作物杂志,2022, 第3期: 7379 doi: 10.16035/j.issn.1001-7283.2022.03.010
杨晓琳1(), 段迎1, 蔡苏云1, 贺润丽1(), 尹桂芳2, 王艳青2, 卢文洁2, 孙道旺2, 王莉花2()
Yang Xiaolin1(), Duan Ying1, Cai Suyun1, He Runli1(), Yin Guifang2, Wang Yanqing2, Lu Wenjie2, Sun Daowang2, Wang Lihua2()
摘要:
利用RT-PCR技术从苦荞中克隆出2条漆酶(laccase)基因,运用生物信息学技术对2个基因序列进行分析,预测结构域、二级和三级蛋白结构,进行蛋白同源比对及进化树分析。结果表明,FtLAC-1基因序列开放阅读框为1695bp,编码564个氨基酸,FtLAC-2基因序列开放阅读框为1707bp,编码568个氨基酸。FtLAC-1和FtLAC-2蛋白预测分子量分别为61.41和62.47kDa,理论等电点分别为9.45和9.41,为亲水性蛋白,2个基因序列相似性较低,氨基酸序列同源性不高。qRT-PCR分析出其在苦荞不同组织器官存在差异性表达。结论为进一步探索FtLAC-1和FtLAC-2在苦荞薄果壳形成中的功能提供理论基础。
[1] | 陈庆富. 荞麦属植物科学. 北京: 科学出版社, 2012. |
[2] | 陈曦. 苦荞功能成分研究文献综述. 食品安全导刊, 2018, 33(11):162. |
[3] | 朱云辉, 郭元新. 我国苦荞资源的开发利用研究进展. 食品工业科技, 2014, 35(24):360-365. |
[4] | 张余, 黄小燕, 昌敏, 等. 苦荞营养保健成分及其食品开发研究进展与展望. 粮食与油脂, 2019, 32(8):12-14. |
[5] | 陈庆富, 陈其饺, 石桃雄, 等. 苦荞厚果壳性状的遗传及其与产量因素的相关性研究. 作物杂志, 2015(2):27-31,2. |
[6] |
张盛春, 鞠常亮, 王小菁. 拟南芥漆酶基因AtLAC4参与生长及非生物胁迫响应. 植物学报, 2012, 47(4):357-365.
doi: 10.3724/SP.J.1259.2012.00357 |
[7] |
Turlapati P V, Kim K W, Davin L B, et al. The laccase multigene family in Arabidopsis thaliana:towards addressing the mystery of their gene function(s). Planta, 2011, 233(3):439-470.
doi: 10.1007/s00425-010-1298-3 |
[8] |
Schuetz M, Benske A, Smith R A, et al. Laccases direct lignification in the discrete secondary cell wall domains of protoxylem. Plant Physiology, 2014, 166(2):798-807.
doi: 10.1104/pp.114.245597 |
[9] | 冯鹤翔, 涂轶. 木质素生物合成的研究. 青岛大学学报(自然科学版), 2018, 31(1):46-54. |
[10] |
Vanholme R, Morreel K, Darrah C, et al. Metabolic engineering of novel lignin in biomass crops. New Phytologist, 2012, 196(4):978-1000.
doi: 10.1111/j.1469-8137.2012.04337.x pmid: 23035778 |
[11] | Ranocha P, Chabannes M, Chamayou S, et al. Laccase down-regulation causes alterations in phenolic metabolism and cell wall structure in poplar. Journal of Plant Physiology, 2002, 129(1):145-155. |
[12] | 吴朝昕. 薄壳苦荞果壳结构及其发育中的转录组学分析. 贵阳:贵州师范大学, 2020. |
[13] | 罗冬梅, 赵亚文, 荆永琳, 等. 牛大力漆酶基因CsLAC17的克隆与载体构建. 分子植物育种, 2019, 17(6):1906-1912. |
[14] | 艾嘉, 刘坤, 张蕾, 等. 细菌漆酶的生物信息学分析. 基因组学与应用生物学, 2019, 38(3):1070-1078. |
[15] | 乔永刚, 贾孟君, 陈亮, 等. 忍冬ICE1基因的cDNA克隆及表达分析. 植物生理学报, 2019, 55(11):1647-1654. |
[16] | 邹春虹. 苦荞营养保健成分及其食品开发分析. 食品界, 2020(8):121. |
[17] | 李利超, 孙化雨, 娄永峰, 等. 毛竹漆酶基因PeLAC的克隆与表达分析. 植物科学学报, 2017, 35(2):252-259. |
[18] | 陈亮. 丹参漆酶基因的克隆表达和功能研究. 福州:福建中医药大学, 2017. |
[19] | 高敏霞, 冯新, 赖瑞联, 等. 米良1号猕猴桃漆酶基因的克隆与表达分析. 农业生物技术学报, 2018, 26(1):64-76. |
[20] | 刘月, 杨健, 王龙, 等. 木质素合成途径及其调控梨褐皮性状研究进展. 果树学报, 2018, 35(增1):17-25. |
[21] | 汤崴, 王洁, 张文颖, 等. 木质素在果树果核退化的作用. 分子植物育种, 2018, 16(11):3752-3762. |
[22] | 王文然, 王晨, 解振强, 等. VvmiR397a及其靶基因VvLACs在葡萄果实发育中的作用分析. 园艺学报, 2018, 45(8):1441-1455. |
[23] | 帅良, 赵昱清, 廖玲燕, 等. 龙眼漆酶基因(DlLac)的克隆及表达分析. 食品工业科技, 2017, 38(13):95-100. |
[24] | 薛辉. 软籽石榴种子硬度的影响因素及转录组分析. 北京: 中国农业科学院, 2016. |
[25] | 谢小波, 黄云, 田胜平, 等. 软籽石榴种子硬度发育与种皮细胞壁显微结构的关系研究. 园艺学报, 2017, 44(6):1174-1180. |
[1] | 周菲. 向日葵HaLACS7基因的生物信息学和表达分析[J]. 作物杂志, 2022, (3): 104108 |
[2] | 施娴, 李洪有, 卢丙越, 周云, 赵继菊, 赵孟丽, 梁京, 孟衡玲. 3个苦荞品种对盐胁迫的生理响应及耐受性评价[J]. 作物杂志, 2022, (3): 149154 |
[3] | 卢平, 康庆芳, 赵孟瑶, 张凤洁, 武强强, 马芳芳, 王宇珅, 韩渊怀, 王兴春, 李雪垠. 谷子miR169家族及其靶基因的鉴定与功能分析[J]. 作物杂志, 2022, (2): 5463 |
[4] | 尹桂芳, 段迎, 杨晓琳, 蔡苏云, 王艳青, 卢文洁, 孙道旺, 贺润丽, 王莉花. 苦荞FtC4H基因克隆与生物信息学分析[J]. 作物杂志, 2022, (1): 7783 |
[5] | 宋坤锋, 郝风声, 姚欣, 王静, 刘卫群. 烟草Nt14-3-3-like C基因的克隆与功能分析[J]. 作物杂志, 2021, (5): 613 |
[6] | 翁文凤, 伍小方, 张凯旋, 唐宇, 江燕, 阮景军, 周美亮. 过表达FtbZIP5提高苦荞毛状根黄酮积累及其耐盐性[J]. 作物杂志, 2021, (4): 19 |
[7] | 贾瑞玲, 赵小琴, 南铭, 陈富, 刘彦明, 魏立平, 刘军秀, 马宁. 64份苦荞种质资源农艺性状遗传多样性分析与综合评价[J]. 作物杂志, 2021, (3): 1927 |
[8] | 靳建刚, 田再芳. 山西北部地区引种苦荞品种的灰色关联度分析[J]. 作物杂志, 2021, (2): 5256 |
[9] | 刘晓丽, 韩利涛, 魏楠, 申飞, 蔡一林. 玉米ZmGS5基因克隆、分子特性分析及对拟南芥的遗传转化[J]. 作物杂志, 2021, (1): 1625 |
[10] | 马名川, 刘龙龙, 刘璋, 周建萍, 南成虎, 张丽君. 苦荞全基因组SSR位点特征分析与分子标记开发[J]. 作物杂志, 2021, (1): 3846 |
[11] | 王志龙, 薛应红, 郝月茹, 刘宝玲, 苑丽霞, 薛金爱, 李润植. 亚麻荠油脂相关转录因子CsLEC2基因家族的鉴定及表达分析[J]. 作物杂志, 2020, (5): 2332 |
[12] | 卢晓玲, 何铭, 张凯旋, 廖志勇, 周美亮. 苦荞鼠李糖基转移酶FtF3GT1基因的克隆与转化毛状根研究[J]. 作物杂志, 2020, (5): 3340 |
[13] | 杨学乐, 张璐, 李志清, 何录秋. 苦荞种质资源表型性状的遗传多样性分析[J]. 作物杂志, 2020, (5): 5358 |
[14] | 徐园园, 赵鹏, 洪权春, 朱晓琴, 裴冬丽. 小麦转录因子基因TaMYB70的分离和表达分析[J]. 作物杂志, 2020, (4): 8490 |
[15] | 李春花, 黄金亮, 尹桂芳, 王艳青, 卢文洁, 孙道旺, 王春龙, 郭来春, 洪波, 任长忠, 王莉花. 苦荞粒形相关性状的遗传分析[J]. 作物杂志, 2020, (3): 4246 |
|