. 云烟87突变体新品系的特征特性及其DNA指纹图谱鉴定. 浙江大学学报(农业与生命科学版), 2016,42(2):179-189.
doi: 10.3785/j.issn.1008-9209.2015.05.041 |
[23] |
李显富, 陈婷婷, 安雪琴 , 等. 烤烟K326突变体新品系‘片片黄’的性状表现及其DNA指纹图谱构建. 西南农业学报, 2015,28(3):1300-1305.
doi: 10.16213/j.cnki.scjas.2015.03.071 |
[24] | 黄莉莎, 曹恒春, 王毅 , 等. 烟草主栽品种的SSR指纹图谱的构建及其应用. 山东农业大学学报(自然科学版), 2013,44(4):509-515. |
[25] |
徐军, 刘艳华, 任民 , 等. 普通烟草种质资源的SSR标记与指纹图谱分析. 中国烟草科学, 2011,32(2):62-65.
doi: 10.3969/j.issn.1007-5119.2011.02.014 |
[26] |
陈世军, 张明泽, 姚玉仙 , 等. 基于SSR标记的黔南茶树种质资源DNA指纹图谱构建. 植物遗传资源学报, 2017,18(1):106-111.
doi: 10.13430/j.cnki.jpgr.2017.01.013 |
[27] | 肖炳光, 卢江平, 卢秀萍 , 等. 烤烟品种的RAPD分析. 中国烟草学报, 2000,6(2):10-15. |
[28] |
杨柳, 汪斌, 童治军 , 等. 25份普通烟草种质资源遗传多样性的SSR标记分析. 福建农林大学学报(自然科学版), 2013,42(2):171-175.
doi: 10.3969/j.issn.1671-5470.2013.02.012 |
[29] |
杨本超, 肖炳光, 陈学军 , 等. 基于ISSR标记的烤烟种质遗传多样性研究. 遗传, 2005,27(5):753-758.
doi: 10.3321/j.issn:0253-9772.2005.05.013 |
[1] | 林春雨,梁晓宇,赵慧艳,王洋. 黑龙江省主栽大豆品种遗传多样性和群体结构分析[J]. 作物杂志, 2019, (2): 7883 |
[2] | 耿歆淇,杨惠娟,秦艳青,杨兴有,赵世民,史宏志. 基于不同烟草类型基因组重测序的烟草SSR标记的开发和应用[J]. 作物杂志, 2019, (2): 8489 |
[3] | 闫晶,姬文秀,石贤吉,朱诗苗,李虎林. 镉胁迫对烟草种子萌发和烟苗生长发育的影响[J]. 作物杂志, 2019, (2): 142149 |
[4] | 何俊平,张书芬,王建平,蔡东芳,曹金华,文雁成,胡坤,赵磊,王东国,朱家成. 甘蓝型双低油菜杂交种丰油10号纯度的SSR鉴定[J]. 作物杂志, 2019, (1): 7580 |
[5] | 萨如拉,宋晓玲,赵小庆,石松利,白迎春,王艳芳,张玺蕊. 亚麻木酚素含量与遗传多样性的评价[J]. 作物杂志, 2019, (1): 5662 |
[6] | 王宁,张静,黄进勇,史团省,杜建,岳彩鹏. 外源过氧化氢对烟草花芽分化的影响初探[J]. 作物杂志, 2018, (6): 116123 |
[7] | 黎裕, 王天宇. 美国植物种质资源保护与研究利用[J]. 作物杂志, 2018, (6): 19 |
[8] | 梅日·阿黑哈提,吾买尔夏提·塔汉,艾尔肯·艾林别克,王玉祥. 新疆及周边地区糜子种质资源表型多样性分析[J]. 作物杂志, 2018, (6): 4852 |
[9] | 伊六喜,斯钦巴特尔,高凤云,周宇,贾霄云,陈明哲,张辉,贾海滨. 内蒙古胡麻地方品种资源遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2018, (6): 5357 |
[10] | 马孟莉,郑云,周晓梅,张婷婷,张晓倩,卢丙越. 云南哈尼梯田红米地方品种遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2018, (5): 2126 |
[11] | 唐丽媛,李兴河,张素君,王海涛,刘存敬,张香云,张建宏. 陆地棉光合相关性状的QTL定位分析[J]. 作物杂志, 2018, (5): 8590 |
[12] | 王袁,郭泽,李晓辉,徐世晓,邢学霞,张思琦,何佳,刘超,陈芳,杨铁钊. 不同温度条件下根结线虫侵染对烟草根系的影响[J]. 作物杂志, 2018, (4): 161166 |
[13] | 张凯伦,陈寿明,殷红,李斌,谢良文,贺帆. 外源一氧化氮对盐胁迫下烟草幼苗生理及抗氧化性的影响[J]. 作物杂志, 2018, (3): 123128 |
[14] | 田荟遥,蒋继志,李成斌,申芬,侯宁. 中国东北地区马铃薯致病疫霉遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2018, (3): 168173 |
[15] | 李锐,白建荣,王秀红,张丛卓,张效梅,闫蕾,杨瑞娟. 144份甜玉米群体的遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2018, (2): 1724 |
|