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作物杂志,2019, 第2期: 78–83 doi: 10.16035/j.issn.1001-7283.2019.02.011

所属专题： 油料作物

• 遗传育种·种质资源·生物技术 • 上一篇    下一篇

黑龙江省主栽大豆品种遗传多样性和群体结构分析

林春雨,梁晓宇,赵慧艳,王洋   

  1. 黑龙江大学农业资源与环境学院,150080,黑龙江哈尔滨
  • 收稿日期:2018-12-24 修回日期:2019-02-11 出版日期:2019-04-15 发布日期:2019-04-12
  • 通讯作者: 王洋
  • 基金资助:
    农业部作物种质资源保护“主要作物抗病虫、抗逆和品质性状鉴定评价”(2018NWB036-12)

Analysis of Genetic Diversity and Population Structure of Main Soybean Varieties in Heilongjiang Province

Chunyu Lin,Xiaoyu Liang,Huiyan Zhao,Yang Wang   

  1. Department of Agricultural Resource and Environment, Heilongjiang University, Harbin 150008, Heilongjiang, China
  • Received:2018-12-24 Revised:2019-02-11 Online:2019-04-15 Published:2019-04-12
  • Contact: Yang Wang

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10

PDF (PC)

351

摘要：

利用187对SSR标记对近25年（1992-2017）在黑龙江省栽培的202个大豆品种进行遗传多样性和群体结构分析。结果表明,从试验材料的基因组DNA中扩增出多态性位点808个,平均每对引物扩增出多态性位点4.42个;多态性位点最多的引物是satt703和satt311,均为10个;等位变异频率最高的引物是satt417和satt575,等位变异频率均为99.5%。供试品种间的遗传相似系数为0.283~0.930,平均值为0.519。同一个育种单位育成的部分品种具有较高的遗传相似性。群体结构、主坐标分析和NJ聚类将202个品种划分的结果是一致的,均为3个类群。类群中的部分材料血缘不是独立的,而是相互渗透的。

关键词: 大豆, 黑龙江, 遗传多样性, 群体结构, SSR标记

Abstract:

In this study, 187 pairs of SSR markers were used to analyze the genetic diversity and population structure of 202 soybean cultivars planted in Heilongjiang Province in the past 25 years (1992-2017). A total of 808 polymorphic loci were produced from the genomic DNA of the varieties tested, and the average number of polymorphic loci was 4.42. Both satt703 and satt311 had the most polymorphic loci (10). Satt417 and satt575 had the most allelic variation frequency (99.5%). The genetic similarity coefficient of the varieties tested ranged from 0.283 to 0.930 with an average of 0.519. Some varieties bred by the same breeding unit had higher genetic similarity. 202 varieties were divided into three groups by population structure analysis, principal coordinate analysis (PCoA) and NJ clustering. The source of some of the materials in the group was not independent but interpenetrating.

Key words: Soybean, Heilongjiang, Genetic diversity, Population structure, SSR marker

表1

供试材料育成单位及编号"

类型Type 育成单位Breeding unit 编号-材料Code-material
A

 东北农业大学大豆研究所

 1-东农24,2-东农36,3-东农38,4-东农42,5-东农43,6-东农47,7-东农48,8-东农49,9-东农50,10-东农51,11-东农52,12-东农53,13-东农54,14-东农55,15-东农56,16-东农57,17-东农5号,18-东农67
B 中国科学院东北地理与农业生态研究所 19-东升1,20-东升3号,21-东升9,22-东生7,23-东生8
C 黑龙江省农业科学院克山分院 24-丰收06,25-丰收11,26-丰收20,27-丰收24,28-丰收25
D








 黑龙江省农业科学院佳木斯分院








 29-合丰1,30-合丰14,31-合丰16,32-合丰23,33-合丰24,34-合丰25,35-合丰26,36-合丰28,37-合丰29,38-合丰32,39-合丰34,40-合丰36,41-合丰37,42-合丰38,43-合丰39,44-合丰41,45-合丰42,46-合丰43,47-合丰44,48-合丰46,49-合丰47,50-合丰48,51-合丰50,52-合丰51,53-合丰52,54-合丰53,55-合丰54,56-合丰55,57-合丰56,58-合农59,59-合农60,60-合农61,61-合农64,62合农65,63-合农66,64-合农68,65-合农75,66-合农76,67-合丰05,68-合丰06,69-合丰22,70-合丰30,71-合丰35,72-合丰40,73-合丰45,74-合丰57,75-合丰58,76-合丰60,77-合丰61,78-合丰62,79-合农62,80-合农63,81-合农67,82-合农69,83-合农70
E



 黑龙江省农业科学院黑河分院



 84-黑河35,85-金源55,86-黑河10,87-黑河11,88-黑河12,89-黑河14,90-黑河15,91-黑河16,92-黑河18,93-黑河19,94-黑河20,95-黑河21,96-黑河22,97-黑河23,98-黑河24,99-黑河25,100-黑河26,101-黑河33,102-黑河39,103-黑河43,104-黑河44,105-黑河46,106-黑河49,107-黑河50,108-黑河51,109-黑河52,110-黑河53,111-黑河56
F



 黑龙江省农业科学院大豆研究所



 112-黑农37,113-黑农40,114-黑农44,115-黑农48,116-黑农51,117-黑农52,118-黑农58,119-黑农60,120-黑农61,121-黑农62,122-黑农64,123-黑农65,124-黑农66,125-黑农68,126-黑农71,127-黑农83,128-龙豆1号,129-黑农69,130-黑农84,131-黑农85,132-哈05-5675,133-哈06-1939
G
 黑龙江省农业科学院绥化分院
 134-绥农22,135-绥农24,136-绥农26,137-绥农04,138-绥农25,139-绥农31,140-绥农35,141-绥农36,142-绥农38,143-绥农40,144-绥农41
H




 农垦地区育种单位




 145-北豆14,146-北豆5号,147-垦豆18,148-垦豆3,149-垦豆40,150-垦豆41,151-垦豆43,152-垦丰14,153-垦丰16,154-垦丰17,155-垦丰20,156-垦丰22,157-垦丰23,158-垦鉴27,159-垦鉴43,160-垦农23,161-垦农26,162-垦农28,163-北豆10,164-北豆19,165-北豆21,166-北豆22,167-北豆34,168-北豆41,169-北豆42,170-北豆47,171-北豆49,172-北丰11,173-北丰14,174-宝农1,175-垦豆25,176-垦豆38
I
 黑龙江省其他育种单位
 177-北疆2号,178-北疆九1,179-华疆2,180-华疆4,181-嫩奥1,182-嫩奥3,183-绥杨1号,184-北疆1,185-育丰115,186-育丰20,187-哈北46-1
J

 黑龙江省外育种单位

 188-登科1,189-登科8,190-登科5,191-赤豆1,192-赤豆3,193-俄豆-1,194-吉育95,195-长密30,196-长农18,197-长农24,198-长农26,199-长农27,200-长农28,201-长农29,202-长农31

图1

基于K值的LnP(D)和ΔK趋势变化"

图2

202份大豆品种的群体结构"

图3

依据SSR标记对202个大豆品种进行主坐标分析的二维散点图 图中材料编号同表1,下同"

图4

依据SSR标记对202个大豆品种进行主坐标分析的三维散点图"

图5

202个大豆品种NJ聚类图"

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